如何用flowjo分析accuric6数据

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1、如何用Flowjo分析AccuriC6数据作者：蔡何清，Flowjo技术专员S前市场有很多流式仪器，包括几家大的公司如BD,贝克曼等。Flowjo做为一款优秀的流式数据分析软件，可以兼容几乎所有流式仪器采集的数据，可以弥补其它机器自带软件的分析功能不足的缺憾，这也是Flowjo备受欢迎及推崇的原因。今天将详细介绍如何用Flowjo来分析BD公司的机器AccuriC6采集的数据。AccuHC6是一款全功能、双激光的小型桌面流式细胞仪，有其独特的优势。但是AccuriC6自带的CFlow软件在分析流式数据方面还存在一些进步的空间，

2、比如：缺乏完善的图片叠加功能，尤其是其直方图叠加的效果有待加强；缺乏细胞周期分析工具、增殖分析工具以及动力学分析工具。Flowjo是目前直接可以和它兼容的流式数据分析专业软件，满足用户的数据分析要求。实际上，用Flowjo分析AccuriC6的流式数据与用Flowjo分析苏他流式细胞仪采集的流式数据是一样的。只不过由于AccuriC6在采集数据的吋候不需要设置电压等特点，在分析AccuriC6数据的时候要做一些简单的处理。这篇博文将对这些处理步骤做详细的介绍。一、在AccuriC6将数据导出为FCS格式ISAC制定的流式数据的

3、标准格式为FCS格式，AccuriC6的CFlow软件默认的数据保存格式为其特有的C6格式。因此，在用Flowjo分析AccuriC6数据之前，需要将数据转换为FCS格式。可参考下面的操作步骤：1.打开CFlow软件，点击Hie菜牢，在下拉菜車中选择OpenCFlowFileorTemplate,导入采集到的C6格式的数据2.点ttiFile菜单，在下拉菜单中选择ExportFCSFile或者ExportALLSampleasFCS二者的区别是：ExportFCSFile:将选定的某个datawell(sample)输出为FC

4、S格式的数据，并保存到用户自建的文件夹里ExportALLSampleasFCS：将所有的datawell(sample)输出为FCS格式的数据，并保存到“CF1⑽-FCSExports”文件夹里，这个文件夹一般在桌面上UntilledWorkspace‘[Fk)w»NeE»j»tDisplayh^rumerttAfcodtUpcn乙HowhjfeorempireHewCRowFIteSaveCFlowhieSave«TerrpbtetmpcrtFCSFte...ExportFC5Fte…ExportAtLSairptesas

5、K5“PrintSetectedItenwf7QtM~cr-789101112A7A8M3A1OAllA1B7BeBQG10B11BmE1F1y'2E2F2PJE3F3l>4E4F4E5F5Eere0767F7D«eeF8：)G£9r0MOeionoDllE11Fli[)eF010203糾Wo«G768•>0G10Oil0MtM2H3H4M5HOH7M8HOM10HitHC7CG：0C10C11C二、调节坐标轴的范围由于AcciiriC6在采集数据的吋候不需要设置电压，而iLC6能够采集到的信号范围位于1-16777216(1

6、0()-10722),流式图中的细胞群可能会由于坐标轴的范围过大而被压缩在左下角的位置，如图2所示：Tj15Mvesco::vess10M5M5M10M15MFSC-A：：FSC-A▼豳这时我们需耍合理调节坐标轴的范围，使细胞群显示亍流式阁的中间位置，从而能明显地看到细胞分群，便于我们设门。按照以下步骤操作：1.点击坐标轴右边的T按钮（图3），在下拉菜单中选择ChangedisplayedparameterrangeFSC-A：：FSC-A►Options►ActiveGate►StatisticsCount:20000/20

7、000100.0%UseLinearAxisUseLogAxisChangedisplayedparameterrange…Auto-calculateextranegativedecadesApplytoallFSC-AApplytoallcompensatedparametersRemovetransforms1.打开调节坐标轴范围的对话框（图4）,在其中输入合适的范围，Min为坐标轴的最小值，Max为最大值图41.在修改坐标轴范围的时候，输入数值后，点击Apply按钮查看调整后的效果,如果效果不好，再重新输入数值，直到达

8、到理想效果后（如图5）再点击0K按钮500K-v—oss:

9、图5三、对于己经在AccuriC6上进行过焚光