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《黄栌枯萎病菌漆酶基因的鉴定及其在微菌核形成过程中的表达研究》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、黄扶枯萎病菌漆酶基因的鉴定及其在微菌核形成过程中的表达研究肖书笑,皿呈明,王永林(北京林业人学林学院,北京市100083)摘要:为了研究漆稱相关基因在黄护枯萎病菌(Vcrticilliumdahliac)微菌核形成过程屮的表达谱和功能,本研究基于全基因组和转录组数据库,鉴定了黄护枯萎病菌编码漆酶的基因,分析其蛋白质结构及与其他丝状病原真菌的系统发育关系,然后分析其在微菌核形成过程中的表达水平。通过牛物信息学方法,本研究从大丽轮枝菌中鉴定出了6个编码漆陋的基因,可以分类I、II、III型,并能与漆酶上的
2、铜原子催化活性区域相关联;表达分析确定了5个基因VDAG_()7741、VDAG_()()()34、VDAG_03556、VDAG_09919和VDAG_00189,在微菌核形成过毎中为上调表达,一1个VDAG_07226为下调表览,结果表明漆酶石黄护枯萎病菌微繭核形成过程中发挥着重耍的作川,闻实冇重耍的关系,为微菌核形成的研究工作及大丽轮枝菌的防治工作提供了加础。木研究为开展黄椚枯萎病菌微菌核形成过程中与黑色素形成相关的漆酶基因的功能研究奠定了基础。关键词:黄柏枯萎病;大丽轮枝菌;微菌核形成;漆酶中
3、图分类号:S763.15Genome-wideidentification,phylogenyandexpressionprofilingduringmicrosclerotiaformationinsmoketreewiltfungusVerticilliumdahliaeXIAOShuxiao,TIANChengming,WANGYonglin(CollegeofForestry,BeijingForestryUniversity,100083)Abstract:Inordertostudythe
4、expressionprofileduringmicrosclerotial(MS)formationoflaccase-likeoxydasesinVerticilliumdahliaeandthefunctionoflaccasegenes,basedongenome-wideandtranscriptionaldatabases,ourresearchidentifiedthegeneswhichcodelaccaseinV.dahliae,thenanalyzedtheirproteinstr
5、ucturesandthephylogeneticrelationshipwithotherfilamentousfungi,andcalculatedtheirexpressionprofileduringMSformation.Viabioinformaticsmethods,6laccasegenesinV.dahliaewereidentifiedandclassifiedinto3types:I,II,III,inassociatedwithfimctionaltypesincopper-c
6、atalyticcenteractivity,fivegenesVDAG_07741、VDAG_00034、VDAG_03556、VDAG_09919andVDAG_00189wereup-regulatedandonegeneVDAG07226down-regulatedinMSformation.Tosumup,laccasegenesplayanimportantandindispensableroleinMSformationofV.dahliacandprovidethenecessaryb
7、asisofthestudyofMSformationandthecontrolofV.dahliae・OurresearchestablishedthefoundationforfurtherfunctionalstudyoflaccasegenesinvolvedwithmelaninduringMSformationinV.dahliae・Keywords:Verticilliumwiltofsmoketree;Verticilliumdahliae;Microsclerotialformati
8、on;Laccase0引言黄扌卢枯萎病是由大丽轮枝菌(Verticilliumdahliae)侵染黄扌卢(Cotinuscoggygria)引起基金项目:基金项目:高等学校博士学科点专项科研基金(20100014120018);国家自然基金(31000302)作者简介:肖书笑(1989J,女,硕士研究生,森林保护学林木病理方向通信•联系人:王永林(1982-),男,讲师.病原真菌的功能某因组E-mail:ylwang@bjfii.edu.cn的-•种土传