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《基于pc_linux的核酸序列电子延伸系统的构建及其应用new》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、遗传F+@+(-*(,3H/Y/0I)"(C!):&$]&C,"$$"研究报告基于!"#$%&’(的核酸序列电子延伸系统的构建及其应用张成岗!,孙焕东",欧阳曙光!,吴松峰!,贺福初!(!#军事医学科学院放射医学研究所,"#军事医学科学院情报信息研究所,北京!$$%&$)摘要:新基因全长’()*序列的获得常常是分子生物学工作者面临的难题。人类基因组计划及其相关计划的实施导致了大量表达序列标签(+,-)的产生。利用一定的生物信息学算法,这些+,-序列往往可用来对新基因片段进行延伸。采用./012操作系统,利用3
2、4567软件和89:5;软件以及+,-数据库在微机上构建了+,-序列的电子延伸系统,并对来自于人胎肝的!!<%=条+,-序列和&!!条插入片段全长’()*序列进行了电子延伸,结果显示%<><条+,-序列和<%?条插入片段全长’()*序列得到了程度不等的延伸,部分结果通过@*A+实验得到证实。该套系统可高效地、规模化进行+,-序列的延伸,可为通过实验获得新基因全长’()*序列提供重要线索。关键词:生物信息学;表达序列标签;’()*;电子序列延伸;微机;./012操作系统中图分类号:B>&C文献标识码:*文章编号:
3、$"&>(""$$")$!D$$&$D$&")&*+,’-+%)&.&/0112%-.+%)&)3.&!"#!$!%&42)&5.+%)&67*+89)3:’-28%-0-%/68;’8&-8!,,K)F150JLM0I",NKO*)G,91JI150I!,PK,M0IJQH0I!,F+R1J’91!EF*)GA9H0IJI50I(!!"#$%$&’(&)*$*+*#,-./0$/*$,&1#0$2$;"!(&-,34/*$,&5#&*#3,-62/0#47,-1$8$*/371#0$2$\$
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5、6HV1H0’H6#356HLM05;H:6M054’MS;17H:’M1;4HLZ/79./012M;H:57/0I6T67HS50L+,-L575U56H,79H345676MQ7Z5:H50L89:5;6MQ7Z5:HZH:H16HL7M’M067:1’75;457QM:SQM:$&)$8$2,H4M0I57/M0MQ+,-6/0M1:45U#-9H;H:QM:S50’HZ567H67HL16/0I!!<%=+,-6HV1H0’H650L&!!;5:7/54D4H0I79’()*6HV1H0’H6#@H6
6、1476LHSM067:57HL7957%<><+,-50L<%?’()*6HV1H0’HZH:HH4M0I57HL16/0I79/66T67HS#-91679H;457QM:S6HHS67MUH5Q567Z5TQM:Q144D4H0I79’()*6HV1H0’H’4M0/0IMQ0HZIH0H6#=87>),/*:U/M/0QM:S57/’6;H2;:H66HL6HV1H0’H75I;’()*;$&9$8$2,6HV1H0’HH4M0I57/M0;;H:6M054’MS;17H:;./012M;H:57/M0
7、6T6J7HS人类基因组计划(F1S50GH0MSH8:MYH’7,FG8)重于从基因组到新基因发现的角度进行研究,而为的实施全方位地推动了新基因的研究[!]。FG8侧了加速新基因的克隆过程,很多实验室采用收稿日期:"$$!D$"D$%;修回日期:"$$!D$>D$"基金项目:军事医学科学院科技创新研究启动基金(??$&!$&)、国家“%=<”项目(%=<—!$"—!$—$C—$C)、国家杰出青年科学基金(="$&!C)、国家自然科学基金重点项目(><$$"C>)与国家自然科学基金项目(
8、?$$$C!、?$$$>C)部分资助作者简介:张成岗(!?>$D),男,陕西白水人,!??"年于复旦大学获学士学位,!??&年于第四军医大学获硕士学位,!??%年于第三军医大学获博士学位,"$$$年于军事医学科学院放射医学研究所完成博士后研究;研究方向:分子生物学、生物信息学、神经生物学通讯联系人:贺福初:-H4:($!$)==?