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时间:2018-07-06
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1、芯片瞬间等速电泳【摘要】建立了基于相对迁移时间比例的方法,依据待侧dna片段相对于上位及下位内标的迁移时间比例进行长度预测。实验结果显示,dna片段的相对迁移时间比例在不同分析条件下具有良好的重现性。通过建立相对迁移时间比例相对于dna片段长度的对应关系公式,实现了芯片瞬间等速电泳条件下dna片段长度的准确预测。实际样品分析证实这种基于相对迁移时间比例的计算方法简单可靠,适合于芯片titp-cge分析中dna长度的精确判定。【关键词】芯片电泳;瞬间等速电泳;dna长度计算;迁移时间;样品盐浓度precisepredi
2、ctionofdeoxyribonucleicacidsizesicrochipliuda-yu,liangguang-tie,mojian-kun,zhouxiao-mian(laboratoryofadvancedclinicalchemicaltechnology,guangzhoufirstmunicipalpeople′shospital,affiliatedhospitalofguangzhoumedicalcollege,guangzhou510180)(departmentoflaboratoryme
3、dicine,guangdongno.2provincialpeople′shospital,guangzhou510317)abstractthemigration-timeintransientisotachophoresis(titp)separationisaffectedbysamplesalinityasthedependenceofitptimeonsample-zoneconductivity.thesample-to-samplevariationofmigration-timeinmicrochi
4、ptitp-cgeanalysisisanundesiredfactorforprecisednasizing.inthisethodthatbasedonrelativemigration-timeproportion(rmp)inatetheeffectofsamplesalinityonsizingprecision.rmpigration-timedifferencebetentandtheloarkertothatbetarkerandtheloarker.thermpvaluesicrochiptitp-
5、cgeseparationsirrespectiveofsamplesalinity.sizeofatargetdnapvaluetotheequationderivedfromrmpsofstandarddnaladdervs.dnasizes.theprecisionandreproducibilityofthesizingmethodultiplestandardpcramplicons.experimentalresultsshopmethodissimpleandreliable,thusicrochipt
6、itp-cgeanalysis. keyicrochipelectrophoresis;transientisotachophoresis;deoxyribonucleicacidsizing;migrationtime;samplesalinity 1引言 芯片电泳具有快速高效分析、低消耗和便于实现各种操作单元灵活组合及规模集成的特点[1,2]。.上述特点和优势使得芯片电泳成为一种极具发展潜力的生物分析技术。dna分析是芯片电泳最为成功的应用领域之一,多种类型dna样品在芯片平台实现了高效分析[3~5]。芯片
7、电泳由于采用微尺寸通道便于实现高效分离,但同时由于通道尺寸造成的进样量限制也影响了检测灵敏度。为改善芯片电泳检测灵敏度,近期研究发展了多种在线预浓缩方法并取得显著效果[6]。等速电泳是在芯片dna分析中应用较为普遍的在线预浓缩技术[7~9],该技术可显著改善检测灵敏度而不损失分离效率。瞬间等速电泳(transientisotachophoresis,titp)是一种简化的等速电泳预浓缩方式,利用样品基质(samplematrix)中的离子为前导或尾随离子,将等速电泳预浓缩与后续的区带电泳分离偶联[10]。在芯片上偶联
8、瞬间等速电泳和筛分电泳(titp-cge),可以简单有效地改善高盐dna样品的检测灵敏度[11,12]。 dna定性分析通常是通过比较待测样品与标准样品的迁移时间来确定dna片段大小,因而不同样品迁移时间的一致性对于长度判定的精确性具有重要影响。在titp-cge分析中,由于等速电泳持续时间受样品区带电导率影响,样品盐浓度影响瞬间等速电泳持续
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