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1、黄檗根围丛枝菌根真菌菌群组成蔡柏岩1,2葛菁萍1接伟光2阎秀峰3﹡1黑龙江大学生命科学学院黑龙江省普通高等学校微生物重点实验室哈尔滨1500802黑龙江东方学院食品与环境工程学部哈尔滨1500863东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040摘要:从东北林业大学林场采集黄檗Phellodendronamurense根系及根围土壤,采用Nested-PCR技术扩增黄檗菌根及根围土壤AM真菌18SrDNANS31/Glol区域,利用该产物进行DGGE分析,并结合DNA测序、系统发育分析及DGGE图谱分析技术对黄檗AM真菌菌群组成进行分析。结
2、果表明:Nested-PCR技术具有较高的灵敏性,可有效地从微量DNA中扩增出约230bp的目的片段;黄檗根系及根围土壤具有不同的DGGE指纹图谱特征,DGGE带谱在条带的数量、亮度、优势度等方面均存在较大差异,全部序列可分为3类菌群,即球囊霉属Glomus、盾孢囊霉属Scutellospora及植物病原菌黄杨亚赤壳Hyponectriabuxi,其中Glomussp.(EF177624)和Glomussp.(DQ085205)分别为黄檗根系和根围土壤样品中最具优势的AM真菌。关键词:18SrDNA,Nested-PCR技术,变性梯度
3、凝胶电泳,系统发育分析ThecommunitycompositionofthearbuscularmycorrhizalfungiintherhizosphereofPhellodendronamurenseCAIBai-Yan1,2GEJing-Ping1JIEWei-Guang2YANXiu-Feng3*1KeyLaboratoryofMicrobiology,CollegeofLifeSciences,HeilongjiangUniversity,Harbin150080,China2InsituteofFoodandEnvir
4、onmentEngineering,HeilongjiangOrientalCollege,Harbin150086,China3CollegeofLifeSciences,NortheastForestryUniversity,Harbin150040,ChinaAbstract:TherhizosphericsoilandrootsamplesofPhellodendronamurensewerecollectedintheLoggingStationofNortheastForestryUniversity.Nested-PCR
5、wasconductedtospecificallyamplifyNS31/Gloldomainsequencesofthesmall-subunit(18S)rDNAfromtheAMfungiintherootandrhizosphericsoilsamplesofP.amurense,respectively.TheNested-PCRproductswereappliedtodenaturinggradientgelelectrophoresis(DGGE)analysis.Then,thecommunitycompositi
6、onoftheAMfungiwasanalyzedbyDGGE,sequencing,andphylogeneticanalysis.Theresultindicatedthatthetargetedproduct(230bp)wassuccessfullyamplifiedfromtraceDNAbyNested-PCR.ThereweredifferencesinDGGEprofilessuchasbandnumbers,densitiesanddominancebetweentherhizosphericsoilandroots
7、amples.Allsequencesweredividedintothreegroups,viz.Glomus,ScutellosporaandHyponectriabuxi.Glomussp.(EF177624)andGlomussp.(DQ085205)weretheprevalentAMfungiintherootandrhizosphericsoil,respectively.Keywords:18SrDNA,Nested-PCR,denaturinggradientgelelectrophoresis,phylogenet
8、icanalysis丛枝菌根(arbuscularmycorrhizal,AM)真菌是自然界中普遍存在的一种寡营养活体微生物,能够与80%以上的陆生植物根系形成共生体(Goslingetal.2006;Grigeraet