《兰大分子》PPT课件

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1、Chapter2.蛋白质的共价结构蛋白质（protein）的共价结构即指蛋白质的氨基酸组成及其排列顺序，是蛋白质的一级结构(primarystructure)。2.1蛋白质通论2.1.1蛋白质的化学组成和分类一、化学组成C,50%;H,7%;O,23%;N,16%;S,0~3%;其它,微量。蛋白质的平均含N量为16％，是凯氏定氮法的计算基础：蛋白质＝蛋白氮×6.25。即1gN相当于6.25g蛋白质的量。二、分类单纯蛋白质simpleprotein:只是由氨基酸组成。缀合蛋白质conjugatedprotein:由氨基酸和其他的化学成分组成。非蛋白部分为辅

2、基（prostheticgroup）或配体（ligand）单纯蛋白质的分类：按照溶解度分类如下清蛋白球蛋白谷蛋白谷醇溶蛋白组蛋白鱼精蛋白硬蛋白4.缀合蛋白按照非氨基酸组分分类如下：（1）糖蛋白（2）脂蛋白（3）核蛋白nuclearprotein（4）磷蛋白（5）金属蛋白（6）血红素蛋白hemoprotein（7）黄素蛋白flavoprotein5.蛋白质按照功能分类：酶enzyme,调节蛋白regulatoryprotein,转运蛋白，贮存蛋白收缩和游动蛋白结构蛋白支架蛋白保护和开发蛋白异常蛋白exoticprotein.2.1.2蛋白质分子的大小和形状

3、根据形状和溶解度，蛋白质可以分为三类：纤维状蛋白质(fibrousprotein):起结构作用，线性结构，简单而有规则。不溶于水和稀盐酸。如：胶原蛋白、弹性蛋白、胶蛋白和丝蛋白等。球状蛋白质(globularprotein):水溶性良好。亲水侧链暴露于外，疏水侧链埋藏在球体内部。为活性蛋白质。膜蛋白(membraneprotein)与膜系统结合，含亲水的氨基酸残基比胞质蛋白少。2.蛋白质的相对分子质量范围：6，000到1x106或更大一些。下限一般认为从胰岛素开始，为5，700的相对分子量。3.单体蛋白质(monomericprotein)：由一条多肽链

4、组成。如肌红蛋白。寡聚蛋白质(oligomeric)或多聚(polymeric)蛋白质：有两条以上的多肽链组成。每条多肽链为亚基或亚单位（subunit)。如血红蛋白。4.对于简单的蛋白质，用110除它的相对分子质量极可约略估计其氨基酸残基的数目。2.1.3蛋白质构象和结构的组织层次每一种蛋白质都有自己特有的空间结构或三维结构，称为蛋白质的构象。构型和构象的区别：构型是指在具有相同结构式的立体异构体中取代基团在空间的取向，不同的构型如果没有共价键的破裂是不能互变的；构象是指具有相同结构式和相同分子的构型的分子在空间里可能的多种形态，构象形态间的改变不涉及

5、共价键的断裂。一个给定的蛋白质理论上可以采取以多种构象，但在生理条件下，只有一种或几种在能量上是有利的。蛋白质的不同组织和结构层次：有四个组织和结构层次。一级结构是由氨基酸残基决定的，高级结构是由非共价力推动的。2.1.4蛋白质功能的多样性：催化调节转运贮存运动结构成分支架作用防御和进攻异常功能。2.2肽(peptide)肽（peptide）是氨基酸的氨基和羧基首尾相连形成的链状化合物（少数为环状化合物），肽也被称为肽链。蛋白质区别于多肽的地方在于蛋白质是由一条或多条肽链组成的生物大分子。多肽的研究在当前的生物化学领域内具有许多重要的理论和现实意义。2.

6、2.1肽和肽键的结构氨基酸相互之间连接的基本方式就是酰氨键，在蛋白质和多肽中称之为肽键（peptidebond）。有关肽键的依据来自五个方面。（1）较少的游离氨基和羧基；（2）蛋白水解酶能可逆地水解或合成人工合成的多肽；（3）多肽链的双缩脲反应现象；（4）物理化学方面的证据；（5）天然生物活性蛋白质的人工全合成。2.肽的命原则：12个氨基酸残基以下直接用数字命名；12个以上为寡肽；20个以上为多肽。但并不绝对。根据肽链中的氨基酸残基的顺序，从N端向C端命名，称为某氨酰某氨酰某氨酰某氨酰……某氨基酸。Ser-Gly-Tyr-Ala-LeuSer-Gly-T

7、yr-Ala-Leu-OH3.肽键的骨干是由－N－C－C序列重复排列而成，称为共价主链(mainchainorbackbone)。各种肽的共价主链都是一样的，但侧链R基的序列不同。肽键中的酰氨键称为肽基(peptidegroup)或肽单位(peptideunit)。肽基C、O和N原子之间的共振相互作用反式构型的肽键肽平面2.2.2肽的理化性质一、（1）和氨基酸一样，肽也是一个两性的化合物，其晶体为离子晶体。但其肽键中的酰胺氢不解离，肽的酸碱性主要决定于游离末端的α-氨基、α-羧基以及侧链上可解离基团。（2）肽与氨基酸解离基团pKa值的区别。（3）肽的滴定

8、曲线。当溶液pH>pKa,占优势的离子形式是该侧链的共轭碱；相反时，占优势的离子