材料工程基础绪论

《材料工程基础绪论》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、刘夫锋2010-9-15生物信息学基础1.时间:周三早晨1～2节（8：00~9：30）周五下午5~6节（14：00~15：30）2.地点：19教215教室3.学时：每周4学时（总计84=32学时）4.学分：2学分课程安排5.成绩考核方式（无笔试）：2次调研报告，40％1次学习研究论文（期末完成），40％平时成绩20％6.E-mail:fufengliu@tju.edu.cnTel:27406590(office)办公室地址：北洋科学楼404室7.公用邮箱：bioinformaticstju@126.com密码：123456课

2、程安排第一章绪论1．生物信息学的基本概念2．生物信息学分类生物信息学的发展历程面临的问题和挑战研究生物信息学的一般方法第二章生物信息相关的数据库1．分子生物学数据库2．基因组信息资源3．蛋白质信息资源4．其他数据库5.主要的序列数据格式（格式转换，数据下载等）课程提纲第三章生物信息学数据挖掘1．分子生物学数据库查询2．BLAST3.实例简介第四章生物信息学中的编程语言1.常用编程语言2.Perl/BioPerl简介3.如何学习perl课程提纲第五章序列的采集、存储和查询1．分子生物学基础简介2．DNA测序3．序列数据的存储4．

3、序列数据的文件格式5．实例解析第六章双序列比对1．序列比对的数学基础2．动态规划算法的介绍3．打分矩阵及其含义4．序列比对的显著性检验5.同源物搜索课程提纲第七章基因组进化及分子进化研究简介1．基因组的结构与内容2．基因组注释比较基因组学基因/蛋白质的功能预测第八章结构生物信息学与计算机辅助药物分子设计1.结构生物信息学2.药物发现的历史和发展3.分子对接4.药物设计中小分子-蛋白质对接5.药物设计中蛋白质-蛋白质或DNA对接课程提纲第九章同源建模1.同源建模的概念2.同源建模的目的3.同源建模的基本步骤优势和局限性第十章计算

4、机辅助药物分子设计1.分子对接的概念和用途2.分子对接的基本方法3.分子对接软件简介4.分子对接实例演示课程提纲第一章绪论TianjinUniversity10结构生物学计算机科学分子生物学生物信息学1.生物信息学的基本概念TianjinUniversity111.生物信息学的基本概念-分子生物学从分子水平上研究生命现象物质基础的学科。研究细胞成分的物理、化学的性质和变化以及这些性质和变化与生命现象的关系，如遗传信息的传递，基因的结构、复制、转录、翻译、表达调控和表达产物的生理功能，以及细胞信号的转导等TianjinUnive

5、rsity12Bruker600型核磁共振波谱仪X光生物大分子单晶衍射仪1.生物信息学的基本概念-结构生物学TianjinUniversity131.生物信息学的基本概念-计算机科学编程语言计算机硬件TianjinUniversity14中心法则DNARNA蛋白质细胞表型基因组转录组蛋白质组细胞表型分子生物学中心法则基因组中心法则1.生物信息学的基本概念-细胞2001.MethodsofInformationinMedicine40:346-358.1.生物信息学的基本概念80年代末随着人类基因组计划启动而兴起的一门新兴交叉学

6、科生命科学中的信息科学基因组相关信息的快速增长(方法与技术需求)新药开发等(企业需求)生物信息学(Bioinformatics)与计算生物学(ComputationalBiology)1.生物信息学的基本概念TianjinUniversity171.生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集，处理，存储，传播，分析和解释等各方面的一门学科，它通过综合利用生物学，计算机科学和信息技术来揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。1.生物信息学的基本概念TianjinUniversity182.生物信息学(Bi

7、oinformatics)是运用计算机技术和信息技术开发新的算法和统计方法，对生物实验数据进行分析，确定数据所含的生物学意义，并开发新的数据分析工具以实现对各种信息的获取和管理的学科。1.生物信息学的基本概念TianjinUniversity193.生物信息学是在大分子方面的概念型的生物学，并且使用了信息学的技术，这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法，并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息1.生物信息学的基本概念2.生物信息学分类细胞TianjinUniversity212.生物信息学分类

8、生物体TianjinUniversity222.生物信息学分类2.生物信息学分类生物分子携带的信息遗传信息功能相关的结构信息进化信息2.生物信息学分类1.遗传信息的载体主要是DNA2.控制生物体性状的基因是一系列DNA片段3.生物体生长发育的本质就是遗传信息的传递和表达2.生