dna ladder及提取

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时间:2018-07-09

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1、DNALadder是一种即用型(readyforuse)DNA分子量标准(DNAMolecularWeightMarker)。包含了1KbDNALadder和100bpDNAladder,可以满足各种常规DNA电泳分析的分子量参照需要。本DNAladder相当于Invitrogen等公司的1KbplusDNAladder,但比Invitrogen公司的1KbplusDNAladder的条带分布更加均匀细致,便于对照DNA分子量。DNAladder中500bp、1000bp和3000bp条带用黑体标记(参见右图),亮度较高,使辨别条带更加容易。具体每条带的DNA的含量

2、可以参考右图进行计算。本DNAladder中已添加了含有溴酚蓝的DNA上样缓冲液,可以直接使用。每孔上样5微升,即可观察到非常清楚的DNA条带(参见右图)。DNAladder法检测细胞凋亡发生细胞凋亡时,内源性核酸酶被激活,染色体DNA链在核小体之间被切割,形成180~200个碱基或其整数倍的DNA片段,将这些DNA片段抽提出来进行电泳,可得到DNA梯状条带(DNAladder)。【材料与试剂】凋亡细胞;蛋白酶K(500μg/ml)8mol/L醋酸钾白细胞裂解液:pH8.0,10mmol/LTris-HCl,10mmol/LNaCl,10mmol/LEDTA,1%S

3、DS。氯仿无水乙醇,70%乙醇;2%琼脂糖凝胶。【操作步骤】(1)收集凋亡细胞:取1~2×106个细胞,离心后,立即用70%酒精(-20℃)固定2h;(2)洗涤:取出酒精固定的细胞,1000r/min离心5min,去掉上清液,PBS洗二次;(3)裂解细胞:加400μl细胞裂解液,充分混匀再加蛋白酶K100μl,置65℃水浴消化2小时或过夜;(4)蛋白处理:加75μl8mol/L的醋酸钾,4℃15min,再加750μl氯仿,充分混匀后,10000r/min离心10分钟后,将上清移至一新的Eppendorf管中;(5)沉淀DNA:加入750μl无水乙醇,上下轻柔颠倒混合

4、,即可见乳白色沉淀,若不明显时可置-20℃过夜,12000r/min离心10分钟,去上清;(6)洗涤DNA:加1ml70%乙醇,混匀,10000r/min离心5min,去上清;(7)溶解DNA:根据DAN沉淀的大小,加一定量的蒸馏水或TE,37℃溶解;(8)测定DNA浓度;(9)2%琼脂糖凝胶电泳80V2小时;【结果判断】出现梯状电泳条带,最小的条带为180~200bp,其他的条带为其整倍数大小。坏死细胞则出现弥散的电泳条带,无清晰可见的条带。正常细胞DNA基因条带因分子量大,迁移距离短,故停留在加样孔附近。细胞凋亡DNALadder检测试剂盒细胞凋亡DNALadd

5、er检测试剂盒一、原理细胞核染色质DNA断裂是细胞凋亡的标志特征。在细胞发生凋亡时,核酸内切酶被激活,选择性降解染色质DNA,形成50-300kb的大片段,并进而在核小体连接处断裂,形成180-200bp或其整倍数的DNA片段,这些DNA片段可从细胞中提取出来,通过琼脂糖凝胶电泳,溴化乙啶染色呈现为梯状条带(DNALadder),并据此判断细胞凋亡产生。细胞凋亡DNALadder检测试剂盒提供了一种简便、快速地提取染色质DNA的方法,并增加对小片段DNA的回收,从而增强了检测的敏感性。二、试剂盒组份组份KGA111(20assays)KGA112(50assays)

6、KGA113(100assays)LysisBuffer6mL15mL25mLSolutionA400μL1.0mL2.0mLEnzymeA400μL1.0mL2.0mLEnzymeB400μL1.0mL2.0mLPrecipitant3.0mL6.5mL13.0mLLoadingBuffer80μL0.2mL0.4mL三、操作步骤1.离心收集105~106细胞(1500×g,5min)于1.5mL微量离心管中;2.用PBS洗涤细胞二次(离心1500×g,5min),弃上清;3.沉淀的细胞中加入100μLLysisBuffer,涡旋振荡器上剧烈混合10秒,离心100

7、0×g,5min)移上清于另一1.5mL微量离心管中;4.沉淀再加入100μLLysisBuffer重复上步,合并两次的上清液;5.在上述合并的上清液中加入20μLSolutionA,再加入20μLEnzymeA,55℃反应1小时;6.加入20μLEnzymeB,37℃,1小时;7.加入130μLPrecipitant和950μL冷乙醇,混匀,置—20℃,1小时以上或过夜;8.4℃,12,000-14,000rpm离心15-30min,小心地弃去上清,收集沉淀的DNA;9.加入0.5mL70%的冷乙醇,洗DNA沉淀,再12,000-14,000rpm离心20mi

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