生物化学课件整理

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1、第三章简单蛋白质：完全由氨基酸残基组成的蛋白质。缀合蛋白质：除蛋白质部分外，还有非蛋白质成分（辅基）。球蛋白：根据蛋白质的溶解度能溶于水或稀盐的一类蛋白质。球状蛋白质：多肽链能够折叠，使分子外形成为球状的蛋白质。稀有氨基酸：蛋白质组成中，除常见的20种氨基酸外，还有一些不常见的氨基酸，如4－羟脯氨酸，它们是常见氨基酸衍生来的。非蛋白质氨基酸：还有300多种氨基酸不参与蛋白质组成，它们以游离状态或结合状态存在于细胞或组织中。多为蛋白质氨基酸的衍生物。 常作为代谢物前体或中间产物。等电点：氨基酸所带正电荷数与负电荷数相等时（净电荷为零时）的溶液pH值。氨基酸等

2、电点pI＝1/2（pKa1＋pKa2）桑格反应桑格试剂：2,4-二硝基氟苯（DNFB）在弱碱性溶液中,DNFB将a-氨基酸转变成黄色的2,4-二硝基苯基氨基酸.（ＤＮＰ）应用:1、鉴定多肽链Ｎ－端氨基酸重要方法2、芥子气毒性原理艾德曼反应试剂：苯异硫氰酸酯（Phenylisothiocyanate,PITC）用途：鉴定多肽链氨基末端AA;蛋白质测序茚三酮反应(Ninhydrinreaction)反应过程：脱氨－脱羧－还原－氨合反应产物：兰紫色沉淀、ＣＯ２用途:定性或定量氨基酸通过测定ＣＯ２或者蓝紫色物质定量大部分氨基酸在远红外和远紫外光区（200nm以下）

3、有吸收，但Tyr（275）,Phe（257）,Trp（280）因苯环上含共轭双键，在近紫外区吸收光，其吸收高峰在280nm左右。A=eCL紫外法测定蛋白质浓度的原理。蛋白质一级结构是指多肽链共价主链的氨基酸顺序及二硫键的位置.肽为AA链，多肽链中的一个AA单位称为AA残基（residue）。肽的特征化反应：（颜色反应）双缩脲反应：碱性硫酸铜反应生成紫红或兰紫色络和物。定量测定多肽。注意：必须是三肽以上才发生黄色反应：硝酸反应生成黄色二硝基苯衍生物，如酪氨酸和苯丙氨酸肽键的水解蛋白质一级结构的测定（一）蛋白质测序（直接法）（1）测定蛋白质分子中多肽链的数目（

4、sanger法）根据反应的N末端的数目确定蛋白质中肽链的数目（一条肽链只有一个N末端）（2）拆分蛋白质分子的多肽链断开多肽链内的二硫键（3）分析每一多肽链的氨基酸组成（4）用两种以上方法裂解多肽链成较小的片段（酶法、化学法），得到几套肽段。（5）鉴定多肽链N-末端和C-末端残基常用于N－末端的测定方法：1.DNFP法（桑格反应）2.PITC法（艾德曼反应）3.氨肽酶法（专一从氨基末端将肽键切断）4.DNS法（丹磺酰氯）类似DNFP法同源蛋白质：在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质为同源蛋白质。生物功能是由一级结构决定的;蛋白质一级结构中保守氨基酸对蛋白

5、质的生物功能致关重要.肽链中的酰胺基（-CO-NH-）称为肽基。蛋白质的二级(Secondary)结构是指肽链的主链在空间的排列,或规则的几何走向、旋转及折叠。它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。主要有a-螺旋、b-折叠、b-转角。多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转，形成螺旋结构，螺旋一周，沿轴上升的距离即螺距为0.54nm,含3.6个氨基酸残基；两个氨基酸之间的距离为0.15nm。a－螺旋主要特点：1.每圈螺旋含3.6个氨基酸残基，沿螺旋方向上升0.54nm；2.a-螺旋中氨基酸残基侧链伸向外侧；3.a-螺旋靠氢键维持，氢键的取向几乎与中心轴平

6、行；4.a-螺旋为右手螺旋。b-折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列，通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿桩折叠构象在b-折叠中，a-碳原子总是处于折叠的角上，氨基酸的R基团处于折叠的棱角上并与棱角垂直，两个氨基酸之间的轴心距为0.35nm；b-折叠有两种类型。一种为平行式，即所有肽链的N-端都在同一边。另一种为反平行式，即相邻两条肽链的方向相反b－折叠片主要特点：1.所有肽键都参与链间氢键的交联，氢键与肽链的长轴接近垂直；2.多肽主链取锯齿状折叠构象；3.侧链交替分布在片层平面的两侧；4.b－折叠片有平行式，反平行式。多肽链在折叠成球状蛋

7、白质构象时，第一个氨基酸残基的羰基和第四个残基的氨基之间形成氢键，形成一种紧密的环,使主链结构本身以180°角回折，即b－转角。特点：存在于球状蛋白质分子表面,为非重复性结构；Gly,Pro常存在于b－转角处。蛋白质分子中，由若干个相邻的二级结构单元组合在一起，形成的有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体，称为超二级结构。蛋白质的三级结构：是指多肽链借助各种次级键盘绕成具有特殊肽链走向的紧密球状构象。特点：1.整个分子紧密、结实2.常含有结构域（domain）结构域：对于较大的蛋白质分子或亚基，多肽链在二级结构的基础上往往由两个或两个以上相对独立的三维实体

8、（局部折叠区）缔合而成三维结构，这种相对独立的三维实体。维持蛋白质