水稻白叶枯病原菌遗传和致病型多样性分析

水稻白叶枯病原菌遗传和致病型多样性分析

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1、第26卷第2期华南农业大学学报Vol.26,No.22005年4月JournalofSouthChinaAgriculturalUniversityApr.2005水稻白叶枯病原菌遗传和致病型多样性分析姬广海,何月秋,张世光,钱君(云南农业大学云南省植物病理重点实验室,云南昆明650201)摘要:采用Rep2PCR分子指纹技术对国内已知致病型和云南省各水稻产区采集的56个白叶枯病代表菌株进行分析.用ERIC、J3等引物对其DNA进行Rep2PCR特异性扩增,扩增结果经综合聚类分析,在70%的相似水平上,可将测试菌株划分为10个组群,其中4、5、8、9、10为主

2、要组群;来自云南省的菌株分属于6个组群中,遗传分群与菌株的地理来源关系密切.根据菌株在已知抗性基因的近等基因系的反应,菌株可分为18个致病型,云南省的水稻白叶枯病菌株致病型复杂多样,远远高于国内其他省份测试的致病型.关键词:水稻白叶枯病;遗传多样性;致病型;Rep2PCR中图分类号:S4351111149文献标识码:A文章编号:1001-411X(2005)02-0026-05AnalysisofgenotypicandpathotypicdiversityinXanthomonasoryzaepv.oryzaebyRep2PCRJIGuang2hai,HEY

3、ue2qiu,ZHANGShi2guang,QIANJun(KeyLabforPlantPathologyofYunnanProvince,YunnanAgriculturalUniversity,Kunming650201,China)Abstract:Fifty2sixstrainsofXanthomonasoryzaepv.oryzae(Xoo)wereanalysedbyusingshortbacterialrepetitiveelements(REP,ERICandBOXprimers)andtherepetitiveDNAelementIS1113

4、fromX.oryzaepv.oryzae.DendrogramsweregeneratedfromthecombinationdatasetsofprimersERICandJ3byusingUPG2MAanalysis.TheresultsindicatedthatextensivegeneticvariabilityandgeneticdiversityexistedwithinthepopulationofX.oryzaepv.oryzaestrainstested.Allstrainscouldbedividedinto10groupsatlevel

5、of70%similarity.Group4,5,8,9and10werepredominant.StrainscollectedfromYunnanProvinceweredividedinto6groups,andeachgroupwaspartiallyassociatedwiththeregionaloriginofpathogenpopulation.Eigh2teenpathotypes(virulencephenotype)wereidentifiedbgusing16near2iso2genicricelines,eachcontaininga

6、singlegeneforresistance.ThepathotypediversityandcomplicityofstrainstestedfromYunnanProvincewerehigherthanthosefromotherprovincesinChina.TheresultswouldbefacilitatedforfurtherunderstandingofthepopulationstructureofX.oryzaepv.oryzaeinChina.Keywords:Xanthomonasoryzaepv.oryzae;geneticdi

7、versity;pathotype;Rep2PCR水稻白叶枯病Xanthomonasoryzaepv.oryzae是亚技术日趋成熟,Rep2PCR是基于基因组重复序列的一洲危害水稻生产的重要病害之一.水稻白叶枯病菌种DNA多态性,操作简便、重复性好,用于Rep2PCR是稻黄单胞菌X.oryzae种下的一个致病变种,了解指纹分析的重复序列主要有针对细菌基因组中广泛其群体遗传变异和致病小种的变化,是抗性基因品分布的短重复序列(REP、ERIC、BOX)和水稻白叶枯种选择和利用品种布局控制减轻病害的基础.病原病菌基因组中发现的插入因子(IS1113、IS1112),

8、此技菌群体遗传多态性和小种的变化原因主

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