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1、姓名:学号:专业:高斯计算分子的基本流程:(1)利用高斯View建立一个分子模型,保存为gif格式。(2)用高斯03对该分子进行几何优化、单点能计算和频率计算。①几何优化:用高斯03调用已经建好的甲烷模型(格式为gif),用#TRHF/6-31G(d)OptTest命令对其进行优化。其中分子电荷和自旋多重度分别设定为0、1。优化前分子输入的坐标为:Standardorientation:--------------------------------------------------------------------------------
2、-----------------------CenterAtomicAtomicCoordinates(Angstroms)NumberNumberTypeXYZ-------------------------------------------------------------------------------------------------------1600.0000000.0000000.0000002100.6177650.6177650.617765310-0.617765-0.6177650.617765410-0.6
3、177650.617765-0.6177655100.617765-0.617765-0.617765-------------------------------------------------------------------------------------------------------优化后分子的输出坐标为:Standardorientation:-----------------------------------------------------------------------------------------
4、--------------CenterAtomicAtomicCoordinates(Angstroms)NumberNumberTypeXYZ-------------------------------------------------------------------------------------------------------1600.0000000.0000000.0000002100.6252130.6252130.625213310-0.625213-0.6252130.625213410-0.6252130.62
5、5213-0.6252135100.625213-0.625213-0.625213-------------------------------------------------------------------------------------------------------优化后分子中各原子电荷Mulliken分布:Mullikenatomiccharges:11C-0.7939762H0.1984943H0.1984944H0.1984945H0.198494SumofMullikencharges=0.00000优化后分子的
6、偶极矩:Dipolemoment(field-independentbasis,Debye):X=0.0000Y=0.0000Z=0.0000Tot=0.0000优化后分子Z矩阵的最终结构:其中B为键长,A为两个键形成的键角,D为二面角。以此类推,可以查处分子中各原子的键长,键角,二面角等信息。FinalstructureintermsofinitialZ-matrix:CH,1,B1H,1,B2,2,A1H,1,B3,3,A2,2,D1,0H,1,B4,3,A3,2,D2,0Variables:B1=1.08290142B2=1.082901
7、42B3=1.08290142B4=1.08290142A1=109.47122063A2=109.47122063A3=109.47122063D1=-120.D2=120.②振动频率的计算:在高斯03中,仍调用自己新建的分子模型,用命令#TRHF/6-31G(d)FreqTest对优化后的分子进行振动频率的计算。其中设定分子电荷和自旋多重度分别为0、1。对原模型分子的结构信息进行修改,在MoleculeSpecification栏中将原来的坐标信息全部删除,输入优化后分子的坐标信息:输入的坐标为:Standardorientation:--
8、---------------------------------------------------------------------------