热气腾腾的5分SCI——LncRNAceRNA.doc

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1、个人收集整理勿做商业用途热气腾腾的5分SCI——LncRNA＆ceRNA2014—10-22 右哉 实验万事屋提示:请点击标题下方蓝色“实验万事屋”，添加关注后,发“嗯"可以查看我们之前的文章。未经允许，其他公众号不得转载哦!实验万事屋作品今天是每周三的【万事屋Seminar】，今天要给大家介绍的是一个热气腾腾的关于“HOTAIR"（一种LncRNA）的文章，同时为大家介绍了一种常见的SCI文章思路……简单粗暴，但很实用哦！李莫愁博士：今天在万事屋Seminar环节讲文献的是我们的林平之师弟,他带来的题目是《LncRNAHOTAIRfunctionsasacompetingendog

2、enousRNAtoregulateHER2expressionbyspongingmiR—331-3pingastriccancer》实验万事屋作品小林子：感谢大家站得这么正，坐的这么直来听我讲文献。大家看的这个文献的题目就应该已经明确了.我为大家带来的文章是很流行的LncRNA和ceRNA,这篇文章发表在MolecularCancer上，影响因子是5.397。实验万事屋作品实验万事屋作品首先看一下摘要,这篇文献的摘要基本上已经把内容都概括到了。主要是研究了一种胃癌中高表达的LncRNA，并且发现了这个LncRNA是收到了MiRNA调控的。紧接着，就验证了这个LncRNA的一种机制

3、,这种机制是什么呢?就是作为Her2的内源竞争RNA，对Her2这种癌基因有调控的机制。实验万事屋作品实验万事屋作品接下来我们来看结果实验万事屋作品1）从78对病例组织样本（癌和癌旁）中,验证了HOTAIR这个LncRNA的表达情况，证明分期晚的胃癌患者中，HOTAIR表达量高。且高表达HOTAIR后，生存率下降。（莫愁：验证了基因与肿瘤的相关性)实验万事屋作品实验万事屋作品个人收集整理勿做商业用途2）细胞水平实验，验证细胞增殖情况,敲除HOTAIR及过表达HOTAIR后增殖变化明显，即敲除HOTAIR后细胞增殖抑制。（莫愁：细胞层面实验，验证基因与肿瘤细胞表型之间的相关性）实验万事

4、屋作品实验万事屋作品3)细胞水平实验，验证细胞周期及转移情况，敲除HOTAIR及过表达HOTAIR后细胞周期变化，及细胞迁移能力变化.同样，在敲除HOTAIR后细胞出现早凋，迁移能力降低。(莫愁：其实都是细胞水平的实验，验证的也是基因与表型间的关系）实验万事屋作品实验万事屋作品4）动物实验，敲除HOTAIR后,裸鼠成瘤的变化,即在敲除HOTAIR后裸鼠成瘤明显变小，增殖速度减缓.（莫愁：在细胞实验后，用裸鼠成瘤这样的简单动物实验进行进一步的体内验证,是常见的套路之一）实验万事屋作品实验万事屋作品5)生物信息学分析得出可能的调控HOTAIR的MiRNA，然后用Luciferase来进行

5、验证,获得确实有效的几个MiRNA，如MiR-331—3p。由于MiR—331-3p的靶基因也同时包含了HER2，故检测了一下HER2的表达，发现过表达HOTAIR之后，HER2表达量也增加了。（莫愁：用简单的方法,检测出了LncRNA上游的MiRNA调控，并且还预测了可能存在的ceRNA关系)实验万事屋作品实验万事屋作品6）在组织中验证HOTAIR与MiRNA间的表达相关性,以及HOTAIR与HER2之间的表达相关性（qPCR及免疫组化)，并验证了敲减MiR-331-3p等上游MiRNA敲减后的细胞水平表型。(莫愁:至此证明了，HOTAIR与HER2在胃癌中存在着ceRNA的联系，

6、其联系的关键就为MiR-331—3p）实验万事屋作品实验万事屋作品个人收集整理勿做商业用途小林子:好了，今天就讲到这里，谢谢大家……（莫愁：ceRNA可以算得上是最简单的LncRNA研究机制了……也就这么简单了……）实验万事屋作品…华丽丽的分割线…实验万事屋作品李莫愁博士：今天小林子讲的这篇文章，是一篇思路非常清澈的5分文章。给你用图演示一下这个思路啊.是不是思路很简单，要是没有LncRNA和ceRNA这样的噱头，应该分也不会很高的。实验万事屋作品实验万事屋作品又有同学会问，这篇文章研究的HOTAIR不是在肿瘤里都研究烂了么,还有还有,MiR-331—3p不是也研究烂了么，为啥还能发

7、5分呢？哈哈哈……这要涉及到一种SCI的科研思路,一般我们称之为“FillingGaps”。(如下图）实验万事屋作品实验万事屋作品这种思路在细胞信号传导研究中尤为常见，比如有人已经报道 A 蛋白是 B 蛋白的上游蛋白，另外有人报道 B 蛋白是 C 蛋白的上游,但是 A 和 C 蛋白之间的关系就是个 gap，无人报道,所以我就研究 A 和 C 的关系，这种结果一般都是可以预测的，创新性不大，尽管如此，这类的发现也照样可以发表文章，只是不大可能入 CNS（Ce