丙型肝炎病毒基因型的研究进展

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1、万方数据安徽医药AnhuiMedicalandPharnm℃euticalJournal2009Aug；13(8)·869·丙型肝炎病毒基因型的研究进展徐少保1，熊自忠2，高人焘1，沈强1(1．安徽医科大学附属省立医院感染病科，安徽合肥230001；2．安徽医科大学第一附属医院感染病科，安徽合肥230022)关键词：丙型肝炎病毒；基因型丙型病毒性肝炎(viralhepatitisC)是一种主要经血液传播、由丙型肝炎病毒(hepatitisCvirus，HCV)引起的肝脏急、慢性炎症性疾病。目前，全世界丙型肝炎感染率为3％，由此推算约有1．7亿一2．0亿人为丙型肝炎病毒(HC

2、V)感染者⋯，每年新增感染者约为350万人。在我国，丙型肝炎主要通过输血传播旧J，感染总人数超过5000万人，属HCV的中高度感染区。HCV基因分型与病程发展和干扰素治疗应答有一定相关性。本文就丙型肝炎基因型的目前国内外研究进展综述如下。1丙型肝炎病毒概述1．1HCV的基本分子生物学特性丙型肝炎病毒(HCV)属黄病毒科，为单股正链RNA病毒，球形，有包膜，全基因组大小约9379948Int。在3’末端有一个“多肽A尾巴”，核酸序列包含有由341个碱基组成的5’非翻译区，一个含3011个氨基酸的多肽蛋白的巨大的开放读码框架(Openreadingframe，ORF)和由约27

3、个碱基组成的3’非翻译区。ORF编码一个大的前体蛋白，此蛋白可被宿主和病毒蛋白酶加工成结构蛋白(Core、E1、E2和p7)和非结构蛋白(NS2—5)。5’uTR区最为保守，核糖体进入位点位于该区；而3’UTR对于HCVRNA复制是不可缺少的bJ。由于HCV的复制所依赖的RNA聚合酶缺乏3’-5’核酸外切酶校正功能，致使其基因组发生突变的频率较高，从而更容易逃避机体的免疫识别或者抑制宿主，易发生突变MJ。1．2HCV的基因型及命名HCV基因组呈现高度异质性，根据HCV基因组核苷酸序列的差异程度，可将HCV分为基因型(30％一35％)、基因亚型(20％一25％)、分离株(5％

4、一9％)和准种(1％一5％)怕J，目前可分为6个基因型及不同亚型¨J。每种HCV基因型的开放读码框架(ORF)的长度存在着特异性的差别，HCV．1型中ORF长度约9400个核苷酸，HCV-2型中ORF长度是9099个核苷酸，HCV-3型长度是9063个核苷酸。2004年中国《丙型肝炎防治指南》指出旧1，HCVRNA基因分型有助于判定治疗的难易程度及制定抗病毒治疗的个体化方案。1994年根据来自全球范围不同国家和地区从事HCV基因型研究的46位专家联名倡议，推荐使用统一的Simmonds命名系统。按照2005年新达成的HCV基因型命名规则共识mJ，以阿拉伯数字表示HCV基因型

5、，以小写的英文字母表示基因的亚型(如la、2b、3c等)。2丙型肝炎病毒的基因型的检测丙型肝炎病毒的基因型的检测有很多种方法。直接测序法是采用特异性PCR引物扩增部分病毒基因组区域，联合多部位的测序结果进而描绘系统进化树。其优点是能够区分所通讯作者：熊自忠，男。主任医师，教授，硕士生导师，E—mail：xiongzizhong@126．com有已知的亚型和描述新的变异，目前仍为一HCV基因分型的“金标准”。但是操作繁琐，成本较高，对混合感染不易确定。型特异性RT—PCR方法成本较低，不需要特殊设备，是通过对套式RT-PCR引物设计的优化，使扩增片断大小不同，达到分型目的。此

6、方法可将6个基因型完全分开，并可以区分混合感染。缺点是有时会出现较弱的扩增条带，难以判断。针对HCV基因分型方法的不足，各国学者都在通过不同角度改进，新方法也不断出现，如型特异性探针杂交法、基因芯片法、限制性片断长度多态性(RFLR)法、荧光共振能量转移探针的解离曲线分析法、异源分子迁移率分析(HMA)法以及应用人工合成的血清型特异性肽段经酶免法检测等。邱国华等¨1通过对限制性片断长度多态性(RFLR)法方法的改进，建立了ABC酶切三步法，适用于我国感染人群检查，但不足是技术流程相对比较复杂。需要指出的是，上述各种方法所得结果会有一定差异。一些方法目前只是实验室方法，还没有

7、商品试剂供应。3丙型肝炎病毒的基因型的地理分布特征HCV基因型分布存在地理性差异。基因型la是第一个被鉴定的序列，多见于美国，基因型Ib广泛分布于亚洲各国，同时在美国、欧洲、中国和13本的感染病例也较高。基因型2a和2b占全球HCV基因型的10％一30％，遍布在北美、欧洲、中国和日本等地，而基因型2c仅在意大利北部发现。基因型3在印度半岛、东南亚和印度尼西亚较为突出，其中基因型3a特别在北欧、美国地区的药物注射者中流行，通常混合感染基因型1a旧o。基因型4分布在非洲中北部和地中海东部国家(埃及、意大利)。基因型5在