棉花纤维发育相关基因时空表达及其生物信息学分析

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1、AdissertationsubmittedtoZhengzhouUniversityforthedegreeofMasterTheAnalysisofTemporalandSpatialExpressionandBioinformaticsonCottonFiberDevelopmentGenesByShichaoLiuSupervisor：Prof．BaomingTianBiologicalEngineeringSchoolofLifeSciencesMay,2014原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行

2、研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的科研成果。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。学位论文作者：引也盔至学位论文使用授权声明日期：弘7中年6月7牛日本人在导师指导下完成的论文及相关的职务作品，知识产权归属郑州大学。根据郑州大学有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅；本人授权郑州大学可以将本学位论文的全部或部分编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或者其他复

3、制手段保存论文和汇编本学位论文。本人离校后发表、使用学位论文或与该学位论文直接相关的学术论文或成果时，第一署名单位仍然为郑州大学。保密论文在解密后应遵守此规定。学位论文作者：知I也超日期：≯脚年‘冈／夸园摘要棉花纤维作为世界上重要的天然纤维原料，其在纺织工业的重要性不言而喻，提高棉花纤维品质成为研究棉花的首要目的。随着基因克隆技术的不断改进，大量的在棉纤维发育阶段优势或特异表达的基因被克隆出来。本实验挑选了7个己报道的棉纤维发育优势表达基因(GhACTl、GhCADl、GhCCRl、GhExpl、GhExp2、GhCIPKl和G11PL)，首

4、先利用实时荧光定量PCR技术，分析了以上7个基因分别在纤维品质具有差异性的陆地棉、海岛棉和亚洲棉的0DPA、5DPA、10DPA、15DPA、20DPA、25DPA的相对表达量，明确基因表达规律，并探讨基因表达量与纤维品质的关系；其次对这些基因的蛋白质理化性质、亚细胞定位和N端信号肽、二级结构等生物信息学进行了预测分析。实时荧光定量PCR结果显示7个基因均在纤维伸长期具有较高表达量，但是遗传背景的不同，7个基因在三个棉花品种纤维发育时期的表达谱也有差异。通过对比GhExpl和GhExp2的相对表达量发现，GhExpl的表达量远远高于GhExp

5、2，推测GhExpl基因的作用对纤维伸长更为关键。根据棉属的三个栽培种的纤维差异性，分析基因表达量与纤维品质之间的关系，推测GhACTl和GhExpl基因的高表达可能对优良纤维品质的形成具有一定作用，面其它基因的表达水平与纤维品质关系不明显。生物信息学预测结果显示7个基因的表达产物均为水溶性蛋白，二级结构主要由螺旋、折叠和无规卷曲构成，只有GhExpl、GhExp2、GhPLl三个基因的表达产物N端具有信号肽。关键词：棉花纤维品质实时荧光定量PCR基因表达规律AbstractCoaonfiberasoneofthemostiInpoaantn

6、aturalfiberrawmaterialsintheworld，itsimportanceisself-evidentinthetextileindustry,improvingthequalityofthecoUon助erbecomeaprimaryobjectiveofthecotton．Withthecontinuousimprovementofgenecloningtechnology,alargenumberofadvantageorspecificexpressiongenesincoRonfiberdevelopmentpe

7、riodhavebeencloned．Inthisexperimentwechosensevenreportedcottonfiberdevelopmentadvantageexpressedgenes(GhACTl，GhCADl，GhCCRl，GhExpl，GhExp2，GhCIPKlandGhPL)，firstofall，usingreal—timefluorescentquantitativePCRtechnology,analyzestherelativeexpressionofspecificofthesevengenesabove

8、respectivelyintheGhirsutum，GbarbadenseandGarboreumwhosecoRonfiberqualityhasdiffere