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时间:2020-03-28
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1、第二章蛋白质1、凯氏定氮法:蛋白质含量=总含氮量-无机含氮量)×6.25例如:100%的蛋白质中含N量为16%,则含N量8%的蛋白质含量为50%100%/xg=16%/1gx=6.25g2、根据R基的化学结构,可将氨基酸分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环氨基酸和杂环亚氨基酸。按照R基的极性,可分为非极性R基氨基酸、不带电荷的极性R基氨基酸、极性带负电荷的R基氨基酸、极性带正电荷的氨基酸。类别氨基酸名称缩写符号简写符号非极性丙氨酸AlaA缬氨酸ValV亮氨酸LeuL异亮氨酸IleI苯丙氨酸PheF甲硫氨酸(蛋氨酸)MetM脯氨酸ProP色氨酸TrpW极性不带电
2、荷甘氨酸GlyG丝氨酸SerS苏氨酸ThrT天冬酰胺AsnN谷氨酰胺GlnQ酪氨酸TyrY半胱氨酸CysC极性带负电荷(酸性氨基酸)天冬氨酸AspD谷氨酸GluE极性带正电荷(碱性氨基酸)组氨酸HisH赖氨酸LysK精氨酸ArgR3、氨基酸的重要理化性质(1)一般物理性质无色晶体,熔点极高(200℃以上),不同味道;水中溶解度差别较大(极性和非极性),不溶于有机溶剂。氨基酸是两性电解质。氨基酸等电点的确定:酸碱确定,根据pK值(该基团在此pH一半解离)计算:等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数。(2)化学性质①与水合茚三酮的反应:Pro产生黄色物质,其它为
3、蓝紫色。在570nm(蓝紫色)或440nm(黄色)定量测定(几μg)。②与甲醛的反应:氨基酸的甲醛滴定法③与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应:形成黄色的DNP-氨基酸,用来鉴定多肽或蛋白质的N端氨基酸,又称Sanger法。或使用5-二甲氨基萘磺酰氯(DNS-Cl,又称丹磺酰氯)也可测定蛋白质N端氨基酸。④与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应:多肽链N端氨基酸的α-氨基也可与PITC反应,生成PTC-蛋白质,用来测定N端的氨基酸。4、肽的结构线性肽链,书写时规定N端放在左边,C端放在右边,用连字符将氨基酸的三字符号从N端到C端连接起来,如Ser-Gly-Tyr-
4、Ala-Leu。命名时从N端开始,连续读出氨基酸残基的名称,除C端氨基酸外,其他氨基酸残基的名称均将“酸”改为“酰”,如丝氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸。若只知道氨基酸的组成而不清楚氨基酸序列时,可将氨基酸组成写在括号中,并以逗号隔开,如(Ala,Cys2,Gly),表明此肽有一个Ala、两个Cys和一个Gly组成,但氨基酸序列不清楚。由于C-N键有部分双键的性质,不能旋转,使相关的6个原子处于同一个平面,称作肽平面或酰胺平面。5、、蛋白质的结构(一)蛋白质的一级结构(化学结构)一级结构中包含的共价键主要指肽键和二硫键。(二)蛋白质的二级结构(1)α-螺旋(如毛
5、发)结构要点:螺旋的每圈有3.6个氨基酸,螺旋间距离为0.54nm,每个残基沿轴旋转100°。(2)β-折叠结构(如蚕丝)(3)β-转角(4)β-凸起(5)无规卷曲(三)蛋白质的三级结构(如肌红蛋白)(四)蛋白质的四级结构(如血红蛋白)6、蛋白质分子中氨基酸序列的测定氨基酸组成的分析:•酸水解:破坏Trp,使Gln变成Glu,Asn变成Asp•碱水解:Trp保持完整,其余氨基酸均受到破坏。N-末端残基的鉴定:鉴定N-末端的氨基酸残基常用2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应或丹磺酰氯反应。异硫氰酸苯酯(PITC)反应也可用于鉴定N-末端的氨基酸残基,但主要是用于
6、测定肽段的氨基酸序列。C-末端残基的鉴定:•肼解法:蛋白质或多肽与无水肼加热发生肼解,反应中只有C端氨基酸以游离形式存在。•还原法:肽链C端氨基酸可用硼化锂还原成相应的α-氨基醇,可用层析法加以鉴别。•羧肽酶法:羧肽酶从羧基端(C端)一个一个切。多肽链的裂解:酶切位点或作用特点:•胰蛋白酶:Lys,Arg的C侧•糜蛋白酶(胰凝乳蛋白酶):Phe,Tyr,Trp的C侧•梭菌蛋白酶:Arg的C侧•葡萄球菌蛋白酶:Asp或Glu的C侧•嗜热菌蛋白酶:Leu,Ile,Val的N侧•氨肽酶:从氨基端(N端)一个一个切•溴化氰(CNBr):Met的C端•羟胺:Asp的C侧
7、,Gly的N侧7、蛋白质的沉淀反应:加高浓度盐类;加有机溶剂;加重金属盐类;加某些酸类;加热。8、氨基酸的颜色反应第三章核酸1、核苷酸由含氮碱基(嘌呤或嘧啶),戊糖(核糖或脱氧核糖)和磷酸组成。核酸是核苷酸的多聚物,其连接键是3’,5’-磷酸二酯键。2、生物体内的AMP(腺苷酸)可与一分子磷酸结合,生成ADP(腺苷二磷酸),ADP再与一分子磷酸结合,生成腺苷三磷酸(ATP),各种核苷三磷酸(ATP、GTP、CTP和UTP)是体内RNA合成的直接原料,各种脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)是DNA合成的直接原料。在体内能量代谢中的作用:AT
8、P—能量“货币”UTP—参加糖的互相转
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