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《DB21T 2323-2014 亚洲Ⅰ型口蹄疫病毒RT-PCR检测方法》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、ICS11.220B41DB21辽宁省地方标准DB21/T2323—2014亚洲Ⅰ型口蹄疫病毒RT-PCR检测方法MethodofRT-PCRforthedetectionoftypeAsia1footandmouthdiseasevirus2014-07-05发布2014-09-05实施辽宁省质量技术监督局发布DB21/T2323—2014前言本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。本标准由辽宁省动物疫病预防控制中心提出。本标准由辽宁省畜牧兽医局归口。本标准起草单位:辽宁省动物疫病预防控制中心、辽宁省动物医学研究院。本标准主要起草人:杨本勇、曹东、李井春、王宏燕、李树博、段亚
2、良、刘坤洋、何利昆、王军、丁静、张鑫、王芬、王海波1DB21/T2323—2014亚洲I型口蹄疫病毒RT-PCR检测方法1范围本标准规定了亚洲I型口蹄疫病毒(FMDV-AsiaI)RT-PCR检测方法的实验材料、仪器设备、试剂、操作步骤和结果判定,并介绍了其原理。本标准适用于动物及动物产品中亚洲I型口蹄疫病毒的检测。2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。分析实验室用水规格和试验方法兽医实验室生物安全技术管理规范3缩略语下列缩略语适用于本标准。DEPC(d
3、iethypyocarbonate)焦炭酸二乙酯RNA(ribonucleicacid)核糖核酸RT-PCR(reversetranscription-PCR)反转录聚合酶链反应dNTP(deoxy-ribonucleosidetriphosphate)脱氧核苷酸三磷酸bp(basepair)碱基对O-P液(oesophagus-pharyngeal)牛、羊食道-咽部分泌物EB(Ethidiumbromide)溴化乙锭FMDV-AsiaI(Foot-and-mouthdiseasevirusserotypeAsiaI)亚洲I型口蹄疫病毒4原理FMDV是一种RNA病毒。RNA反转录产生的c
4、DNA可作为PCR模板进行扩增。根据FMDV-AsiaI保守基因序列设计一对引物,在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以引物为延伸起点,通过变性、退火和延伸,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA。5实验材料、仪器设备和试剂5.1实验材料眼科剪、眼科镊、称量纸、1.5mL灭菌离心管(经DEPC水处理)、0.2mL薄壁PCR管、500mL量筒、500mL三角瓶、吸头(10µL、200µL、1000µL)。2DB21/T2323—20145.2仪器设备分析天平、低温高速离心机、PCR扩增仪、电泳仪、电泳槽、紫外凝胶成像仪(或紫外分析仪)、-70℃冰箱、微波炉、组织研磨器、-20℃冰
5、箱、可调移液器(最大量程分别为2µL、20µL、200µL、1000µL)。5.3试剂5.3.12.5mmol/LdNTP。5.3.2引物:上游引物5′-GCGCTCGTCCACACAGGACCGG-3′,下游引物5′-CATGTCCTCTTGCATCTGGTT-3′。5.3.310倍PCR缓冲液。5.3.41%溴化乙锭(EB)溶液(见第A.1)。5.3.5电泳缓冲液(50倍)(见第A.2)。5.3.61%琼脂糖凝胶(见第A.3)。5.3.775%乙醇(见第A.4)。5.3.8灭菌DEPC水(见第A.5)。5.3.9上样缓冲液(见第A.6)。5.3.10电泳缓冲液(1倍)(见第A.7)。
6、5.3.11磷酸盐缓冲液(0.04mol/L、pH7.4)(见第A.8)。5.3.12其他试剂:10U/µLAMV反转录酶、50U/µLRNA酶抑制剂、5U/µLTaqDNA聚合酶、异丙醇、25mmol/L氯化镁溶液。注:除另有规定,所用试剂均为分析纯,水为符合GB/T6682-2008的灭菌双蒸水或超纯水。6操作步骤6.1样品的采集、保存运送和处理6.1.1样品采集6.1.1.1水泡液:未破裂水泡中的水泡液用灭菌注射器吸出后装入灭菌小瓶中(可加青霉1000UI/mL,链霉素1mg/mL),加盖密封,编号。6.1.1.2水泡皮:剪取新鲜水泡皮3~5g放入灭菌小瓶中,加6~10mL(2倍体
7、积)50%甘油-磷酸盐缓冲液(0.04mol/L、pH7.4),加盖密封,编号。6.1.1.3组织样品:无菌采集淋巴结、脊髓等组织样品3~5g装入洁净的小瓶内或其他灭菌容器,编号。3DB21/T2323—20146.1.1.4O-P液样品:被检动物在采样前禁食(可饮水)12小时,以免反刍胃内容物严重污染O-P液。采样探杯在使用前经0.2%柠檬酸或2%氢氧化钠浸泡5min,再用自来水冲洗。每采完一头动物,探杯要重复进行消毒和清洗。采样
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