近年被破解晶体结构的十种酶

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1、1、λ-整合酶(λ-INT)在6月23日的《自然》杂志上,布朗大学和哈佛医学院研究人员组成的研究组破解了λ-整合酶(λ-INT)的晶体结构——这种蛋白在lambda病毒中负责DNA的修改。由于lambda是一种用于研究机动DNA的模型病毒,因此这些新发现非常重要。当lambda将它的DNA插入到大肠杆菌中时,λ-INT在这个过程中是重要的作用因子(好比做手术的医生)。这个过程包括在插入前逐渐剪断大肠杆菌DNA链,并在之后将它们缝合起来。这项研究还揭示出了三种辅助蛋白(就好比护士)在手术中复杂地折叠DNA链的方式。——生物秀旗下易生物网站http://www.eb

2、ioe.com/2、HIV整合酶HIV整合酶结构是20年来科学家未破解的秘密,一个来自哈佛大学和英国帝国学院的研究团队花费4年时间,做了40,000次实验终于破解HIV整合酶三维结构。他们选择了一种罕见的逆转录病毒PFV(prototypefoamyvirus),在实验室里制备出PFV整合酶高分辨率的结晶体,足够研究它的结构。PFV病毒与HIV病毒十分相似,因此整合酶结构也类似。为了研究整合酶结构,研究小组花费了4年时间,所做大大小小的实验有40,000多次,最终得到7个完整的晶体,而其中,只有1个适合进行三维结构分析。通过艰苦卓绝的实验,科学家们终识别的整合酶

3、的庐山真面目,这才发现,整合酶的三维结构与以往他们预测的是那么地不同,这也是为何那么多科学家通过预测的数据设计的整合酶抑制剂不发挥功效的原因。科学家们将立足于整合酶的三维结构,进一步研究这些酶的功能,并在此基础上设计抗整合酶的药物。——生物秀旗下生物通网站http://www.ebiotrade.com/3、维他命K环氧化物还原酶(VKOR)哺乳动物维他命K环氧化物还原酶(VKOR)催化对维他命K苯二酚的生成,这是维他命K循环中的决定性一步,是血液凝固所必需的。现在,VKOR的一个细菌同源分子的X-射线晶体结构已被确定。该结构所反映的VKOR存在于跟其氧化还原伙

4、伴(一个与硫氧还蛋白相似的区域)形成的一个复合物中,它相应于电子转移的抑制状态。这个发现为VKOR利用来自新合成的蛋白还原苯醌指出了一个可能的机制。这项工作可帮助解释VKOR发生的突变何以能够引起对“华法令”(或称“华法林”)的抵抗力,后者是通过抑制VKOR发挥作用的普遍使用的抗凝血剂。——生物秀旗下生物通网站http://www.ebiotrade.com/4、整合酶英国和美国研究人员在1月31日的《自然》杂志上报告说,他们合作进行的一项最新研究模拟出整合酶的三维结构。整合酶在包括艾滋病病毒等逆转录酶病毒中可以找到,并且充当了艾滋病病毒在人体内复制时的“帮凶”

5、。这项重大突破有助于科学家解决困扰了艾滋病研究领域长达20年的一个难题,从而找到更好的治疗艾滋病的方法。——人民网——byCKF,ZJUhttp://www.people.com.cn/5、核酶(ribozyme)核酶能够完成合成新RNA分子所需的基本反应,加州大学研究人员最近确立了核酶的三维结构,为探索生命起源过程中首个具有自我进化能力的分子提供了参考。Robertson和Scott所研究的这种核酶并非完全自我复制,但具有将两个RNA亚基键合起来的“连接酶”的功能。在德克萨斯大学生化学家AndrewEllington的实验室完成研究生论文时,Robertson

6、通过一种试管演变实验得到了这种连接酶核酶。以随机合成的RNA分子的混合物为起始点,选择目的特征,研究人员能够从中得到RNA酶。在Ellington实验室,Robertson得到连接酶核酶(L1连接酶),并确定了功能部分和非关键部分。到加州大学SantaCruz后,Robertson开始尝试制造核酶的晶体,以便利用X射线结晶学确定结构。使RNA分子结晶非常困难,通过摸索各种条件和更换这种核酶的形式,Robertson和Scott终于利用X射线结晶学,确立了该核酶的三维结构。该核酶有三个从中心发射出的茎干。发生连接反应的活性位点位于其中一个茎干上。结构图显示,分子的

7、另一茎干的一部分折叠在连接位点之上,形成一个发生反应的口袋。一个镁离子结合在一个茎上,落在口袋里,在反应中发挥重要作用。这种结构提示这种人工选择的核糖体的反应机制与天然酶的相似。——中国生物技术信息网http://biotech.org.cn/6、禽流感病毒聚合酶由中科院生物物理研究所刘迎芳研究员领导的研究组和饶子和院士领导的研究小组在揭示与流感病毒密切相关的蛋白质的三维结构方面取得突破性进展,他们在国际上率先揭示了流感病毒聚合酶关键部分PA亚基与PB1多肽复合体的精细三维结构。流感病毒基因组含有8个RNA片段,已知可以编码11种病毒蛋白质。其中,由PA,PB1

8、和PB23个亚基组成的聚

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