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时间:2018-10-25
《原发性肝癌组织库及数据库建立》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、原发性肝癌组织库及数据库的建立目的:建立原发性肝癌组织库及数据库,通过对肝癌患者的血液、新鲜组织、病理蜡块等标本的收集、保存和研究,对其进行科学的管理和质量控制,为肝癌的基础和临床研究提供宝贵材料,并能为肿瘤患者的个性化治疗和随访提供帮助。材料:肿瘤患者血液样本及肿瘤标本。纳入标准:诊断为原发性肝癌或原发性肝癌转移的患者。患者对血液、样本采集均知情同意,符合医学伦理学标准。排除标准:其他肿瘤转移到肝脏上的患者予以排除。所需试剂及仪器:1.液氮罐2.-80℃超低温冰箱3.4~-20℃冰箱4.离心机我科均已配置采集
2、前准备:术前一天安排采集标本人员,填写肝癌标本临床资料表(对具有诊断意义的影像学资料进行照相留影存档),请患者或家属签署知情同意书,确认转移式液氮罐充满液氮,消毒灭菌两套手术标本采集器械(手术刀、手术剪、手术镊、不锈钢标尺、锡箔纸、冻存管)。手术当天携带冰盒、转移式液氮罐、标本采集器械、10%福尔马林溶液、照相机、标记好的冻存管(标本库专用标记码)、肝癌标本资料表等,提前入手术室准备好标本采集台,铺无菌手术巾,做好标本采集的准备。1.血清和血浆的采集及处理:患者按术前、术中、术后当天、术后1周等不同时间段取血,
3、每次采6mL1份3mLEDTA抗凝,采血后轻轻颠倒混匀3次静置,防止溶血1份3mL不抗凝,室温静置2h,2000r/min离心10min抗凝2h内分离血浆:2000r/min离心10min。每管100μL分装3mLN.S+3mL抗凝静脉血,再加等体积Ficoll分离液至液面上,2000r/min离心10min加样器吸取血清,每管100μL分装,作蛋白组学分析在界面白膜处吸取淋巴细胞,N.S漂洗3次,沉淀于冻存管上述标本编号、作好标记,在采血后3h内冻存在-80℃冰箱中1.组织标本的处理和保存:手术结束后在不影响
4、病理诊断取材需要的前提下采集组织样本。整个切取标本的过程应控制在20分钟内。用于提取RNA及蛋白的组织新鲜组织的采集及保存组织标本切成厚度小于0.5cm小块,放入灭菌的EP管中,迅速放入冰盒生理盐水冲洗2次,取肿瘤组织、癌旁组织(癌组织旁1cm)、正常组织(癌组织旁3~5cm以外或最远处)。将标本切成小块(0.5cm×0.5cm,厚度<0.5cm),用锡箔纸包好减少组织脱水,放入冻存管中(每管中放置2-3块),标记后放入液氮保存。冰盒EP管中的组织块利用RNAFast200和RIPA裂解液分别提取总RNA和蛋白
5、。石蜡固定标本的采集10%福尔马林固定,24小时后制石蜡标本块,存放于4℃冰箱。切片、染色。每例患者均保存2张H-E染色切片,明确病理诊断。标本的RNA行1%琼脂糖凝胶电泳。若A260/A280>1.6,28S和18S条带清晰明亮,且28S亮度强于18S,比值在2左右,则完整性良好。若比值<1,则RNA已降解。总蛋白测定浓度后加入5xloadingBuffer并在100℃煮5min变性后放入-20℃冰箱中保存。总RNA样本利用Fermentas反转录试剂盒逆转录成cDNA入-20℃冰箱保存剩余RNA样本-80℃
6、低温冰箱保存。1.标本的标记和储存3.1标本分装入冻存管。标记:冻存管编号、患者姓名、住院号、疾病种类、组织部位(或血清、血浆)、标本收集日期、标本入库日期。3.2冻存管编号由存放位置坐标确定。3.3数据库的管理。采用EXCEL软件。3.3.1患者信息录入:包括患者的姓名、性别、年龄、民族、职业、联系方式、随访时间、住院号(如多次住院则详细记录每次住院号)、临床诊断、病史摘要(主要记录有无肝炎、阳性家族史、黄疸、腹水、肝功Child分级等肝癌相关情况)、手术情况(包括手术方式、日期、术中探查所得重要信息、术中出
7、血量等)、病理诊断(病理号)。患者辅助检查信息:检查项目、检查日期、检查结果等。3.3.2标本信息录入:(A)病理信息:肿瘤体积、组织类型、分级、浸润深度、切缘情况、门脉及肝门淋巴结情况。(B)标本基本信息:入库编号、入库时间、入库类别、病变部位、标本描述(附照片)、标本采集时组织离体时间、收集人、保存方式、初步处理方式。(C)存放位置信息:存放位置坐标。3.3.3标本使用管理:包括使用登记、标本原始位置、使用单位、使用人、经手人等。3.3.4标本废除管理:包括废除登记、标本原始位置、废除日期、废除原因、审批人
8、等。标本库的系统管理:标本的采集、保存、使用实行专人管理。管理人员经过专业的培训后,应严格按照标本库制定的各项规章制度进行标准化管理。定期核对,随机取库存标本进行光镜检查、核酸抽提,了解保存质量。病历资料严格按照规范化录入,定期进行统计学的分析。注意事项:1.组织标本的离体时间对于标本的保存质量至关重要,应在切除后1h内取材。2.应尽量避免基因组DNA、RNA和蛋白的降解。特别注意在取
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