感染的生态学和进化

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1、51634字P.1091（Science4thAug2000p.723）感染的生态学和进化编译者的话SARS爆发以来，在网上看到科幻作家写了一些文章，因为SARS是一个新出现的病毒传染病，大家不了解为什么在过去的几十年我们不断地发现了许多新出现的传染病，于是感兴趣，想要了解。这些科幻作家引用了湖南科技出版社出版，易凡和禹宽平翻译的“我们为什么会生病？达尔文医学的新问题”里面提到的一些假说；又受到一些科学家的批评。科普和科幻之间似乎产生了不可调和的矛盾和对立。人类在进化，许多与病原体无关的疾病是与进化过程中间的失误，或者其

2、实并非失误而造成的后果。另外许多与病原体有关的传染病，则是因为我们人类在这个地球大家庭是与周围的环境共处的，这个环境中有着大量各种各样的微生物，他们中间有一部分与我们人类，哺乳动物，各种脊椎动物和无脊椎动物，或者还包括植物有关系。这种关系，可以是互利的共生，和平的共处，或者是伤害我们的致病。硬盘中保存的前年译出来的《科学》杂志上关于“感染的生态学和进化”的系列文章，也许可以供科普和科幻作家参考。重新校核一遍之后，寄来在网上发表。校核的时候，我随手把参考文献括弧删掉了。也许认真的科普和科幻作家都会需要看参考文献，我将重新补

3、上。易凡2003/5/29引言性，世系，和发病机制p.1089卡洛林阿矢，与勒斯李罗伯特CAROLINEASHANDLESLIEROBERTS就微生物学而言，历史上没有比现在更好的时候了；我们正在尽情享受，甚至是过分丰富的资料。我们看到越来越多的基因组，有更多的机会对它们进行比较分析。指导我们开发新药物和疫苗的线索不会短缺，也不缺少有待阐明的可疑的毒力决定簇。但是收获这些研究的全部效益，我们有必要考虑全面的问题：人们不是只受‘一种微生物’的感染——我们是‘许多种微生物组成的社会’的宿主，其中多数微生物是对我们只有很有限的

4、、很小的害处。我们必须弄请微生物和宿主之间的动态变化，并且要了解什么时候可能出现危害。在这一组文章中，关注当前微生物学的复兴中具有比较广泛的意义的问题。奥克曼和摩兰（Ochman&Meran）论证说对病原微生物的基因组测序，给我们一个细菌多样性的似乎是扭曲了的观点，因为‘病原微生物是现代的、不寻常的细菌物种中的一小部分’。虽然对一个病原微生物而言，迅速变化是一种优势，许多微生物感染的标志，是克隆世系的建立。李德和泰勒（Read&Taylor,1.099）观察到，就是在同一个被感染的、受害的个体中，各世系微生物之间的竞争，

5、也将对疾病的严重程度和传播产生影响。——这些因素在临床上经常地是被忽视了。巴伦洛斯基（Baranowski）等指出，病毒基因组中很小的变化，可以带来病毒在宿主体内分布的显著变化；这对于疫苗的使用和异体移植的风险有着重大影响。虽然某些逆转录病毒，例如HIV，因为它们的顺序变异发生率非常之高，而被认为特别有害；然而，欧维巴和班罕（Overbaugh&Baugham）解释说，能够迅速适应的病毒，倾向于发展成为生态学中的‘全面手’。而乌尔浩斯（Woolhous39）等的讨论中则说，这里面包括了公共卫生方面日益关注的许多人畜共患病

6、。虽然哺乳动物的消化道中充满了微生物，炎症反应却是比较罕见的。李文和安替亚（Levin&Antia）检查了针对感染的免疫反应，将其与‘捕食者——被捕食者’进行动态比较，并指出对感染作出全部炎性免疫反应的风险。何珀和戈登（Hooper&Gordon）扩展到肠道共栖菌与宿主之间的交流，还有罗素菜李奇利克（Russell&Rychlik）描述了反刍动物体内肠道共栖菌与宿主之间的的特异性共生关系，和这种关系怎样被饲养方式所影响。卡尔齐默（CarlZimmer）描述了对生活中的病原体的遗传分析，怎样能使研究者重建疾病起源和进化过程

7、，齐默还详细地谈到一个异乎寻常的小丑：Wolbachia——也许是地球上最常见的一种感染性细菌——以及它怎样调理它的宿主的性生活来保证它自身的生存。大量的新资料，应当有助于关于感染的早已存在的问题的解答，明确独特的对药物易感的代谢机制，和关键的接受疫苗攻击的表面分子，更重要的是它们将揭示感染的生态学和进化方面的内容。见www.sciencemag.org/feature/data/disease/index.shtnGeneticTreesRevealDiseaseOrigin遗传树揭示疾病的来源p.1090CanGen

8、esSolvetheSyphilisMystery?基因能够解答梅毒之谜吗？p.1091到底是哥仑布把梅毒带去新大陆——还是带回旧大陆？是一个至少已经在过去500年里争论不休的题目。在过去的50年里，考古学家已经在骨骼上找到一些线索。然而，这些骨骼讲的还仍然是一个模棱两可的故事。有的似乎明确指向哥仑布，或者至少涉及他