国家超级计算深圳中心软件技术支持手册.docx

《国家超级计算深圳中心软件技术支持手册.docx》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在应用文档-天天文库。

1、国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部常用Linux命令简介目录1、ls-显示目录下内容……………………………………………………….22、mkdir-创建目录…………………………………………………………..43、pwd-显示路径…………………………………………………………….64、vi/vim-创建/编辑文件……………………………………………………85、cd-进入目录………………………………………………………………136、cp-复制文件/目录………………………………………………………..1616国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部1、ls-显示目录下内

2、容ls：查看目录中的文件情景一：登录高性能账号后，查看文件夹（图片中为~/TEST/MS/Castep_7.0）下有哪些文件，直接输入“ls”：情景二：查看文件夹下的隐藏文件有哪些，输入“ls-a”，注意中间有空格：与情景一中的文件相比，多了.shellscrept隐藏文件可以看到隐藏的.bashrc文件16国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部情景三：查看计算的结果文件是否有更新，或者查看安装的可执行文件中哪个是最新生成的，输入“ls-l”：没有重新提交作业前，输出文件的时间提交任务计算后，输入文件更新的时间16国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部2

3、、mkdir-创建目录mkdir：创建目录情景一：登录高性能账号后，需要在test文件夹下创建crack和dipole文件夹来放置算例文件：·1、创建crack文件夹“mkdircrack”；再创建dipole文件夹“mkdirdipole”：创建crack和dipole前，test文件夹下没有任何文件创建crack后，test文件夹下出现crack创建dipole后，test文件夹下有crack和dipole·2、一次性创建crack和dipole文件夹文件夹“mkdircrackdipole”：创建crack和dipole前，test文件夹下没有任何文件16国家超级计算深圳中心

4、（深圳云计算中心）_高性能计算部创建crack和dipole后，test文件夹下出现crack和dipole情景二：需要在test文件夹下创建meam/24-50W文件夹来放置算例文件，输入“mkdir-pmeam/24-50W”（-p或--parents若所要建立目录的上层目录目前尚未建立，则会一并建立上层目录）：创建前创建后16国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部3、pwd-显示路径pwd：显示工作路径情景一：在服务器中安装好一个软件以后，使用这个软件时，就需要知道这个软件的路径在哪里，进入该文件所在的文件夹后，输入“pwd”：找到可执行文件lmp_mpi可以查

5、到lmp_mpi的绝对路径情景二：中心高性能分区有7个，如果忘记自己高性能账号所在的分区，还可以使用“pwd”命令来查到，“home-xx/”中xx就表示高性能账号所在的分区：该高性能账号所在的分区为GG分区16国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部该高性能账号所在的分区为FN分区16国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部4、vi/vim-创建/编辑文件vi/vim：创建文本文件，文本文件编辑器在中心高性能计算分区中，vim和vi的用法是一样的，选择任何一个即可。情景一：新创建一个提交作业的脚本文件lammps.lsf：·1、在需要使用lammps.ls

6、f脚本的文件夹下，输入“vimlammps.lsf”：按“Enter”键前·2、按键盘上的“Enter”键，打开文件，文件左下角会出现文件名称和“[NewFile]”：按“Enter”键后·3、从键盘上键入“i”，即进入编辑模式，文件左下角会出“INSERT”：进入编辑模式后·4、利用键盘上的“上下左右”键可以移动光标，编辑完成后，按下键盘上的“Esc”键，退出编辑模式，“INSERT”消失：16国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部进入编辑模式后·5、从键盘上输入“:wq”，按下键盘上的“Enter”键后即可保存：选择保存按“`Enter`”键退出情景二：打开脚本文

7、件gromacs.lsf（名称可更换为需要操作的文件名称）：16国家超级计算深圳中心（深圳云计算中心）_高性能计算部·1、查看所在文件夹下有哪些文件：·2、打开gromacs.lsf文件，输入“vimgromacs.lsf”：输入文件名，按“Enter”键前·3、按键盘上的“Enter”键，打开文件，因为不是新创建的文件，所以文件左下角又文件名称，但没有“[NewFile]”：按“Enter”键后，打开内容·4、没有对文档进行修改，退出只需输入“:q”即可：未对文档进