病毒基因组及原核生物基因组 PPT课件

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1、反向重复序列（invertedrepeatsequence）由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列而成，重复单位长度约300bp，多数散在于基因组中，总长度约占人基因组的5％。1Aninvertedrepeat(orIR)isasequenceofnucleotidesfolloweddownstreambyitsreversecomplement. Theinterveningsequenceofnucleotidesbetweentheinitialsequenceandthereversecomplementcanb

2、eanylengthincludingzero.Whentheinterveninglengthiszero,thecompositesequenceisapalindromicsequence.The5base-pairsequenceontheleftis"repeated"and"inverted"toformsequenceontheright.2反向重复序列存在两种形式：A.两互补拷贝间无间隔序列如GGTACCCCATGGB.两互补拷贝间有间隔序列如GGTNNNNACCCCANNNNTGG电镜下，两种形式都呈十字形结构，有

3、间隔的反向重复序列，在十字型结构两头形成两个小环。作用：常见于基因组的调控区内，可能与复制和转录的调控有关。3病毒不具细胞结构，有遗传、复制等生命特征的微生物第一节病毒基因组4病毒基因组核酸的主要类型☆双链DNA多数动物病毒，如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒，环形、线形。☆单链DNA动物病毒中仅微小病毒为单链病毒；噬菌体中仅含单链DNA。RNA病毒基因组所携带的遗传信息一般在同一条链上，序列与mRNA相同的为正股（+），与mRNA互补的为负股（—）☆双链RNA以负链RNA为模板转录出mRNA如呼肠孤病毒及噬真菌体。☆单链负股RNA☆单链正

4、股RNA如逆转录病毒5病毒基因组的结构特点☆与细菌相比，病毒基因组很小，而且大小相差较大。☆可以由DNA组成，也可以由RNA组成，每种病毒颗粒中只含有一种核酸，或为DNA或为RNA，两者一般不共存于同一病毒颗粒中。☆基因重叠。☆大部分是用来编码蛋白质的，只有非常少的部分不被翻译。☆DNA序列中功能上相关的蛋白质的基因或rRNA的基因往往丛集在基因组的一个或几个特定的部位,形成一个功能单位或转录单元。☆噬菌体（细胞病毒）的基因是连续的；而真核细胞病毒的基因是不连续的，具有内含子。6λ噬菌体（研究得最为详尽的双链DNA噬菌体）48.5k

5、b，46基因，分5部分：头部、尾部、调控（免疫区）、复制和晚期调控区。7ФX174噬菌体（单链环状DNA）5.4kb，11个基因，3转录单位。☆重叠基因5.4kb1795氨基酸197kDa蛋白质实际上：263kDa蛋白质☆基因之间的间隔区很小如：H,A间隔63个核苷酸89SV40病毒基因组无包膜，直径45nm，双链环状DNA，DNA长5243bp。☆基因是不连续的☆两个区域，转录方向相反10第二节原核基因组Prokaryoticgenome以细菌为代表讲述，有称bacteriagenome。细菌对医学分子生物学有重要贡献，是基因工程

6、研究的主要材料之一。因为：1.构造相对简单，基因结构也不复杂，取材便利，易于培养，可选择突变株进行研究，实验结果容易重复。（如选择DDDPI缺乏的Ecoli突变株，Ecoli仍可合成DNA，说明DDDPI对EcoliDNA合成不起作用。）2.与人类有共同的分子生物学规律可循，如：（1）遗传物质都是DNA；（2）主要的功能分子都是蛋白质；（3）基因密码是通用的，等等。3.尤其是E.coli,是分子克隆是“明星“,基因工程的主要工程菌，因为基因工程的主要工作是克隆真核基因在原核系统中表达。11细菌属于原核型细胞的一种单胞生物,形体微小,

7、结构简单。无成形细胞核、也无核仁和核膜，沙门氏干菌,博德氏菌,梭狀干菌,大肠干菌;螺旋菌,葡萄球菌12含有3500个基因，已被定位的有900个左右。在这900个基因中，有260个基因已查明具有操纵子结构，定位于75个操纵子中。在已知的基因中8％的序列具有调控作用。大肠杆菌基因组13类核的结构14一、原核生物基因组结构与功能的特点1.基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。其DNA是与蛋白质结合，但并不形成染色体结构，只是习惯上将之称为染色体。细菌染色体DNA在胞内形成一个致密区域，即类核（nucleoid），类核无核膜将之与胞浆分

8、开。2.基因组中只有1个复制起点。3.具有操纵子结构。操纵子（operon）是指数个功能相关的结构基因串联在一起，构成信息区，连同其上游的调控区（包括启动和操纵区）及其下游的转录终止信号构成的基因表达单位。4.结构基因无重叠现象，基因