聚丙烯酰胺凝胶 配制方法

聚丙烯酰胺凝胶 配制方法

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1、5×TBE(组份浓度:5×TBE,pH8.3;配制量:1L):称取53.9gTris,27.5g硼酸,量取20ml0.5mol/LEDTA(pH8.0),置于1L烧杯中;加入约800ml超纯水,充分搅拌溶解;加超纯水将溶液定容至1L;室温保存。10%过硫酸铵(组份浓度:10%(W/V)过硫酸铵;配制量:10ml):称取1g过硫酸铵,置于10~50ml烧杯中;加入约8ml超纯水,搅拌溶解;加超纯水将溶液定容至10ml;4℃保存(保存时间为2周左右,超过期限过硫酸铵将失去催化作用)。30%丙烯酰胺(组份浓度:30%(W

2、/V)丙烯酰胺;配制量:1L):称取290g丙烯酰胺,10gN,N'-亚甲基双丙烯酰胺,置于1L烧杯中;加入约600ml超纯水,水浴加热至37℃,充分搅拌至溶解;加超纯水将溶液定容至1L,用0.45μm滤膜过滤除去杂质;并检测该溶液pH值应不大于7;棕色瓶4℃保存。0.1%AgNO3(组份浓度:0.1%(W/V)AgNO3;配制量:1L):称取1gAgNO3,置于1L烧杯中;加入约800ml超纯水,;加超纯水将溶液定容至1L;棕色瓶室温保存。显色液(组份浓度:2%(W/V)NaOH,0.04%(W/V)Na2CO3

3、,0.4%(W/V)37%甲醛;配制量:1L):称取20gNaOH,0.4gNa2CO3,置于1L烧杯中;加入约800ml超纯水,充分搅拌溶解;加4ml37%甲醛溶液,加超纯水将溶液定容至1L;室温保存。10%冰乙酸(组份浓度:10%冰乙酸;配制量:1L):量取100ml冰乙酸,置于1L烧杯中;加入约800ml超纯水,搅拌混匀;加超纯水将溶液定容至1L;室温保存。2.2.6电泳检测2.2.6.1玻璃板清洗首先用去污粉将电泳用玻璃板、胶垫、梳子等反复清洗;然后用Ⅲ级蒸馏水漂洗2~3次,直至玻璃板表面出现均匀水膜,既不

4、聚成水滴,也不成股流下;再用超纯水漂洗1次,晾干;最后用无水乙醇擦拭,晾干备用[74]。2.2.6.2缓冲液贮液和凝胶母液的制备缓冲液贮液用5×TBE,具体配制方法见2.1.2.2,用时稀释5倍。凝胶母液用30%丙烯酰胺,具体配制方法见2.1.2.2。2.2.6.3聚丙烯酰胺凝胶的制备10%非变性聚丙烯酰胺凝胶(两块,约55ml)各组分用量如下[58]:30%丙烯酰胺:18ml5×TBE:11ml超纯水:25mlTEMED:36ml10%过硫酸铵:385ml具体操作步骤如下[75]:首先,按要求组装好垂直电泳板,两

5、块玻璃板的底部用1.5%琼脂糖封边,防止封闭不严而导致聚丙烯酰胺胶液漏出。然后,灌胶。分别量取配比用量的30%丙烯酰胺、5×TBE和超纯水置于100ml烧杯中,用玻璃棒搅拌混匀;然后用微量加样器加入配比用量的10%过硫酸铵和TEMED,加入后聚合即开始,迅速摇匀;立即用玻璃棒引流,将混合液灌注于两块玻璃板之间,灌胶过程一次性完成,避免产生气泡;灌胶完成后,一次性平稳插入样梳以形成点样孔。最后,待聚合完全后往电泳槽中加入1×TBE缓冲液直至没过点样孔,且正负极槽内缓冲液高度应一致。聚合时间一般在30~60min左右,

6、凝胶聚合完全的标志是点样孔附近形成清晰的界面,轻轻拔去样梳,避免破坏点样孔,并立即用电泳缓冲液冲洗点样孔,以清除点样孔中的气泡和未凝固完全的胶液。2.2.6.4电泳取PCR扩增产物5ml与1ml上样缓冲液混合均匀后点入点样孔,用10%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,以20bpDNAladder(Takara)作为分子量标准,缓冲液为1×TBE。接通电源,恒压180~200V,电泳8~10h,直至溴酚蓝距离凝胶边缘约1cm时,停止电泳。2.2.6.5银染、显色具体步骤如下[76-78]:(1)卸下玻璃板,用塑料薄片撬去

7、上面一块玻璃板,并小心除去下方的琼脂糖凝胶;然后将附有聚丙烯酰胺凝胶的玻璃板以凝胶面朝下浸入盛有约200ml超纯水的玻璃器皿中,凝胶即脱落于水中,轻轻摇晃15sec,倒掉液体;(2)加入约200ml0.1%AgNO3,置于摇床之上,以轻摇20min左右,倒掉液体;(3)加入约200ml超纯水,轻摇15sec,倒掉液体;(4)加入约200ml显色液,轻摇5~10min,直至出现清晰带型,倒掉液体;(5)加入约200ml超纯水,轻摇15sec,倒掉液体;(6)加入约200ml10%冰乙酸,固定;(7)用Bio-Rad紫

8、外凝胶成像系统观察,照相以记录电泳结果。1.4.3聚丙烯酰胺凝胶改进的银染方法(1)电泳结束后切断电源,从电泳槽中倒出缓冲液,然后取下胶板,将凝胶从玻板中取出放入装有蒸馏水的瓷盘中,用蒸馏水漂洗2次。(2)银染:加入染色液(0.2%的AgNO3、1%的冰醋酸、10%的无水乙醇)进行银染,然后用蒸馏水漂洗2次。20min(3)显影:加入显影液(3%的无水NaO

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