蜡梅水通道蛋白基因(cpaqp)分子特征分析

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1、蜡梅水通道蛋白基因(CpAQP)分子特征分析及植物表达载体的构建张迷基金项目:重庆市教委科技项目(KJ060308)。作者简介:张迷,1984-,女,重庆城口人,硕士研究生,主要从事花卉遗传转化研究。通讯作者:李名扬,教授,博士生导师。,马婧,马鑫,胡雨晴,眭顺照,李名扬西南大学园艺园林学院,西南大学花卉研究所,重庆,400715摘要:在已构建的蜡梅花cDNA文库及EST分析的基础上,通过对文库cDNA克隆全长测序,得到了1个蜡梅水通道蛋白基因,命名为CpAQP(GenBank登录号为:GU433105)。cDNA全长1154bp,最大ORF810bp,编码269

2、个氨基酸。聚类分析和同源性比对表明,该蛋白基因属于TIPs亚族类,具有高度保守的MIP家族结构域。该蛋白具有6个跨膜结构,N-末端和C-末端都在细胞内。利用NetPhos2.0对CpAQP蛋白进行磷酸化位点预测,该蛋白C端丝氨酸磷酸化,可能在植物胁迫和亚细胞定位中起着重要作用。将该基因的cDNA编码序列连接到植物表达载体pCAMBIA2301g中,成功构建了CpAQP基因的植物表达载体pCAM-CpAQP,为进一步通过转基因技术研究该基因的功能奠定了基础。关键词:蜡梅;水通道蛋白;分子特征;植物表达载体水通道蛋白(Aquaporins,AQPs)又称水孔蛋白,是广

3、泛存在于原核和真核生物细胞膜上转运水的特异蛋白孔道[1]。植物水通道蛋白是一个超家族:到目前为止,在拟南芥、烟草、玉米等多种植物中都发现了AQPs并得到克隆,其中玉米中有36种,拟南芥中有35种[2-4],水稻中有33种[5]。根据氨基酸序列同源性和亚细胞定位将其划分为4种类型[6],质膜内在蛋白PIPs(plasmamembraneintrinsicproteins)、液泡膜内在蛋白TIPs(tonoplastintrinsicproteins)、根瘤菌周膜上的NOD26类似的内在蛋白NIPs(NOD26-likeintrinsicproteins)以及一类小分

4、子碱性内在蛋白SIPs(smallbasicintrinsicproteins)。水通道蛋白在水分调节以及各种生理反应,如气孔开关、器官运动、细胞生长和生物胁迫反应等方面起着重要作用[7]。蜡梅(Chimonanthuspraecox)是蜡梅科蜡梅属落叶丛生灌木,是一种具有耐寒、耐旱等多抗特性的物种。本实验从蜡梅花cDNA文库中随机测序克隆得到一个蜡梅水通道蛋白基因,命名为CpAQP,并对其进行了序列特征分析。通过分子克隆技术,构建了一个含CpAQP基因的植物表达载体pCAM-CpAQP,为进一步研究其蛋白功能奠定了基础。1.材料和方法1.1植物材料以磬口蜡梅花的

5、各个时期(蕾期、露瓣期、初开期、盛花期)为材料构建的混合cDNA文库,由本实验室构建、保存。1.2主要试剂TaqDNA聚合酶、各种限制性内切酶、MgCl2、dNTP、T4DNA连接酶等购自TaKaRa公司;MakerDL2000等试剂购自北京天为时代科技有限公司;质粒提取和胶回收试剂盒购自BioFlux公司;PCR引物合成及DNA测序由上海生物工程有限公司完成;氨苄青霉素(Ampicillin,Amp)和卡拉霉素(Kanamycin,Km)购自上海生物工程有限公司。1.3菌株与载体大肠杆菌(Escherichiacoli)菌株TOP10,根癌农杆菌(Agrobac

6、teriumtumefaciens)菌株LBA4404,植物表达载体pCAMBIA2301g(Km抗性)等均由本实验室保存。克隆载体pMD19-T购自7TaKaRa公司。1.4EST序列特征分析及蜡梅水通道蛋白cDNA序列的获得随机挑选文库克隆,提取质粒DNA,以5′pTriplEx2Sequenceprimer为测序引物,采用ABI3700DNA自动序列测定仪进行正向序列测定得到EST序列,然后运用DNAStar软件包的SeqMan进行EST聚类,运行BLASTX与nr库进行比对,获得目标克隆子(编号:CH346),再以SP5和T7为测序引物进行两次正反向序列测

7、定,得到1个蜡梅水通道蛋白cDNA序列。1.5CpAQP基因cDNA序列鉴定及生物信息学分析根据蜡梅水通道蛋白cDNA最大开放阅读框两侧序列设计特异引物:上游引物:5‘-TCTAGAATGCCCATTTCTCGGATTGCA-3’,添加XbaI酶切位点;下游引物:5‘-GAGCTCTCAAAGACAACAAAGATGCGC-3’,添加SacI酶切位点,下划线部分表示添加的酶切位点。以蜡梅DNA和cDNA为模板,建立25μlPCR反应体系,进行PCR扩增,扩增体系为:10×PCR缓冲液2.5μL,25mMMgCl22μL,2.5mMdNTP1.5μL,引物终浓度为1

8、0μmol

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