微型dna条形码用于猛禽物种鉴定

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1、微型DNA条形码用于猛禽物种鉴定高航摘要：以猛禽为研究对象，首先采用模拟实验GViW/z’ce?analysis)，将BOLD数据库中230个样本的序列拆成3或6段相同人小(216bp或108bp)的片段，选用Full-barcodc、Mini-barcode216-1和Mini-barcode108-1三个片段数据集以K2P为参数构建NJ树，并进行遗传距离分析得出解析度的准确性依次为84.1%、78.3%、75.2%；然后进行实验验证(Empiricaltest),没计PCR引物扩增40个样本的DNA条形码指定序列5'端114bp、巾间103bp和3'端121bp，分别以单一片段和两两

2、组合后的片段序列数据集为分析基础计®:物种鉴定的准确性，得山114+103bp合并序列为85.0%、114+121bp为85.7%。因此,微型DNA条形码(Minimalistbarcode)鉴定猛禽物种是可行的，和DNA条形码一样均可作为猛禽物种鉴定的可靠依据。关键词：猛禽：DNA条形码：微型条形码：物种鉴定Minimalist-barcodingontheSpeciesIdentificationofRaptorsAbstractThisstudytestifiedthefeasibilityofspeciesidentificationofRaptorswithminimalist

3、barcodes.Wefirsttestedtheinsilicoperformanceof‘mini-barcodes’(216bpor108bp)inspecies-levelidentificationsof230COIsequencesfromBOLDsystem,andcalculatedtheresolutionofthreesegmentsoffull-barcode,mini-barcodc216-1andmini-barcode108-1byneighbour-joining(NJ)analysis.Withthesegmentsdecreasing,theresolu

4、tionofspeciesidentificationlowered(84.1%，78.3%and75.2%,respectively).However，thechoiceoflengthandpositionofmini-barcodeswasimportantintheirabilitytodiscriminateamongspecies.Wegenerated111mini-barcodes(〜100bp)from5rend，middleand3'endofDNAbarcode,respectively.Thecombinatedsegmentsof114+103bpand114+

5、121bpshowedhigheraccuracyat85.0%and85.7%，ascomparedtoothersinspecies-levelidentificationbyNJanalysis.Themini-barcodeswhichproducedspecies-levelresolutioncongruentwithDNAbarcodewerealsovaluablefortheidentificationoftheraptorsspecieswhoseDNAweredegraded.Keywords:Raptors;DNAbarcode;Minimalist-barcod

6、e;Speciesidentification猛禽是鸟类六大生态类群之一，涵盖了鸟类传统分类系统中隼形FI和鸮形FI的所有种，包括鹗、鹰、鸢、雕、梵、鹞、駕、隼、鸮、鸺鹃等次级生态类群，均为掠食性鸟类(李湘涛，2004)。随着年龄、性别、季节和亚种的不同，猛禽在形态上会出现显著变异，对这些猛禽的准确识别鉴定便成为了生物保护工作的基础。过去，人们一直采用传统的形态学分类方法，该方法的一些缺陷造成了生物保护工作的局限(莫帮辉等，2008)。随着现代分子生物技术的发展，利用DNA序列片断信息对生物进行种类鉴定、物种分类地位及种间亲缘关系探讨正在成为一个主流手段。其屮，Hebert提出的线粒体C

7、OI基因指定片段(648bp)为基础的DNA条形码(DNAbarcode)是目前高等脊椎动物，包栝鸟类选川的对物种进行鉴定的标准化DNA片断(Hebertez2004b;Yooetal.,2006;Kerretf//.，2007)。DNA条形码是对形态学方法的强者力补充，它可使对物种的鉴定过程实行自动化、标准化和全球化，是分类学家•I•分有益的分子T.具(SchinddandMiller,2005)o但是，通过DNA条形码来鉴定物种