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时间:2018-07-20
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1、分子生物学原理(最终回)Chapter1ProteinStructureandFunction复习题(1)1.名词解释(1)Peptides肽,由氨基酸脱水缩合形成的两性有机化合物,相对分子量小于6000(2)Simpleproteins简单蛋白,仅由氨基酸组成,不含蛋白辅助因子等非氨基酸成份的蛋白为简单蛋白。(3)Conjugatedproteins缀合蛋白,除了蛋白组分外还含有蛋白辅助因子等非氨基酸成份(如辅酶、辅基和金属离子等)的蛋白为缀合蛋白。(4)Coenzyme辅酶,是一种蛋白辅助因子,为非氨基酸成份,通
2、过非共价键与链相连,可以用透析、超滤的方法将其除去。(5)Prostheticgroup辅基,是一种蛋白辅助因子,为非氨基酸成份,通过共价键与多肽链相连,不易与多肽链分离。(6)Configuration构型,有机分子的空间排列,不同的排列彼此作为参照,具有双键和手性中心两个特征,它们之间的转化需要破坏共价键。(7)Conformation构象,取代基团的空间排列,由于键的自由旋转,在空间能形成不同位置,它们的转化可以通过单键的旋转来完成,故不需要破坏共价键。(8)Chiralcarbin手性碳原子,连接四个不同原子
3、或基团的碳原子叫做手性碳原子。(9)Enantiomers对映异构体,如两个分子互为镜像关系,则称这两个分子为对映异构体,对映异构体具有旋光性。(10)Opticalisomers光学异构体,L-和D-构型的异构体具有相同的熔点、溶解度等物理性质和相同的化学性质,但旋光方向相反,故称之为光学异构体(11)Cisandtransisomers正反异构体,取代基团在双键两侧的不同排列形成正反异构体。(12)Ampholytes两性电解质,既可以作为质子供体又可以作为质子受体的电解质。在偏中性的水溶液中,α-氨基酸的氨基(
4、-NH3+)可以起质子供体的作用,而羧基(-COO-)起质子受体的作用,所以氨基酸是两性电解质(13)Isoelectricpoint等电点,氨基酸的等电点。当溶液的PH达到某一特定值的时候,氨基酸所带正电荷刚好与负电荷相等,氨基酸分子对外不显电性,此时溶液的PH值。(14)Peptideplane在肽键中,由于共振现象,以致C-N之间具有部分双键的性质,不能自由旋转;而C=O之间具有部分单键的性质。于是,形成肽键的4个原子与其左右相邻的2个Cα原子处于同一个平面,这两个Cα反式排列,该平面叫做肽平面。(15)Dih
5、edralangle二面角,φ绕Cα-N及ψ绕Cα-C旋转的角分别为肽平面的两个二面角,它决定了肽链的主链构象。(16)Ramachandrandiagram拉氏构象图,Ramachandran根据蛋白质中非键合原子间的最小接触距离,确定了哪些成对二面角(φ、ψ)所规定的两个相邻肽单位的构象是允许的,那些是不允许的,并以φ为横坐标,以ψ为纵坐标,在坐标图上标出,该图即为拉氏构象图。(17)Primarystructureofproteins蛋白的初级结构,氨基酸的排列顺序即为蛋白的初级结构。(18)Secondary
6、structureofproteins蛋白的二级结构,它是指多肽链的局部构象,即局部骨架的折叠方式,蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链的主链骨架原子的相对空间位置,不涉及氨基酸侧链的构象。(19)Tertiarystructureofproteins蛋白的三级结构,是指整条多肽链的构象,包括所有原子的空间排列,一条完整多肽链全部氨基酸的相对空间位置,三级结构的形成和稳定主要靠共价键和次级键来维持。(20)Quaternarystructureofproteins蛋白的四级结构,它是指亚基间的相互作用,包
7、括亚基数目、种类、空间位置及相互作用,但不包括亚基本身的构象,维持四级结构的是次级键。(21)Coiledcoil卷曲螺旋,一种重要的模体,指两个或两个以上的α-helix靠疏水性相互作用相互缠绕形成的稳定超螺旋。(22)β-strand,β-barrel&β-saddleβ折叠链:多肽链骨架呈伸展状形成β折叠链;平行排列的β折叠片层具有自发的右手扭曲倾向,以减少构象的能量。由于存在自发扭曲和阻碍扭曲(氢键)两种力,如果平行的β折叠片段前后交错,则形成漏斗状的圆筒形(barrel);如果β折叠片段矩形排列,就形成马鞍
8、形(saddle)(23)β-turnβ转角,球状蛋白质的多肽链上出现180°的回折即为β转角,由四个氨基酸组成,氢键存在于第一个CO和第四个NH之间。一般为trans,但脯氨酸有6%的cis。(24)Disulfidebonds二硫键是多肽链中(或肽链间)的两个Cys残基侧链之间形成的共价键,可以将多肽链的不同部分(或不同的多肽链)连接起来。
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