核酸提取原理及方法

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1、赢润生物曾林核酸提取原理及方法前言核酸是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,因此,核酸的提取是分子生物学实验技术中最重要、最基本的操作。http://www.yrbio.com主要内容核酸简介基因组DNA提取质粒DNA提取真核细胞总RNA提取琼脂糖凝胶电泳http://www.yrbio.com核酸简介核酸是由核苷酸或脱氧核苷酸通过3′,5′-磷酸二酯键连接而成的一类生物大分子。包括核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)两类。DNA主要储存遗传信息。RNA主要传递遗传信息。http://www.yrbio.com核酸简介如何分离RNA?如何分离DNA?

2、http://www.yrbio.com核酸简介——质粒DNA质粒(Plasmid)是一种染色体外的稳定遗传因子,大小从1-200kb不等,为双链、闭环的DNA分子,并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。质粒主要发现于细菌、放线菌和真菌等细胞中,它具有自主复制和转录能力,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。http://www.yrbio.com核酸简介基因组DNA提取质粒DNA提取真核细胞总RNA提取http://www.yrbio.com基因组DNA提取方法基因组DNA提取的几种常用方法:CTAB法SDS法其他方法http://www.yrbio.com基因组DNA提取

3、——CTAB法CTAB法原理(植物DNA提取经典方法)CTAB(hexadecyltrimethylammoniumbromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,并与核酸形成复合物。该复合物在高盐溶液中(>0.7mol/LNaCl)是可溶的,通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。http://www.yrbio.com基因组DNA提取——CTAB法CTAB提取缓冲液的经典配方组份Tris-HCl(pH8.0)EDTA(pH8.0)NaClCTABβ-巯基乙醇终浓度100mM20mM0.4M2%(W/V)0.1%(V/V)

4、使用前加入Tris-HCl(pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除。http://www.yrbio.com基因组DNA提取——CTAB法CTAB提取缓冲液的改进配方组份Tris-HCl(pH8.0)EDTA(pH8.0)NaClCTABPVP40β-巯基乙醇终浓度100mM20mM0.4M3%(W/V)5%(W/V)2%(V/V)使用前加入PVP(聚乙

5、烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。http://www.yrbio.comCTAB法实验流程基因组DNA提取——CTAB法植物材料抽提核酸沉淀液氮研磨上层溶液细胞裂解DNA溶液干燥溶解离心洗涤http://www.yrbio.comSDS法原理SDS是一种阴离子去垢剂,在高温(55~65℃)条件下能裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,释放出核酸;提高盐(KAc或NH4Ac)浓度并降低温度(冰浴),使蛋白质及多糖杂质沉淀,离心后除去沉淀;上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,反复抽提后用乙醇沉淀水相中的

6、DNA。基因组DNA提取——SDS法注:SDS法适用于大部分实验材料基因组DNA提取。如动物组织、细胞、全血、细菌、酵母等。http://www.yrbio.comSDS提取缓冲液的配方基因组DNA提取——SDS法组份Tris-HCl(pH8.0)EDTA(pH8.0)NaClSDS终浓度50mM20mM0.4M2%Tris-HCl(pH8.0):提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA:螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl:提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中。http://www.yrbio.com基因组DNA提取——SDS法SDS法实验流程(以动物

7、组织为例)动物组织抽提酒精沉淀液氮研磨或匀浆上层溶液细胞裂解DNA溶液干燥溶解离心洗涤http://www.yrbio.com基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳检测小鼠gDNA电泳图琼脂糖凝胶电泳:以琼脂糖凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。http://www.yrbio.com基因组DNA提取常见问题DNA样品不纯,抑制后续酶解和PCR反应DNA降解DNA量少http://www.yrb

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