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时间:2018-07-08
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1、密码子、反密码子及tRNA密码子1、定义 指信使RNA上决定一个氨基酸的三个相邻碱基的排列顺序2、特点 ①遗传密码子是三联体密码:一个密码子由信使核糖核酸(mRNA)上相邻的三个碱基组成。 ②密码子具有通用性:不同的生物密码子基本相同,即共用一套密码子。 ③遗传密码子无逗号:两个密码子间没有标点符号,密码子与密码子之间没有任何不编码的核苷酸,读码必须按照一定的读码框架,从正确的起点开始,一个不漏地一直读到终止信号。 ④遗传密码子不重叠,在多核苷酸链上任何两个相邻的密码子不共用任何核苷酸。 ⑤密码子
2、具有简并性:除了甲硫氨酸和色氨酸外,每一个氨基酸都至少有两个密码子。这样可以在一定程度内,使氨基酸序列不会因为某一个碱基被意外替换而导致氨基酸错误。 ⑥密码子阅读与翻译具有一定的方向性:从5'端到3'端。 ⑦有起始密码子和终止密码子,起始密码子有两种,一种是甲硫氨酸(AUG),一种是缬氨酸(GUG),而终止密码子(有3个,分别是UAA、UAG、UGA)没有相应的转运核糖核酸(tRNA)存在,只供释放因子识别来实现翻译的终止。 反密码子1、定义 指转运RNA上的一端的三个碱基排列顺序,转运RNA一端携带氨基酸,另一端反密码子
3、与信使RNA上的密码子(碱基)配对。2、特点 反密码子的摆动配对 最初人们认为每一个密码子都有特异的tRNA反密码子。如果这种假说是正确的,生物体中应该有至少61种不同的tRNA,可能还有另外3种对应于链终止密码子。然而有证据表明:某种高度纯化的已知序列的tRNA可以识别几种不同的密码子。也有研究发现反密码子除了4种常规的碱基之外,还有第5种碱基次黄嘌呤(inosine,I)。和其他tRNA中的次要碱基一样,次黄嘌呤是通过对完整tRNA链中的碱基进行酶修饰而得来的。次黄嘌呤源于腺嘌呤,即腺嘌呤分子上第6个碳原子脱去氨基,成为次黄嘌呤
4、的6一酮基基团。[实际上,次黄嘌呤是由核糖和次黄嘌呤(hypoxanthine)碱基组成的核苷酸,但现已常常用来指碱基,就如同我们这里所用的。 1966年FrancisCrick提出了摆动理论(wobbleconcept)来解释所观察到的现象。摆动理论指出,反密码子5’端的碱基在空间上不如其他2个位置上的碱基那么受限制,可以和密码子3’端的几种碱基形成氢键。不是所有组合都行,配对局限于下表中的碱基。例如,位于摆动位置的U可以和A或G配对,I可以和U、C或A配对。摆动规则所允许的配对是那些核糖与核糖之间的距离与标准的A:U或G:C碱基对相似的
5、配对。(除了I和A碱基对)嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶的配对分别使核糖与核糖之间的距离过长或者过短。tRNA1、定义 转运RNA(transferribonucleicacid tRNA)是具有携带并转运氨基酸功能的一类小分子核糖核酸,是Transfer_RNA的简称。大多数tRNA由七十几至九十几个核苷酸组成,分子量为25000~30000,沉降常数约为4S(个别tRNA的沉降常数为3S,含63个核苷酸)。tRNA分子均可排布成三叶草模型的二级结构。2、结构 ①5'端磷酸。 ②受体臂(acceptstem,也被称作amino
6、acidstem)是一个7个碱基长的臂,其中包含5'端,与有3'端羟基(OH)(能结合氨基酸于其上)的3'端。受体臂有可能含有非Watson-Crick所发现的碱基对。 ③CCA尾(CCAtail)是tRNA分子3'端的CCA序列,在翻译时,帮助酶识别tRNA。 ④ D臂(Darm)是在一个环(Dloop)的端部4个碱基的臂,通常含有二氢尿嘧啶(dihydrouridine)。 ⑤反密码子臂(anticodonarm)有5个碱基,包括反密码子(anticodon)。每一tRNA包括一个特异的三联反密码子序列,能够与氨基
7、酸的一个或者多个密码子匹配。例如赖氨酸(lysine)的密码子之一是AAA,相应的tRNA的反密码子可能是UUU(一些反密码子可以与多于一个的密码子匹配被称为“摆动”)。 ⑥T臂(Tarm)是5个碱基的茎,包括序列TψC。 ⑦修饰碱基(Modifiedbases)是tRNA中的一些不常见的碱基,如腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和尿嘧啶的修饰形式。3、功能 主要是携带氨基酸进入核糖体,在mRNA指导下合成蛋白质。即以mRNA为模板,将其中具有密码意义的核苷酸顺序翻译成蛋白质中的氨基酸顺序。tRNA与mRNA是通过反密码子与密码子相
8、互作用而发生关系的。tRNA靠反密码子与mRNA识别,但并非一种反密码子只能识别一种密码子。例如反密码子CIG(I是次黄嘌
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