利用回交重组自交群体检测水稻耐低温发芽数量性状基因座

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1、维普资讯http://www.cqvip.com南京农业大学学报2007，30(1)：1～6JournalofNanjingAgriculturalUniversity利用回交重组自交群体检测水稻耐低温发芽数量性状基因座纪素兰，江玲，王益华，刘世家，刘喜，翟虎渠，万建民(1．南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室／江苏省植物基因工程技术研究中心，江苏南京210095；2，中国农业科学院作物科学研究所，北京100081)摘要：利用Nipponbare／Kasalath／／Nipponbare回交重组自交系群体，对贮藏在低温(4cc)和室温条件下的

2、种子进行低温发芽率的观察和统计分析，利用WindowsQTLCartographer1．16软件，对控制水稻种子低温发芽力的QTL进行检测。结果发现，低温发芽力QTL分布于第1、5、6、8、9和l2染色体上，其中位于第5染色体上的qLTG5(C597一R3166)和第9染色体上的qLTG一9(R79一C385)在低温萌发过程中持续表达。一5只在常温贮藏条件下稳定表达，表明此位点可能受种子贮藏条件的影响；qLTG～9在两种贮藏条件下均稳定表达，表明该位点不受种子贮藏条件的影响，可能与种子的耐贮性有关。研究结果可为低温发芽力强的水稻品种的标记辅助选择和图

3、位克隆奠定基础。关键词：水稻；低温发芽率；贮藏条件；QTL定位中图分类号：s511．034文献标识码：A文章编号：1000—2030(2007)0l一0001—06DetectionandanalysisofQTLforgerminationrateatlowtemperatureinrice(OryzasativaL．)usingbackcrossinbredlinesJISu—lan，JIANGLing，WANGYi-hua，LIUShi-jia，LIUXi，ZHAIHu—qu，WANJian—min，(1．StateKeyLaboratoryo

4、fCropGeneticsandGermplasmEnhancement／ResearchCenterofJiangsuPlantGeneEngineering，NanjingAgriculturalUniversity，Nanjing210095，China；2．CmpScienceInstitute，ChineseAcademyofAgiculturalScienees，Beijingl00081．China)Abstract：Togainanunderstandingofthegeneticcontrolofseedgerminationrat

5、eunderlowtemperatureconditions(LTG)，98backcrossinbredlines(BIL)derivedfromacrossbetweenajaponicavarietyNipponbareandanindicavarietyKasalathwereused。whichseedswerestoredatlowtemperature(4℃)conditionorroomtemperatureenvironment．Quantitativetraitloci(QTL)controllingLTGwasanalyzedb

6、ythesoftwareofWindowsQTLCartographer1．16．TheresultsshowedQTLforLTGlocatedonchromosome1，5，6，8，9and12．TwoputativeQTL，qLTG-5(C597一R3166)andqLTG一9(R79C385)，weredetectedtoexpressstabilityinthewholegerminatingtime．InwhichqLTG-5expressedstablyonlystoredinroomtemperaturesothatitmaybeas

7、sociatedwithseedsstorageenvironment．Correspondingly，qLTG．9couldexpressstablystoredattwodifferentenviron．mentsSOitsuggestedthisQTIcouldnotbeaffectedbyseedsstorageenvironmentandrelatedtoseedsstorable．Now．thecloselvlinkedmarkersonchromosome5and9couldbeusedtofacilitatethedevelopmen

8、tofBewricevarietieswithhighLTGabilitvandlonglongevityi