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时间:2019-02-08
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1、分子机制研究套路(二)蛋白翻译后修饰-泛素化课题:蛋白A调节蛋白B泛素化和降解的研究1.概念介绍:大多数蛋白均需进行翻译后修饰来扩增蛋白质组的数量,调节蛋白质的稳定性、分布和功能。翻译后修饰包括磷酸化、泛素化、亚硝基化、氧化等等。泛素化是在蛋白质翻译后,通过将泛素分子结合到靶蛋白上,形成多聚泛素链,带有多聚泛素链的靶蛋白可被26S蛋白酶体识别、降解。泛素是76个氨基酸的多肽片段,包含7个赖氨酸残基,允许同时发生聚泛素化反应。在赖氨酸-48聚泛素化会导致其通过28S蛋白酶体降解。然而赖氨酸-63可以改变细胞的功能,包括运输和DNA修复。可见,单一
2、的泛素化会依据其作用位点的不同而产生不同的结果。它和泛素激活酶(E1)、泛素结合酶(E2)、泛素连接酶(E3)和蛋白酶体组成了泛素-蛋白酶体系统(Ubiquitin-ProteasomeSystem,UPS)。UPS是细胞内非溶酶体途径蛋白质降解通路,不仅降解变性、异常或起短暂作用的蛋白质,而且能降解转录因子、内膜蛋白和细胞周期蛋白等天然蛋白,对于维持蛋白质稳定状态、调节细胞程序性死亡和控制细胞周期等过程有重要的作用。UPS还可作用于转录因子及体内的某些信号传导通路,并参与细胞凋亡、主要组织相容性复合体抗原递呈、细胞周期以及细胞内信号传导等多个
3、细胞生理活动,对维持细胞正常生理功能具有重要意义。2.示意图:图1UPS的发生依赖于三种酶的参与。E1通过硫酯键将E1酶半胱氨酸与泛素分子连接在一起,其能量来源于ATP水解作用;E2与泛素蛋白连接于激活的半胱氨酸位点;E3负责将泛素化蛋白与靶蛋白结合在一起,3.研究思路:3.1蛋白A降低蛋白B的表达量33.1.1蛋白A介导蛋白B降解33.1.2蛋白A降解蛋白B的特异性33.1.3蛋白A介导蛋白B降解呈剂量依赖性33.1.4蛋白A调节蛋白B稳定性43.2蛋白A介导蛋白B降解位于蛋白酶体系统43.2.2蛋白B降解位于蛋白酶体系统43.2.3蛋白A介
4、导蛋白B降解位于蛋白酶体系统53.3赖氨酸XXX位点为蛋白A介导蛋白B泛素化靶位点53.3.1蛋白A介导蛋白B泛素化53.3.2赖氨酸XXX位点为蛋白A介导蛋白B泛素化靶位点53.4蛋白A氨基端与羧基端在蛋白B降解中的作用63.4.1蛋白A氨基端与蛋白B降解63.4.2蛋白A羧基端与蛋白B降解63.4.3蛋白A羧基端与蛋白B泛素化63.1蛋白A降低蛋白B的表达量3.1.1蛋白A介导蛋白B降解蛋白A是泛素蛋白酶体系统中的一个调节分子。前期研究结果显示,蛋白A可以调节蛋白B所在家族的某些分子的的泛素化和降解。为探讨蛋白A对于蛋白B的调节方式,构建质
5、粒蛋白A-V5和蛋白A-HA,并将两种质粒分别转染HEK293细胞48小时后,收集细胞,采用Westernblot方法检测其蛋白表达水平,结果如图3.1显示,两种质粒转染HEK293后,均可以下调HEK293细胞中内源性的蛋白B的表达。3.1.2蛋白A降解蛋白B的特异性为探讨蛋白A介导蛋白B降解的特异性,我们将其他三种蛋白A的家族蛋白X、Y、Z转染HEK293细胞48小时,采用Westernblot方法检测其蛋白B表达水平,结果如图3.2显示,X、Y、Z不能介导蛋白B的降解。3.1.3蛋白A介导蛋白B降解呈剂量依赖性检测蛋白B在若干肿瘤细胞中的
6、基础表达。选择无内源性蛋白B的表达的细胞系(Cell1),采用该细胞系检测过表达蛋白B的稳定性。将蛋白B细胞共同转染蛋白A-V5/HA,结果显示,蛋白A介导蛋白B降解呈剂量依赖性。接下来为进一步检测蛋白A可以下调蛋白B的表达,我们设计了三种不同的蛋白AshRNA(#1、#2、#3),并将其转染Cell1细胞48小时,结果显示,sh蛋白A可以增强蛋白B的表达,进一步验证了实验结果。3.1.4蛋白A调节蛋白B稳定性为研究蛋白A介导蛋白B降解是否是因为其干预编码蛋白B的分子的mRNA的表达,本实验采用RT-PCR方法,检测蛋白A对蛋白BmRNA表达量
7、的影响。将HEK293细胞分别转染空质粒或者蛋白A-V5质粒,提取RNA,而后设计蛋白B引物行RT-PCR检测。结果显示,蛋白A对蛋白B的mRNA的表达无影响,证实蛋白A介导蛋白B降解是通过调整其蛋白质的稳定性。3.2蛋白A介导蛋白B降解位于蛋白酶体系统3.2.1饥饿状态诱发蛋白B降解在研究蛋白A介导蛋白B降解的过程中,我们发现Cell1细胞转染蛋白B-V5质粒后,将细胞处于饥饿状态(FBS-free培养基)会降低细胞中蛋白B-V5的表达,并且呈时间依赖性。3.2.2蛋白B降解位于蛋白酶体系统为研究蛋白B降解旁路,我们将蛋白B-V5质粒转染后的
8、CELL1细胞培养液中分别加入蛋白体酶抑制剂(MG-132,20μM)和溶酶体酶抑制剂(Leupeptin,100μM),观察不同时间(0,1h,2h
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