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时间:2018-10-11
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1、氯仿是分子量比较大的有机溶剂,在提取RNA时,氯仿可以有效的使有机相和无机相迅速分离。DNA提取过程有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和DNA脱离,DNA进入水相。但是在RNA的提取过程就要避免蛋白和DNA脱离,否则DNA会释放到水相。不管有酚也好,没有酚也好,氯仿本身也对蛋白有变性作用,剧烈的震荡,很容易使得DNA的亲水基团,与水相接触。所以不要剧烈震荡。异丙醇的作用是通过-OH的疏水作用使得RNA或者DNA链中的亲水基团受到保护,等同于沉淀,但是这是个反应时发生在水相中,与前面的氯仿不矛盾。氯仿的作用有多个方面,一
2、是作为有机溶剂变性蛋白,使其沉淀并通过离心除去,同时也通过变性作用抑制RNase活性;二是RNA提取试剂中通常含有苯酚(Trizol主要成分就是苯酚,很多自己配试剂提的方法也用苯酚,抽提蛋白时也会用到苯酚),苯酚微溶于水,抽提烷之后水相里有痕量的酚,如果不除去会损伤核酸,需要通过氯仿把水相里参与的苯酚抽提掉;三是作为溶剂抽提样品中的一些脂溶性杂质(比如油脂、脂溶性色素等),起到一定除杂作用。通常氯仿里面会加少量异戊醇(1/25),减少蛋白质在变性过程中由于震荡产生的泡沫,影响后续操作,不过个人经验感觉加不加没什么太大区别,也
3、许是我的样品里蛋白不多吧。异丙醇是沉淀核酸用的,作用和乙醇一样。只不过用量少一点,0.6V~1V就够了,不像乙醇沉淀需要至少2V,一般需要2.5倍体积。在水相很多,离心管容积有限,加不下太多乙醇的时候一般会用异丙醇沉淀。不过感觉效果不如乙醇,偶尔会有沉淀不出来东西的时候。Trizol法提RNA,加氯仿就是要剧烈手摇才行,这样才能彻底地两相混匀。而且DNA在水饱和酚的酸性条件下是会被留在有机相的,不会跑水相里头去。醇沉淀是很经常用的方法,因为RNA和某些杂质不溶于异丙醇,所以可以用来沉淀。l楼主问的问题,我的个人理解是:前面提
4、取的RNA经异丙醇沉淀后,总会含有一些未除去的蛋白和其它杂质分子,这些蛋白和杂质分子如果不除尽的话,就会直接影响所提取的RNA的纯度和稳定性。为此,就需要用70%乙醇洗涤沉淀(因为在70%乙醇里RNA是不溶的,而一些蛋白和其它杂质分子却可溶),并且最好是洗涤2次,然后高速离心后,倒去上清,即可得到较纯的RNA沉淀。用无水乙醇则达不到这个目的!。以下是我个人提取RNA时的操作总结,不正之处,请战友指正!1.1匀浆1)每个无菌的2ml圆底离心管中加入0.75mlTRIZOL试剂,每个大鼠的腺垂体从-80°C取出后立即于预冷的TR
5、IZOL试剂里用POLYTRON组织匀浆器(瑞士)进行匀浆。【注:1.匀浆液的量按每50-100mg组织加1mlTRIZOL,样品的体积不能超过匀浆液体积的10%。2.TRIZOL试剂用前应于4°C保存,操作时应带手套和口罩。3.匀浆器头用前需在3%H2O2(DEPCC水配)里浸泡,然后于0.1%DEPC水中空转2次,最后于TRIZOL试剂中空转2次,方可用于匀浆。4.匀浆时间不宜太长,转速不宜过大,刚开始时由慢到快至中档处,然后减速,重复1-2次,未见有组织碎块即可.5.如果样品数多的话,可先将TRIZOL试剂一并加好,然
6、后逐一加入样品匀浆。6. 特注:每加完一种试剂,都应及时盖上管盖,夹取管子或者打开管子时,尽可能不要碰到管的内缘。】。2)将匀浆样品置于15-30°C下静置5分钟,以使核酸蛋白复合物完全分离。如果所提取的组织中含有较多的蛋白、脂肪等,则应在匀浆结束后将匀浆液于4°C,12000g,离心10分钟,取上清用于以下操作。【注:如果此匀浆液暂时不用于实验,可于-80°C下保存至少1个月。】1.2RNA提取1)加0.15ml氯仿(每1ml匀浆液加0.2ml氯仿),盖好管盖,用手剧烈振荡15秒,于15-30°C下静置3分钟。【注:如果样
7、品数多的话,可先于一个无菌的离心管中倒入适量的氯仿,而勿需每次从大瓶子里吸取,这样可以减少污染,亦可加快速度】2)4°C,12000g,离心10分钟。3)小心吸出上层无色溶液(约为匀浆液体积的60%)于另一个1.5ml无RNAase的离心管中。【注:此步非常需要注意的是,在吸取上清时,切勿切勿将中间和底层的有机相吸出,宁愿少吸一点上清。同时,最好是用小枪头吸,这样就可以保证不吸到中间相】4)加无RNAase的糖原10μg(终浓度约为250μg/ml,最多不能大于4mg/ml),盖好管盖,充分振荡后,加入等体积的异丙醇(约40
8、0μl),室温静置10分钟。【注:1.糖原应不含RNAase,其作用是能够携带液相RNA溶液,有助于其沉淀。2.在4°C下静置容易使其它不重要的物质沉淀下来,所以最好在室温下静置。3.如果样品数多的话,可先于一个无菌的离心管中倒入适量的异丙醇,而勿需每次从大瓶子里吸取,这样可以减少污染,亦
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