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《家蝇转录组丝氨酸蛋白酶抑制因子分析》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、·416·中华卫生杀虫药械2014年10月第20卷第5期ChinJHygInsect&EquipOct2014Vol.20No.5【论著】家蝇转录组丝氨酸蛋白酶抑制因子分析1,233443王蕾,齐梅,刘长存,辛正,王永明,李殿香(1.山东省医学科学院,山东济南250022;2.济南大学-山东省医学科学院医学与生命科学学院,山东济南250022;3.济南大学生物科学与技术学院,山东济南250022;4.济南市疾病预防控制中心,山东济南250021)摘要:目的为了寻求有效控制家蝇的分子靶标,对家蝇丝氨酸蛋白酶抑制因子的主要种类进行初步探讨。方法从家蝇
2、转录组数据库中,筛查出所有注释为丝氨酸蛋白酶抑制因子的Unigenes,利用生物信息学分析技术,对这些Unigenes序列做比对、聚类与结构功能特点分析,并参照已报道的其他物种的丝氨酸蛋白酶抑制因子,对家蝇丝氨酸蛋白酶抑制因子进行初步分类。结果从家蝇转录组库中共筛选出133条注释为丝氨酸蛋白酶抑制因子的Unigenes,其中,值得分析的序列有59条,具有典型丝氨酸蛋白酶抑制因子结构域的有22条,它们被初步分成11类。结论本研究首次鉴定了11种家蝇丝氨酸蛋白酶抑制因子基因,为生物控制家蝇提供了重要的候选靶标。关键词:家蝇;丝氨酸蛋白酶抑制因子;转录
3、组分析;基因鉴定中图分类号:R384.2文献标识码:A文章编号:1671-2781(2014)05-0416-05AnalysesofserineproteaseinhibitorsfromthetranscriptomeofMuscadomestica1,233443WANGLei,QIMei,LIUChang-cun,XINZheng,WANGYong-ming,LIDian-xiang(1.ShandongAcademyofMedicalSciences,Jinan250022,China;2.SchoolofMedicineandLife
4、Science,ShandongAcademyofMedicalSciences,UniversityofJinan,Jinan250022,China;3.SchoolofBiologicalScienceandTechnology,UniversityofJinan,Jinan250022,China;4.JinanCityCenterforDiseaseControlandPrevention,Jinan250021,China)Abstract:ObjectiveInordertoseekthemoleculartargetsforeff
5、ectivelycontrollingMuscadomestica,theserineproteaseinhibitorsofhouseflywereclassifiedpreliminarily.MethodsBasedonthefunctionalannotationofuni-genesinM.domesticatranscriptomicdatabase,thetargetunigenesannotatedasserineproteaseinhibitorswerescreenedout.Theiralignment,clustering
6、,characteristicsanalysisinstructureandfunctionwerefinishedbybioinfor-maticsanalysistechnology.SerineproteaseinhibitorsofM.domesticawereclearlystatedwithreferencetothetypeofserineproteaseinhibitorsofotherspecies.Results133unigenesannotatedasserineproteaseinhibitorswerefil-tere
7、doutfromM.domesticatranscriptomicdatabase.59unigeneswerevaluabletobefurtheranalyzed,and22uni-geneswiththetypicaldormainofserpinwerepreliminarilydividedinto11categories.ConclusionThisisthefirstreportthatM.domesticamayhave11serineproteaseinhibitorgenesandthattheymaybeimportantc
8、andidatetargetsforbiologicalcontrollinghouseflies.Keywords:Muscadome
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