附件：个体化医学检测微阵列基因芯片技术规范

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1、个体化医学检测微阵列基因芯片技术规范前言微阵列基因芯片是基于DNA分子杂交技术原理研制，通过探针结合碱基互补序列的单链核酸，从而确定其相应序列来识别基因或其产物。能够同时快速检测多个基因及其多个位点，在多态性分析、突变分析、基因表达谱测定及杂交测序等多领域具有广泛应用价值。临床诊断技术使用的微阵列基因芯片，可快速鉴定病原体、检测遗传突变及基因表达，更早更方便的检测肿瘤基因标志，检测药物反应和代谢相关基因多态性来指导临床个体化治疗。本规范旨在对个体化医学检测中采用微阵列基因芯片检测核酸序列以及基因表达进行一般性技术指导，不包括行政审批要求。本规范由全国生物芯片标准化技术委员会（

2、SAC/TC421）提出。本规范起草单位：全国生物芯片标准化技术委员会、清华大学医学院、生物芯片北京国家工程研究中心、北京博奥医学检验所。本规范起草人：项光新、李元源、王辉、邓涛、孙义民、张治位、张川、邢婉丽、程京。目录1.适用范围12.声明/警告13.术语和定义14.样本处理24.1样本类型24.2样本采集、运输与保存34.3样本质量保证34.4样本信息保存35.检测各步骤分述45.1核酸分离45.2核酸定量（如适用）45.3核酸扩增和标记45.4芯片杂交55.5信号采集和数据分析56.结果报告57.质量控制58.注意事项69.参考文献71.适用范围本规范适用于医疗机构开展

3、微阵列基因芯片个体化医学检测服务。检测服务需遵循国家卫生主管部门或各专业协会发布的疾病诊疗指南或国家卫生计生委医政医管局个体化医学检测技术专家委员会发布的个体化医学检测指南。2.声明/警告本规范所称微阵列基因芯片诊断技术是指从医疗机构获得的临床样本中，提取核酸（DNA或RNA），进行必要的扩增和标记，标记后的靶标与基因芯片进行分子杂交，通过基因芯片扫描仪器获得基因芯片杂交的图像与数据，经计算机程序分析，并给出检测报告的全过程。3.术语和定义（1）聚合酶链反应polymerasechainreaction（PCR）聚合酶链反应或多聚酶链反应是一种对特定的DNA或RNA片段在体外

4、进行快速扩增的方法。（2）杂交hybridization具有一定同源序列的两条核酸单链（DNA或RNA）可以通过氢键的方式，按碱基互补配对原则相结合。（3）突变mutation是细胞中DNA核苷酸序列发生了稳定的可遗传的改变。（4）点重复spotreplicates每种探针在芯片上每个阵列中的重复次数。7（5）探针probe能够与靶标特异性结合的分子，多数情况下探针固定在基片上。（6）质控探针qualitycontrolprobe用来监控芯片表面化学修饰、样品制备和反应过程等环节的质量的探针。该探针只与反应体系中外加的带有可检测的标记物的靶标发生特异性结合，故可用于监控探针和

5、基片的结合质量及探针和靶标结合质量等整个反应过程的质量。（7）表面化学修饰质控探针surfacemodificationcontrolprobe微阵列基因芯片上用来质控基片的表面化学修饰质量的探针。（8）内标探针internalcontrolprobe微阵列基因芯片上用来质控检测过程中核酸提取、扩增反应、芯片杂交反应等过程是否正常的探针。（9）阳性质控探针positivecontrolprobe设置在微阵列基因芯片上的质控探针，无论被检测样品的结果如何，均能产生可以被识别的信号。（10）阴性质控探针negativecontrolprobe设置在微阵列基因芯片上的质控探针，无论

6、被检测样品的结果如何，均不会产生可被识别的信号。4.样本处理4.1样本类型样本类型可以是全血、滤纸干血斑、新鲜组织、穿刺组织、冰冻组织、石蜡包埋组织、脑脊液、骨髓、羊水、毛囊、精液、粪便、尿液、脱落细胞、培养细胞、其他体液（如痰液）等。74.2样本采集、运输与保存样本采集、运输与保存须遵循《全国临床检验操作规程(第四版)》和《个体化医学检测质量保证指南》，其中新生儿滤纸干血斑采集须符合《新生儿遗传疾病筛查血片采集技术规范》。样本采集种类和采集量，如使用经CFDA批准的商品试剂，须按照所使用的商品微阵列基因芯片检测试剂盒说明书规定。样本一经采集，则应尽可能快的送至检测实验室。对

7、于提取DNA的样本，可以在室温（18〜25℃）下运送，尽量在8h之内到达。如条件允许，样本应采用冰壶加冰或泡沫箱加冰密封进行运输。如为RNA，短时间内的运送如10min左右，可室温下运送，如为较长时间，则应在加冰条件下运送，建议在4h送至实验室。如条件允许，应使用液氮或者保存在特殊试剂中运输。对于检测靶标为DNA的样本，在2～8℃可保存3天。对于检测靶标为RNA的样本，一旦采集送到实验室后，则应在-20℃以下冻存。如为血循环中的RNA，最好不要使用血清样本，而应使用EDTA抗凝尽快分离后的血浆样本。临床