常用DNA分子标记类型和特点教学资料.doc

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1、精品好文档,推荐学习交流常用DNA分子标记类型和特点依据对DNA多态性的检测手段,DNA标记可分为四大类:第一类为基于DNA.DNA杂交的DNA标记。主要有限制性片段长度多态性标记(RFLP)、可变数目串联重复序列标记(VNTR)、单链构象多态性RFLP(SSCP.RFLP)等;第二类为基于PCR的DNA标记。主要有随机扩增多态性DNA(RAPD),简单重复序列DNA标记(SSR),测定序列标签位点(STS),表达序列标签(EST),测序的扩增区段(SCAR);第三类为基于PCR与限制性酶切技术结合的DNA标记。主要有两种,一种是扩增片段艮度多态性(AFLP),第二种是酶

2、解扩增多态顺序(CAPS);第四类为基于单核苷酸多态性的DNA标记。主要是单核苷酸酸多态性(SNP)。各类常用分子标记的特点和应用如下:标记名称引物设计方法特点应用多态性原因RAPD以几个随机寡核苷酸(常用10个)为引物简便、易行、灵敏、安全性好、DNA用量少,能快速进行基因多态性研究,但重复性较差遗传资源保存、遗传多样性研究、种质资源鉴定、遗传资源分类、品种纯度鉴定、遗传图谱的构建、突变检测、基因标记和基因组比较多态性是由于引物与不同区段的同源序列结合,产生不同的DNA产物RFLP以单拷贝或低拷贝的DNA克隆(基因组DNA或cDNA)作探针共显性、信息完整、稳定性、重复

3、性好品种鉴别和品系纯度鉴定、分子标记连锁图谱构建、基因定位、种质鉴定和遗传背景分析、遗传多样性分析多态性主要足由于限制性内切酶酶切位点或位点间DNA序列中单碱基的替换、DNA片段的插入、缺失、易位和倒位等引起SSR两端序列较保守,SSR引物根据与微卫星重复序两端的特定短序列设计,用来扩增重复序列本身,从而揭示微卫星的多态性。共显性、信息完整、稳定性重复性好,操作简单生物遗传作图、基因定位、群体遗传研究、个体间亲缘关系鉴定多态性是由于SSR座位的基本单元重复次数的小同而形成SNPDNA测序中碱基的峰高和面积变化,已有DNA序列比较,设计特定区域DNA片段的特异PCR引物,扩

4、增相虑DNA片段并进行序列比较SNP的数量极其丰富,并且可以进行自动化检适应于复杂性状的遗传分析、引起群体差异的基因识别多态性足由于单个核苷酸的变异所引起AFLP用两种能产生黏性末不需要预先知道构建高密度的遗传仅供学习与交流,如有侵权请联系网站删除谢谢3精品好文档,推荐学习交流端的限制性内切酶将基因组DNA切割成分子量人小不等的限制性片段,然后将这些片段与其末端互补的已知序列的接头连接,所形成带接头的特异片段用作随后的PCR反应模版,PCR引物5’端与接头和酶切位点序列互补,3’端在酶切位点后增加1~3个选择性碱基DNA序列信息的情况下就可以同时进行多数DNA酶切片段的P

5、CR扩增,既有RFLP的可靠性又有RAPD的方便性连锁图,DNA指纹图谱构建多态性是由于酶切位点和其后的选择性碱基的变异SCAR根据RAPD或AFLP碱基序列设计特异引物克服了RAPD标记的不稳定性,AFLP标记的难操作性生物遗传作图、基因定位多态性是由于引物与不同区段的同源序列结合,产生不同的DNA产物CAPS适合于扩增产物的限制性内切酶是一些特异引物PCR标记的延伸适应于性状连锁标记的发掘多态性是由于特异PCR产物DNA序列内限制性晦切位点变异二项式定理1.二项式定理:,2.基本概念:①二项式展开式:右边的多项式叫做的二项展开式。②二项式系数:展开式中各项的系数.③项

6、数:共项,是关于与的齐次多项式④通项:展开式中的第项叫做二项式展开式的通项。用表示。3.注意关键点:①项数:展开式中总共有项。②顺序:注意正确选择,,其顺序不能更改。与是不同的。③指数:的指数从逐项减到,是降幂排列。的指数从逐项减到,是升幂排列。各项的次数和等于.仅供学习与交流,如有侵权请联系网站删除谢谢3精品好文档,推荐学习交流④系数:注意正确区分二项式系数与项的系数,二项式系数依次是项的系数是与的系数(包括二项式系数)。4.常用的结论:令令5.性质:①二项式系数的对称性:与首末两端“对距离”的两个二项式系数相等,即,···②二项式系数和:令,则二项式系数的和为,变形式

7、。③奇数项的二项式系数和=偶数项的二项式系数和:在二项式定理中,令,则,从而得到:④奇数项的系数和与偶数项的系数和:仅供学习与交流,如有侵权请联系网站删除谢谢3

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