应用ssap技术分析渐渗系后代多样性研究

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1、本科生毕业设计(论文)中文题目应用SSAP技术分析渐渗系后代多样性研究外文题目SSAPtechniqueanalysisofdiversityinoffspringintrogressionlines　学　　号　　　　　　　　　　姓　　名　　　　　陈志青　　　　　　学　　院　　　　生命科学学院　　　专　　业　　生物科学（师范类）　　指导教师　　　　　罗向东　　　　　完成时间　　　　2013年4月18日　江西师范大学教务处制目录目录I摘要2Abstract3引言41文献综述51.1植物渐渗杂交的研究进展51.1.1渐渗杂交概述51.1.2渐渗杂交可激活沉默的转座元件51.2植物逆转座子

2、的研究进展51.2.1逆转座子的类型与结构61.2.2逆转座子的转座活性71.2.3逆转座子的转座机制71.3基于逆转座子的SSAP分子标记71.4SSAP分子标记的应用81.5本课题的立项依据和研究意义92材料与方法92.1供试材料102.2实验方法102.2.1模板DNA的制备102.2.2基因组DNA酶切112.2.3连接接头112.2.4预扩增122.2.5选择性扩增122.2.6扩增产物的检测142.2.6.1变性聚丙烯酞胺胶电泳142.2.6.2SSAP条带的显色142.3数据统计153结果与分析153.1遗传多样性分析153.2群体PCA分析163.3系统进化树分析16

3、4讨论17参考文献19附录A21A.1主要实验仪器21A.2主要试剂21符号表22致谢23I摘要逆转座子的高拷贝数特点和稳定的遗传特性使其在分子标记领域有着巨大的应用潜力,高等植物中的逆转座子主要属于Ty1-copia类,基于其LTRs的SSAP已成为最有用的分子标记技术之一。本研究利用本实验室分离到的东乡野生稻渐渗系后代Ty1-copia类逆转座子的LTRs,建立了研究东乡野生稻渐渗系后代多样性的SSAP技术。对46个材料包括东乡野生稻渐渗系、中国栽培稻以及国外栽培稻进行遗传多样性分析。SSAP序列特异性引物根据Ty1-copia类逆转座子houba、osr15和osr17的LTR

4、区域设计。结果扩增得到140条条带，进一步分析可以将这些条带分为6个家族,东乡野生稻后代几乎分布于每个家族中;PCA分析也发现,东乡野生稻渐渗系后代分布广泛。渐渗系后代的平均Nei's基因多样性（He）结果为0.394,高于中国和国外的栽培稻（分别为0.385和0.376）。表明渐渗杂交能够扩大现有栽培稻的变异度,为水稻遗传改良提供有效的途径。关键词：渐渗系，栽培稻，SSAP，多样性24SSAPtechniqueanalysisofdiversityinoffspringintrogressionChenZhiqingDirectedbyProfessorLuoXiangdongAb

5、stractThestableofgeneticcharacteristicsandhighcopynumberofretrotransposonsmadeithasgreatpotentialapplicationsinthefieldofmolecularmarkers,retrotransposonsinhigherplantsaremainlybelongstotheTy1-copiaclass,TheSSAPbasedonLTRshasbecomeoneofthemostusefulmolecularmarkertechnology.ThisstudyusetheLTRso

6、foffspringintrogressionlinesderivedfromDongxiangwildrice,itistheclassofTy1-copiaretrotransposonwhichwasseparatedinourlaboratory,establishedthestudyofSSAPtechnologyofthediversityofDongxiangwildriceintrogressionlines.46materialsincludingintrogressionlines(ILs)derivedfromDongxiangWildRiceandcultiv

7、atedricefromChinaandForeignwereusedtoinvestigatethegeneticdiversitybyusingSSAPtechnology.TheSSAPprimersweredesignedaccordingtotheLTRregionofTy1-copialikeretrotransposon(houba,osr15andosr17).Theresultshowedthatatotalof140sepecificb