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时间:2018-09-30
《最详细crisprcas9系统原理应用及发展课件》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、CRISPR-Cas9系统基因修饰理论与实战1基因表达研究方法干扰基因表达(过表达或低表达),或者表达突变体并检测其相关生理功能,是基因功能研究中最重要的方式之一;基因表达技术-质粒转染,病毒转染等传统方法得到广泛运用,但同时其也存在缺点;1基因修饰的方法与各自优势质粒-瞬时转染-某些细胞效率偏低-表达结果不稳定,有内源表达的干扰;质粒-稳定细胞-表达结果不稳定,筛选效率不高,在重组插入基因组中可能干扰其它基因表达;病毒-瞬时感染-表达结果不稳定,质粒容易在细胞复制过程中丢失,随机插入基因组中可能会干扰其它基因表达;新一代的基因编辑技术-利用重组
2、酶在基因组水平修饰基因,产生的遗传性质稳定,直接作用于内源,减少表达干扰,目前有成熟的技术如CRISPR/Cas9;DNANHEJandHDRDNAsequencedisruptedNHEJ:Non-homologousendjoining+donorDNADNAsequencereplacedHDR:homologydirectedrepairDNA修复的机制与基因编辑原理非同源性末端接合修复机制(Non-homologousendjoining,NHEJ)同源介导的修复机制(Homology-directedrepair,HDR)5ZFNan
3、dTALENZFN与TALEN基因编辑原理6I:GenomemodificationII:GenomicdeletionLeC,FAnnR,DavidC,etal.2013,Science,(6121):819-823.GenomeEditinginMammalianCells1CRISPR-Cas概述CRISPR-Cas:一种来源是细菌获得性免疫的由RNA指导Cas蛋白对靶向基因进行修饰的技术。CRISPR-Cas主要由两部分组成:识别切割1CRISPR-Cas概述1.1CRISPR结构CRISPR:(clusteredregularlyint
4、erspacedshortpalindromicrepeats)CRISPR是一个特殊的DNA重复序列家族,广泛分布于细菌和古细菌基因组中。CRISPR位点通常由短的高度保守的重复序列(repeats)组成,重复序列的长度通常21~48bp,重复序列之间被26~72bp间隔序列(spacer)隔开。CRISPR就是通过这些间隔序列(space)与靶基因进行识别。1.1CRISPR结构1.2Cas家族Cas(CRISPRassociated):存在于CRISPR位点附近,是一种双链DNA核酸酶,能在guideRNA引导下对靶位点进行切割。它与fol
5、k酶功能类似,但是它并不需要形成二聚体才能发挥作用。2CRISPR-Cas系统的发现CRISPR-Cas是很多细菌和大部分古生菌的天然免疫系统,通过对入侵的病毒和核酸进行特异性的识别,利用Cas蛋白进行切割,从而达到对自身的免疫。2CRISPR-Cas系统的发现2CRISPR-Cas系统的发现2CRISPR-Cas系统的发现CRISPR-Cas系统赋予原核细胞针对外源DNA特异性免疫,而这种特异性是由间隔序列(spacer)决定的。在宿主防御噬菌体攻击中,针对自然界中庞大的噬菌体种群,细菌进化了CRISPR介导的适应性免疫。这种免疫功能的发挥是由
6、CRISPR间隔序列的动态性变化,即通过增加或删除间隔序列(spacer)来实现的。2CRISPR-Cas系统靶向要求最主要的要求:PAM(protospacer-adjacentmotif)为NGG。2CRISPR-Cas系统靶向要求在人类基因组中,平均每8bp就出现一个NGGPAM。2CRISPR-Cas系统靶向要求3CRISPR-Cas系统介导基因修饰3.1dual-RNA:Cas介导编辑模板替换2013年1月29日在《naturebiotechnology》上发表的《RNA-guidededitingofbacterialgenomesu
7、singCRISPR-Cassystems》一文中,作者利用CRISPR-Cas系统用设计好的DNA模板替换的相应基因来达到基因的定向修饰。3.1dual-RNA:Cas介导编辑模板替换3.2sg-RNA:Cas介导基因修饰2013年1月29日在《naturebiotechnology》上发表的《efficientgenomeeditinginzebrafishusingaCRISPR-Cassystem》一文中,作者利用人工合成的sgRNAs能指导Cas9内源性核酸酶对斑马鱼胚胎基因进行修饰。3.2sg-RNA:Cas介导基因修饰3.2sg-R
8、NA:Cas介导基因修饰3.2sg-RNA:Cas介导基因修饰Cas9sg-RNA2013年2月15日在《science》上发表的《Mu
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