水葫芦内生细菌脂肪酸生物标记特性研究

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1、水葫芦内生细菌脂肪酸生物标记特性研究收稿日期：2009-05-23录用日期：2009-07-15基金项目：福建省发改委项目（闽发高技[2005]1061号）；省财政专项-福建省农业科学院科技创新团队建设基金(No.STIFY03)作者简介：蓝江林（1972─），副研究员，E-mail:lanfz2008@163.com；*通讯作者（Correspondingauthor），E-mail:fzliubo@163.com蓝江林，刘波*，朱育菁，林营志，葛慈斌，刘芸福建省农业科学院农业生物资源研究所，福州350003摘要：应用

2、基于微生物细胞脂肪酸成分鉴定的全自动微生物鉴定系统，鉴定水葫芦内生细菌25株，分属15个属。共检测到27个脂肪酸生物标记（PLFAs），这些生物标记分为4种类型，即（1）高频次分布：在25株细菌中出现13~22次，属于细菌总体类群(general)的生物标记。（2）中频次分布：在25株细菌中出现5~7次，可以用于代表细菌属类群(genus)识别生物标记。（3）低频次分布：在细菌中的分布概率较小，可以用于指示特定细菌种间差异的生物标记。（4）微频次分布：仅在一种细菌种类出现，是细菌种（species）特征生物标记。利用脂肪

3、酸生物标记分析同属细菌不同种的差异，可将微杆菌属分为2类，第1类包括菌株9Microbacteriumbarkeri和11Microbacteriumimperiale，这两个菌株17:0ISO和14:0ISO的脂肪酸生物标记含量均为0。第2类包括10Microbacteriumesteraromaticum、12Microbacteriumlacticum和13Microbacteriumliquefaciens，这3个菌株均含有17:0ISO脂肪酸生物标记而区别于第一类菌株。利用脂肪酸生物标记的差异对25株内生细菌进

4、行聚类分析，可将水葫芦内生细菌类群分为4类。不同植物内生菌群落中存在着特异的生物标记，利用特征脂肪酸生物标记的分析方法，分析水葫芦内生细菌的群体特性，对于植物内生菌微生物群落的研究具有重要意义。关键词：内生细菌；脂肪酸生物标记；聚类分析文章编号：中图分类号：X522文献标识码：ACharacteristicsofPLFABiomarkersfortheEndophyteBacteriainsideEichhorniacrassipe(Mart.)SolmsLANJiang-lin,LIUBo*,ZHUYu-jing,LI

5、NYing-zhi,GECi-bin,LIUYunAgriculturalBioresourceResearchInstitute,FujianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzhou350003Received23May2009accepted15July2009Abstract:ThepresentpaperdealtwithisolationandidentificationoftheendophytebacteriafromEichhorniacrassipe(Mart.)Solm

6、s.aswellascharacteristicsoftheirPLFAbiomarkers.Resultsshowedthat25speciesofendophytebacteriawereidentifiedbymeansofmicrobeidentificationsystem(MIDIsystemfromUSA).Therewere27PLFAbiomarkersdetectedin25speciesofendophytebacteria,inwhichbasedonthedistributionfrequenc

7、yinthebacteria4typeswereclusterede.g.(1)highfrequencyrelatedtocharacteristicsofmicrobeingeneral,(2)middlefrequencyrelatedtobacteriaingeneral,(3)lowfrequencyrelatedbacterialgenus,(4)tinyfrequencyrelatedtospecies.AccordingtoPLFAsbiomarkers,5speciesofgenusMicrobacte

8、riumweredividedinto2groups,thegroups1includedMicrobacteriumbarkeriandMicrobacteriumimperiale,therewerenobiomarkerof17:0ISOand14:0ISO.Thegroups2includedMicrobac