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《陆地棉矮化突变体Ari1327茎尖的转录组分析-论文.pdf》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、植物遗传资源学报2014,15(5):1046.1052JoumalofP1antGeneticResourcesDOI:10.13430/j.cnki.jpgr.2014.05.019陆地棉矮化突变体Ari1327茎尖的转录组分析安文燕r,孙君灵,龚文芳,何守朴,潘兆娥,杜雄明,(华中农业大学生命科学技术学院,武汉430072;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室,河南安阳455000)摘要:为了从分子水平上研究陆地棉矮秆突变体Afi1327的矮化机理,本研究以矮秆突变体Afi1327、野生型Aft971和高秆突变体Ar
2、i3697的茎尖为材料.建立3个cDNA文库,用IlluminaHiSeq2000系统对3个材料的茎尖eDNA进行转录组测序。3个文库测序共得4.9G数据量,拼接得到Unigene70877个。通过矮化突变体Afi1327与野生型Ari971和高秆突变体Afi3697两个文库的差异筛选,得到13919个与矮化相关的差异表达基因,其中5406个表现上调,8513个表现下调。GO功能和KEGG通路富集发现,差异基因在植物激素信号转导途径显著富集。通过实时荧光定量PCR(qRT.PCR)验证,推测Afi1327的矮化可能与赤霉素和生长素2种激
3、素的信号转导及互作有关。转录组测序得到的大量差异基因,为深入研究棉花的矮化机理具有重要参考价值,同时为棉花的矮化育种工作奠定了基础。关键词:棉花(CossypiumhirsutumL.);矮化;转录组TranscriptomeAnalysisofStemApexofanUplandCottonDwarfMutantAri1327ANWen.yan’,SUNJun.1ing,GONGWen.fang,HEShoupu。,PANZhao.e,DUXiong.ming'(CollegeofL~feScienceandTechnology,Hu
4、azhongAgriculturalUniversity,Wuhan430072;StateKeyLaboratoryofCottonBiology/CottonResearchInstitute,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Anyangttenan455000)Abstract:TostudythedwarfmechanismofAri1327onmolecularlevel,threestemapexcDNAlibrariesofAri1327,Aft971,andtall-culmmu
5、tantAri3697wereconstructedandsequencedusingIlluminaHiSeqm2000sys—tern,respectively.4.9Gavailabletranscriptomedatawereobtained,with70877Unigeneswerespliced.Aftercom—paringthetranscriptomedataofAfi1327withdataofAft971andAfi3697,weuncovered13919differentiallyex-pressedgenes
6、,ofwhich5406up—regulatedwhile8513down—regulatedinAri1327.GeneOntologyfunctionalenrich—mentandKEGGpathwayanalysisrevealedthatthedifferentiallyexpressedgenesenrichedinplanthormonesignaltransductionpathway.AfterqRT—PCR,wespeculatedthatthesignaltransductionandinteractionofIA
7、AandGAmightcontributetodwarfismofAfi1327.Webelievedthattheabundantdifferentiallyexpressedgenesdetectedbytranscriptomesequencingwouldbebeneficialforrevealingthemechanismunderlyingcottondwarfismwhichlaydthefoundationforbreedingcottondwarfgenetype.Keywords:cotton(Gossypiumh
8、irsutumL.);dwarf;transcriptome棉花是我国重要的经济作物,矮化植株具有抗或阻断。使植物体内源活性激素缺乏或痕量存在,外倒伏能力强、适宜密植以及机械化管理的特点,对于施相应的活性激
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