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时间:2021-04-17
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1、最新外源基因在大肠杆菌中的表达.-药学医学精品资料A大肠杆菌作为表达外源基因受体菌的特征7外源基因在大肠杆菌中的表达大肠杆菌表达外源基因的劣势缺乏对真核生物蛋白质的复性功能缺乏对真核生物蛋白质的修饰加工系统内源性蛋白酶降解空间构象不正确的异源蛋白细胞周质内含有种类繁多的内毒素B外源基因在大肠杆菌中高效表达的原理7外源基因在大肠杆菌中的表达启动子终止子核糖体结合位点密码子质粒拷贝数启动子启动子的可控性Ptrp色氨酸启动子Ptrp的可控性:Otrp除去色氨酸色氨酸启动子Ptrp受色氨酸-阻遏蛋白复合物的阻遏,转录呈基底状态。在培养系统中去除
2、色氨酸基底水平转录或者加入3-吲哚丙烯酸(IAA),便可有效地解除阻遏抑制作用。在正常的细菌培养体系中,除去色氨酸是困难的,因此基因工程中往往添加IAA诱导Ptrp介导的目基因的表达色氨酸或加3-吲哚丙烯酸高效转录阻遏蛋白(IAA)OtrpPtrp高效转录OtrpPtrp启动子启动子的可控性l噬菌体启动子PlL的可控性:噬菌体启动子PL受CI阻遏蛋白阻遏,很难直接诱导控制。在基因工程中常使用温度敏感型的cI突变基因cI857控制PL。cI857阻遏蛋在42℃时失活脱落,PL便可介导目的基因的表达。但在大型细菌培养罐中迅速升温非常困难,因
3、此常使用一个双质粒控制系统,用色氨酸间接控制目的基因表达PtrpABcI857PL目的基因阻遏作用PtrpABPL表达色氨酸终止子强化转录终止的必要性外源基因在强启动子的控制下表达,容易发生转录过头现象,即RNA聚合酶滑过终止子结构继续转录质粒上邻近的DNA序列,形成长短不一的mRNA混合物过长转录物的产生在很大程度上会影响外源基因的表达,其原因如下:转录产物越长,RNA聚合酶转录一分子mRNA所需的时间就相应增加,外源基因本身的转录效率下降;如果外源基因下游紧接有载体上的其它重要基因或DNA功能区域,如选择性标记基因和复制子结构等,则
4、RNA聚合酶在此处的转录可能干扰质粒的复制及其它生物功能,甚至导致重组质粒的不稳定性;过长的mRNA往往会产生大量无用的蛋白质,增加工程菌无谓的能量消耗;更为严重的是,过长的转录物往往不能形成理想的二级结构,从而大大降低外源基因编码产物的翻译效率终止子强终止子的选择与使用目前外源基因表达质粒中常用的终止子是来自大肠杆菌rRNA操纵子上的rrnT1T2以及T7噬菌体DNA上的Tf。对于一些终止作用较弱的终止子,通常可以采用二聚体终止子串联的特殊结构,以增强其转录终止作用终止子也可以象启动子那样,通过特殊的探针质粒从细菌或噬菌体基因组DNA
5、中克隆筛选pCP1AproriTcr筛选Apr、Tcs的转化子核糖体结合位点外源基因在大肠杆菌细胞中的高效表达不仅取决于转录启动的频率,而且在很大程度上还与mRNA的翻译起始效率密切相关。大肠杆菌细胞中结构不同的mRNA分子具有不同的翻译效率,它们之间的差别有时可高达数百倍。mRNA翻译的起始效率主要由其5‘端的结构序列所决定,称为核糖体结合位点(RBS)核糖体结合位点大肠杆菌核糖体结合位点包括下列四个特征结构要素:位于翻译起始密码子上游的6-8个核苷酸序列5’UAAGGAGG3’,即Shine-Dalgarno(SD)序列,它通过识别
6、大肠杆菌核糖体小亚基中的16SrRNA3’端区域3’AUUCCUCC5’并与之专一性结合,将mRNA定位于核糖体上,从而启动翻译;翻译起始密码子,大肠杆菌绝大部分基因以AUG作为阅读框架的起始位点,但有些基因也使用GUG或UUG作为翻译起始密码子;SD序列与翻译起始密码子之间的距离及碱基组成;基因编码区5’端若干密码子的碱基序列核糖体结合位点的结构核糖体结合位点核糖体结合位点对外源基因表达的影响SD序列的影响:一般来说,mRNA与核糖体的结合程度越强,翻译的起始效率就越高,而这种结合程度主要取决于SD序列与16SrRNA的碱基互补性,其
7、中以GGAG四个碱基序列尤为重要。对多数基因而言,上述四个碱基中任何一个换成C或T,均会导致翻译效率大幅度降低核糖体结合位点核糖体结合位点对外源基因表达的影响SD序列与起始密码子之间的序列的影响:SD序列下游的碱基若为AAAA或UUUU,翻译效率最高;而CCCC或GGGG的翻译效率则分别是最高值的50%和25%。紧邻AUG的前三个碱基成份对翻译起始也有影响,对于大肠杆菌b-半乳糖苷酶的mRNA而言,在这个位置上最佳的碱基组合是UAU或CUU,如果用UUC、UCA或AGG取代之,则酶的表达水平低20倍核糖体结合位点核糖体结合位点对外源基因
8、表达的影响SD序列与起始密码子之间的距离的影响:SD序列与起始密码子之间的精确距离保证了mRNA在核糖体上定位后,翻译起始密码子AUG正好处于核糖体复合物结构中的P位,这是翻译启动的前提条件。在很多情况下,
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