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时间:2018-07-14
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1、郑用链分子生物学综合复习题08基础兽医学邹晓冬(基准实验室,HZAU)-1-分子生物学综合复习题第1章绪论第2章基因的概念1.BasicConceptsl重复基因(duplicatefactor):即在基因组中有多个拷贝的基因——在真核生物基因组中发现这种现象,真核生物中的重复基因可以达到30%。重复基因主要是为了满足生物体快速发育的需要。l断裂基因/不连续基因(Splitgenes/interruptedordiscontinusgenes):即在基因编码蛋白质的序列中插入与蛋白质编码无关的DNA间隔区,使一个基因分隔成不连续的若干区段。l跳跃基因/转座子(Jumpinggene/Trans
2、posableelement):即可移动的或可转移的遗传因子。——这些因子不仅存在于细菌中,同时也存在于较高等的动物中。l假基因(Pseudogenes):是基因组中与编码基因序列非常相似的非功能性基因组DNA拷贝,一般情况都不被转录,且没有明确生理意义。——根据其来源可分为:保留了间隔序列的复制假基因(如珠蛋白假基因家族)和缺少间隔序列的已加工假基因。l重叠基因(overlappinggene):指在同一段DNA顺序上,由于阅读框架不同或终止早晚不同,同时编码两个以上基因的现象。2.Know-HowlDNA的一级、二级和高级结构(一)核酸的一级结构核酸的碱基顺序是核酸的一级结构。多聚核苷酸是
3、由四种不同的核苷酸单元按特定的顺序组合而成的线性结构聚合物,因此,它具有一定的核苷酸顺序,即碱基顺序。DNA的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物界物种的多样性即寓于DNA分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。(二)DNA的二级结构(1)DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成。两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反,即其中一条链的方向为5′→3′,而另一条链的方向为3′→5′。(2)嘌呤碱和嘧啶碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与碱基环平面成90°角。(3)螺旋横截面的直径约为2
4、nm,每条链相邻两个碱基平面之间的距离为3.4nm,每10个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩(即螺旋旋转一圈)高度为3.4nm。(4)两条DNA链相互结合以及形成双螺旋的力是链间的碱基对所形成的氢键。碱基的相互结合具有严格的配对规律,即腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)结合,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)结合,这种配对关系,称为碱基互补。A和T之间形成两个氢键,G与C之间形成三个氢键。在DNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。DNA二级结构的多型性A-DNA(碱基平面不再与螺旋轴垂直,而是位于大沟中,RNA-RNA/DNA杂交分子具有这种结构)B-DNA(典型的Watson-Crick双螺旋,碱基平
5、面基本上与螺旋轴垂直)C-DNA:D-DNAE-DNA这些不同构象的DNA都有共同之处:都是右手双螺旋;两条反向平行的核苷酸链通过Watson-Crick碱基配对结合在一起;链的重复单位是单核苷酸;这些螺旋中都有两个螺旋沟,分为大沟与小沟,只是它们的宽窄和深浅程度有所不同。三股螺旋DNA通常是一条同型寡核苷酸与寡嘧啶核苷酸-寡嘌呤核苷酸双螺旋的大沟结合。郑用链分子生物学综合复习题08基础兽医学邹晓冬(基准实验室,HZAU)-2-(三)DNA的三级结构指DNA链进一步扭曲盘旋形成超螺旋结构。超螺旋是DNA三级结构的主要形式。所有的DNA超螺旋都是由DNA拓扑异构酶产生。DNA分子具有相同的结构,
6、但链环数不同,所以称它们为拓扑异构体。拓扑异构酶能够催化它们之间的转换。DNA拓扑异构酶(topoisomeraseI,II)有两类(1)拓扑异构酶Ⅰ:作用是暂时切断一条DNA链,形成酶-DNA共价中间物而使超螺旋DNA松弛化,然后再将切断的单链DNA连接起来,而不需要任何辅助因子。如:大肠杆菌的ε蛋白(MW-110000)就是一种典型的拓扑异构酶Ⅰ。(2)拓扑异构酶Ⅱ:能将负超螺旋引入DNA分子,该酶能暂时性地切断和重新连接双链DNA,同时需要ATP水解为ADP以供能。如:大肠杆菌中的DNA旋转酶(DNAgyrase)。环状DNA的拓扑学特征(1)链环数(linkingnumber,DNA双
7、链分子的交叉数):指在双螺旋DNA中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数,以L表示。L①是整数;②在cccDNA中任何拓扑学状态中其值保持不变;③右手螺旋对L取正值。(2)初级螺旋圈数(缠绕数twistingnumber):指DNA分子中Watson-Crick的螺旋数,以T表示。①可以是非整数;②是变量;③右手螺旋时T为正值。(3)超螺旋数(writhingnumber)以W表示。①可以是非整
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