松江鲈遗传多样性分析大学学位论文.doc

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1、常熟理工学院毕业论文本科毕业论文题目松江鲈遗传多样性分析系（院）生物与食品工程系年级2004级专业生物科学（师范）班级（2）班学号060104210学生姓名鲍峰指导教师郁建锋职称讲师论文提交日期2008年6月5日21常熟理工学院毕业论文松江鲈遗传多样性分析摘要本研究通过正交实验设计，分别从TagDNA聚合酶、Mg2+、dNTPmix和引物4种PCR原料因素的3个水平，筛选并确立了松江鲈ISSR-PCR反应最佳体系，并通过温度梯度PCR，确立了适于的退火温度。结果表明，利用所建立的ISSR-PCR反应体系，对松江鲈样本进行检验，获得了清晰、重复性好、多态性高的DNA谱带。从77个ISSR引物中筛

2、选出4个引物，对松江鲈2个群体（辽宁丹东野生群体、河北秦皇岛F1代人工繁育群体）共48个样品进行扩增，共得到44个清晰的扩增位点，其中多态性位点37个，多态位点百分率为84.09%。Popgene分析结果表明：丹东野生群体的遗传多样性水平(P=79.55%，h=0.2750，I=0.4100)略高于人工繁育群体的遗传多样性水平。松江鲈48个个体间最大的遗传距离为0.8389,个体间最小的遗传距离为0.0465，48个个体的平均遗传距离为0.3525；群体间的Nei’s遗传分化系数为0.0876；利用MEGA3.0软件构建了松江鲈48个个体的UPGMA系统树，松江鲈个体不以地理群体分别聚类，无明

3、显分支。研究表明松江鲈种群的遗传多样性处于中等水平，2个群体的遗传分化尚未达到种群的分化水平。本文从分子遗传学入手，采用ISSR分子标记技术分别对松江鲈的野生与人工繁育群体进行遗传多样性研究，为其种质资源的科学管理、研究野生松江鲈的遗传背景和比较野生群体与人工繁育群体之间的遗传差异以及探讨由于辽东半岛沿岸带有较多松江鲈分布而产生的基因交流对2个群体遗传结构的影响提供了重要理论依据。关键词：松江鲈正交试验ISSR遗传多样性21常熟理工学院毕业论文StudyonthegeneticdiversityofTrachidermusfasciatusAbstractISSRtechniquewasuse

4、dtoassessthegeneticdiversityoftwopopulations(24wideindividualsfromtheYaluRiver,and24culturedindividualsfromtheQinhuangIsland).Inthisstudy,orthogonaldesignwasusedtooptimizeISSRamplificationsystemonTrachidermusfasciatusHeckelinfourfactors(TaqDNApolymerase,dNTP,primer,Mg2+)atthreelevelsrespectively.The

5、reforebestreactionsystemscouldbeestablished.Andtheoptimalannealingtemperature51℃forISSR-PCRreactionwasproposedbygradientPCR.TheclearandpolymorphicDNAbandswereamplifiedrepeatedlyfrom24wildTrachidermusfasciatusHeckelbytheestablishedISSRamplificationsystem.Thegeneticdiversityof48samplesfromtwopopulatio

6、ns(24wideindividualsfromtheYaluRiver,and24culturedindividualsfromtheQinhuangIsland)werestudiedusingtheinter-simplesequencerepeat(ISSR)markers.TheISSRbandscanbedifferentiatedhighlyin4primersafterscreening.Atotalof37discernibleDNAfragmentswereobserved,amongwhich44fragments(84.09%)beingpolymorphic.Thep

7、ercentageofpolymorphic(P),Nei’sgenediversityandShannon’sindexshowedthatthegeneticvariationofthewildpopulation(P=79.55%,h=0.2750,I=0.4100)wasalittlehigherthantheculturedpopulation.Theaveragegeneticdist