家族遗传与非家族遗传性病理性瘢痕的基因芯片谱研究

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1、第4_4卷第2期哈尔滨医科大学学报Vo1．44．No．21422010年4月JOURNALOFHARBINMEDICALUNIVERS兀’YApr．，2010临床研究家族遗传与非家族遗传性病理性瘢痕的基因芯片谱研究王国胜，李正天h，姜涛，田茂霖(1．哈尔滨医科大学第一临床医学院普外科，黑龙江哈尔滨150001；2．北京大学第一医院普外科，北京100034)[摘要]目的应用cDNA微阵列(基因芯片)技术和生物信息学分析对家族遗传与非遗传性病理性瘢痕基因表达差异进行分析和研究。方泼采集临床的遗传性与非遗传性病理性瘢痕样品各5例，将480种人类基因PCR产物制成微阵列表达谱芯片；提取瘢痕疙瘩和

2、正常皮肤的总RNA，并纯化mRNA。等量的两种瘢痕组织的mRNA分别进行标记，合成，杂交，洗膜后，计算机扫描分析比较两种组织中差异表达的基因，并利用生物学数据库进行分析。结果遗传性瘢痕组织与非遗传性瘢痕组织相比，显著差异表达基因有65个，最后通过生物信息学分析确定29个差异表达基因，构成遗传性瘢痕与非遗传性瘢痕的差异表达谱。结论遗传性瘢痕的形成是复杂的病理生理过程，受多基因表达调控。进一步的研究将有助于揭示遗传性瘢痕形成机制以及针对遗传性瘢痕的治疗。[关键词]瘢痕；基因表达；基因芯片；皮肤组织[中图分类号]R619．6[文献标识码]A[文章编号]1000—1905(2010)02—014

3、2—06Analysisofdiferentialgeneexpressionbetweenheredofamilialandno-heredofamilialpathologicalscarsWANGGuo-sheng，LIZheng—tian，JIANGTao，etal(DepartmentofGeneralSurgery，TheFirstClinicalCollege，HarbinMedicalUniversity，Harbin150001，China)Abstract：0bjectiveToinvestigateandanalysethedifferentialgeneexpre

4、ssionbetweenheredofamilialandno-heredofamilialpathologicalscarsbyusingcDNAmicroarrayandbioinformaticsanalysis．MethodsFiveclinicalpathologicalsamplesofheredofamilialandno—heredofamilialscarswerecollected；cDNAmicroarraywasmadeofPCRproductsof480humangenes；thetotalRNAofkeloidsandnormalskinwereextract

5、edandpurifiedintomRNA．AftertheequalamountsofmRNAoftwokindsofscartissueweremarked，integrated，hybridizedandwashed，thediscrepantexpressiongenesweresacnnedandcomprisedbycomputerandanalyzedbybiologicaldatabase．ResultsSixty—fivegenesofsignificantlydiscrepantexpressionwerediscoveredbycomparedwiththetwok

6、indsofscars．Then，thefinal29geneswereidentifiedbybioinformaticanalysis，whichwereconstituteddifferentialexpressionprofilingofhered—ofamilialandno—heredofamilialscars．ConclusionAvarietyofgenesregulatestheformationofhered—ofamilialpathologicalscars，whichisacomplicatedpathophysiologyprocess．Furtherana

7、lysisoftheiden·tifedgenesmaybeusefulforrevealingthemolecularmechanismofheredofamilialpathologicalscarsand[收稿日期]2009—02—24[基金项目]黑龙江省教育厅科学技术研究项目(11511204)[作者简介]王国胜(1968一)，男，黑龙江哈尔滨人，副主任医师，硕士。}通讯作者第2期王国胜，等．家族遗传与非家族遗传性病理性瘢痕