研究稻瘟病菌群体遗传多态性的分子标记方法

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1、中国水稻科学(ChinJRiceSci),2013,27(5):545-552http://www.ricesci.cnDOI:10.3969/ji.ssn.1001G7216.2013.05.013545研究稻瘟病菌群体遗传多态性的分子标记方法穆慧敏1,2姜华1王艳丽1孙国昌1,∗(1浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所,杭州310021;2南京农业大学植物保护学院,南京210095;∗通讯联系人,EGmail:sungc01@sina.com)MethodologyofGeneticDiversityResearchonRiceBlastPathogenMagnaporthegrisea

2、MUHuiGmin1,2,JIANGHua1,WANGYanGli1,SUNGuoGchang1,∗(1InstituteofPlantProtectionandMicrobiology,ZhejiangAcademyofAgriculturalSciences,Hangzhou310021,China;2InstituteofPlantProtection,NanjingAgriculturalUniversity,Nanjing210095,China;∗Correspondingauthor,EGmail:sungc01@sinac.om)MUHuimin,JIANGHua,WANGYa

3、nli,etal.MethodologyofgeneticdiversityresearchonriceblastpathogenMagnaporthegrisea.ChinJRiceSci,2013,27(5):545G552.Abstract:ThegeneticstructuresoftheMagnaporthegriseaarechangedfrequently,resultinginvariationofthefunguspopulationinthefieldwhichcreateslotsofchallengesondiseasecontrolusingresistantcult

4、ivars.Therefore,understandingthegeneticstructurevariationofriceblastpathogenpopulationinthefieldandrealGtimemonitoringthedynamicchangesareofgreatsignificancetocontrolofthisdisease.Commonly,themethodsusedonresearchofthegeneticdiversityareRestrictionFragmentLengthPolymorphism(RFLP),RandomAmplifiedPoly

5、morphicDNA(RAPD),SequencedCharacterizedAmplifiedRegion(SCAR),SimpleSequenceRepeat(SSR),repetitiveelementGbasedPolymeraseChainReaction(repGPCR),AmplifiedFragmentLengthPolymorphism(AFLP),RetrotransposonGMicrosatelliteAmplifiedPolymorphism(REMAP).Thisarticlereviewedtheexperimentalproceduresandtheadvant

6、agesanddisadvantagesofthesemolecularmethodsbriefly.Theresearchexamplesusingthesedifferentmethodswerealsodiscussed.Keywords:Magnaporthegrisea;geneticstructure;polymorphism;molecularmarker穆慧敏,姜华,王艳丽,等.研究稻瘟病菌群体遗传多态性的分子标记方法.中国水稻科学,2013,27(5):545G552.摘要:稻瘟病菌的遗传结构经常发生改变,导致田间稻瘟病菌群体具有多态性,严重阻碍了抗病品种在稻瘟病防治上的应用

7、.实时监测和研究稻瘟病菌的遗传变异,了解田间稻瘟病菌群体遗传结构的多样性及其动态对于防治该病具有重大意义.目前,研究稻瘟病菌遗传多样性的常用方法为分子标记技术,主要包括限制性片段长度多态性(RFLP)方法、随机扩增多态性DNA(RAPD)技术、特异性扩增片段(SCAR)标记、简单重复序列(SSR)标记、repGPCR技术、扩增片段长度多态性(AFLP)、反转录转座子G微卫星扩增多态性(REMAP)

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