maldi_tof质谱技术及biotyper数据库在养殖场空气微生物鉴定中的应用

《maldi_tof质谱技术及biotyper数据库在养殖场空气微生物鉴定中的应用》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、中国兽医学报２０１４年１２月第３４卷第１２期ＣｈｉｎＪＶｅｔＳｃｉＤｅｃ．２０１４Ｖｏｌ．３４Ｎｏ．１２２０３１ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ质谱技术及Ｂｉｏｔｙｐｅｒ数据库在养殖场空气微生物鉴定中的应用李楠，刘文森，刘林娜，郝镯，李树民，孟轲音，何扬，万忠海，王承宇＊，李吉平＊（军事医学科学院军事兽医研究所／吉林省人兽共患病预防与控制重点实验室，吉林长春１３０１２２）摘要：以１６ＳｒＲＮＡ测序法为标准方法，利用ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ质谱技术及Ｂｉｏｔｙｐｅｒ数据库对某猪场２１０株空气分离株进行鉴定及准确率分析。结果显示

2、９１．０％的菌株被准确鉴定到种水平，９５．７％被准确鉴定到属水平。研究表明ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ质谱技术可以快速准确检测空气微生物，为养殖场环境质量监测提供了新的技术支持。关键词：空气微生物；ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ质谱技术；Ｂｉｏｔｙｐｅｒ数据库中图分类号：Ｓ８５２．６１文献标志码：Ａ文章编号：１００５－４５４５（２０１４）１２－２０３１－０４ＴｈｅａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆｔｈｅＭＡＬＤＩ－ＴＯＦＭＳａｎｄｂｉｏｔｙｐｅｒｄａｔａｂａｓｅｉｎｔｈｅｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｆａｒｍａｉｒｂｏｒｎｅｍｉｃｒｏ

3、ｏｒｇａｎｉｓｍｓＬＩＮａｎ，ＬＩＵＷｅｎ－ｓｅｎ，ＬＩＵＬｉｎ－ｎａ，ＨＡＯＺｈｕｏ，ＬＩＳｈｕ－ｍｉｎ，ＭＥＮＧＫｅ－ｙｉｎ，ＨＥＹａｎｇ，ＷＡＮＺｈｏｎｇ－ｈａｉ，ＷＡＮＧＣｈｅｎｇ－ｙｕ＊，ＬＩＪｉ－ｐｉｎｇ＊（ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＪｉｌｉｎＰｒｏｖｉｎｃｅｆｏｒＺｏｏｎｏｓｉｓＰｒｅｖｅｎｔｉｏｎａｎｄＣｏｎｔｒｏｌ，ＭｉｌｉｔａｒｙＶｅｔｅｒｉｎａｒｙＲｅｓｅａｒｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅ，ＡｃａｄｅｍｙｏｆＭｉｌｉｔａｒｙＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ１３０１２２，Ｃ

4、ｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ａｔｏｔａｌｏｆ２１０ａｉｒｂｏｒｎｅｂａｃｔｅｒｉａｌｃｏｌｏｎｉｅｓｗｅｒｅｃｏｌｌｅｃｔｅｄｆｒｏｍａｓｗｉｎｅｈｏｕｓｅ，ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦＭＳ－ｂａｓｅｄＢｉｏｔｙｐｅｒｄａｔａｂａｓｅｗｅｒｅｕｓｄｅｄｔｏｉｄｅｎｔｉｆｙａｎｄｅｖａｌｕａｔｅｄｆｏｒａｃｃｕｒａｃｙ，１６ＳｒＲＮＡｇｅｎｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｗａｓｓｅｒｖｅｄａｓｔｈｅｒｅｆｅｒｅｎｃｅｍｅｔｈｏｄ．Ｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔ９１．０％ａｎｄ９５．７％ｏｆｔｈｅｉｓｏｌａｔｅｓｗｅｒｅ

5、ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄｃｏｒｒｅｃｔｌｙｔｏｔｈｅｓｐｅｃｉｅｓｌｅｖｅｌａｎｄｇｅｎｕｓｌｅｖｅｌ，ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．ＩｔｉｎｄｉｃａｔｅｓｔｈａｔＭＡＬＤＩ－ＴＯＦＭＳｃａｎｄｅｔｅｃｔａｉｒｂｏｒｎｅｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓｒａｐｉｄｌｙａｎｄａｃｃｕｒａｔｅｌｙ，ｗｈｉｃｈｏｆｆｅｒｅｓａｎｅｗｔｅｃｈｎｉｃａｌｓｕｐｐｏｒｔｆｏｒｆａｒｍｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｑｕａｌｉｔｙｍｏｎｉｔｏｒｉｎｇ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ａｉｒｂｏｒｎｅｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ；ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦＭＳｔｅｃｈ

6、ｎｉｑｕｅ；ｂｉｏｔｙｐｅｒｄａｔａｂａｓｅ＊Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ，Ｅ－ｍａｉｌ：ｊｉｐｉｎｇｌｉ１９６４＠１２６．ｃｏｍ；１７３３０６５４１＠ｑｑ．ｃｏｍ近年来随着集约化、规模化畜禽产业的发展，动物养殖密度增高，饲养空间相对狭窄，致使由动物活动、粪便、毛皮、饲料产生的各类微生物（如禽流感、鸡新城疫病毒、ＳＡＲＳ病毒、结核分枝杆菌等）在空气中聚集并迅速传播，不仅造成环境污染，而且严重危害了动物和饲养人员的身体健康，甚至可引起某些传染病的暴发流行［１］。因此研究空气中微生物的种类对养殖环境的

7、监测具有重要意义，如何快速、准确地检测空气微生物则成为研究重点。目前空气微生物的检测方法主要基于形态学及生化反应，这些传统方法能将环境分离株鉴定到属水平，但对于种水平的鉴定缺乏准确性［２－４］。１６ＳｒＲＮＡ测序法是目前公认的“金标准”方法，但其昂贵的测序成本和繁琐的操作程序令许多实验室望而生畏，不利于微生物的快速检测。基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（ｍａｔｒｉｘ－ａｓｓｉｓｔｅｄｌａｓｅｒｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎｉｏｎｉｚａｔｉｏｎｔｉｍｅ－ｏｆ－ｆｌｉｇｈｔｍａｓｓｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ，ＭＡＬＤＩ－

8、ＴＯＦＭＳ）是２０世纪８０年代出现的生物质谱技术，该技术凭借其快速准确、操作简便、高通量等特点已广泛用于临床病原菌检测［５］。少数文献则报道了应用该技术检测空气来［６－７］，收稿日期：２０１４－０４－０３源的葡萄球菌属但对于空气中其它菌群的检测基金项目：吉林省科技发展计划资助项目（２０１３０１０１０９２ＪＣ）作者简介：李楠（１９８３－），女，博士。＊通讯作者，Ｅ－ｍａｉｌ：ｊｉｐｉｎｇｌｉ１９６４＠１２６．ｃ