突破MTT法总结及结果分析.doc

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1、基因是能表达而形成有功能产物(蛋白质或RNA)的DNA序列(或RNA)基因不仅包括编码蛋白质肽链或RNA的核酸序列,还包括保证转录所必需的调控序列及位于编码区5’’端上游的非编码序列、内含子和位于编码区下游3’’端的非编码序列基因分为三类:既转录,又翻译:编码蛋白质基因只转录,不翻译:ttRNA、rRNA不转录,不翻译:调控基因、假基因等Denaturation(变性):本质是双链间氢键的断裂方法:加热、化学试剂现象:OD260增高【增色效应】解离曲线:OD260/TTm:OD260达到最大值的一半时

2、的温度称为DNA的解链温度。Tm与G+C%成正比,一般G+C%每增加1%,Tm增加0..4℃。如G+C%占40%,则Tm为87℃,60%则升高至96℃。Renaturation(复性):变性的DNA在适当条件下,两条互补链可重新恢复天然的双螺旋构象,称为DNA复性。Annealliing(热变性)::热变性的DNA经缓慢冷却后复性。退火越慢、温度越高,特异性就越好,否则错配的可能性就越大。影响因素:DNA的序列、DNA浓度、DNA片段大小、温度【Tm–25℃】、溶液的离子浓度。Hybridizatio

3、n(杂交):DNA复性过程中,如果把不同DNA单链分子放在同一溶液中,或把DNA与RNA放在一起,只要在DNA或RNA的单链分子之间有一定的碱基配对关系,就可以形成局部双螺旋DNAReplication(复制):半保留复制;双向复制;半连续复制条件:模板dNTP(N=AGCT)DNA聚合酶引物DNA突变:突变是某些疾病的发病基础;突变主要有错配、缺失、插入和重排;突变修复包括光修复、切除修复、重组修复和SOS修复。基因表达:将DNA中储存的遗传信息转变为各种有功能的蛋白质(或RNA)的过程基因的有关实

4、验操作1、核酸的分离、纯化破碎细胞【超声波、EDTA、SDS处理】;用蛋白变性剂或蛋白酶去除蛋白质【酚:氯仿:异戊醇抽提】【蛋白酶】;用乙醇【异丙醇】沉淀核酸;用RNase去除残留RNA。2、核酸的定量和纯度判断分光光度法【紫外】:核酸分子在260nm处有特异的紫外吸收峰,吸收强度与核酸浓度成正比;在波长260nm的紫外线下,1个OD..的光密度相当于双链DNA浓度为50ug/ull,单链DNA或RNA浓度为40ug/ull,寡核苷酸浓度为33ug/ull。3、核酸的贮存DNA的贮存:将DNA溶于TE

5、溶液中,贮存于4℃或-70℃。【EDTA可以鳌合金属二价离子,抑制DNA酶的活性,TE的PH值为8,可减少DNA的脱氨反应,-70℃可以保存5年】RNA的贮存:将RNA溶于0..3MNaAc(PH::5..2)或双蒸灭菌水中,贮存于-70℃。RNA长期保存可以沉淀形式贮存于乙醇中,-20℃保存,非常安全。4.核酸的电泳分离-琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳的分辨率取决于凝胶的浓度,浓度越高,分辨率越高;反之,则越低;不同构型的DNA分子,其电泳迁移率也不同:构象越紧密,迁移越快;线性DNA分子迁移率的大小

6、与其分子量大小的对数成反比,可以通过与Marker的较来确定其分子量。5、核酸分子杂交核酸分子杂交的基本原理:是用已知的DNA或RNA片段(探针)来检测样品中未知的核酸序列,通过核苷酸间的碱基互补原则相互结合,经显影或显色的方法,将结合的核苷酸序列的位置和大小显示出来。探针(Probe):能与特定核苷酸序列发生互补结合的带有标记物的已知的核酸片段。探针的种类:基因组DNA(包括人、动物、细菌、病毒等)探针:来源于基因组文库。克隆于载体中取之不尽,相对稳定。cDNA探针:不含内含子和重复序列。RNA探针

7、:与DNA结合牢固,因不存在互补链而使杂交效率更高,可以用RNase处理而降低成本,但不稳定。寡核苷酸探针:15-30bp的寡核苷酸,易于人工合成和修饰,但所带标记物少。探针上必须带有可识别的信号标记,以便跟踪观察与其同源的核酸序列间的杂交反应的位置、大小及杂交信号的强弱。探针的标记:放射性标记物:灵敏度高、不影响酶的活性和碱基配对,缺点是易造成放射性污染。32P35S3H14C125II131II非放射性标记物:无放射污染。生物素:核酸+生物素+亲和素+荧光蛋白【或酶】;地高辛:核酸+地高辛+抗地高

8、辛蛋白+荧光蛋白【或酶】;荧光素:适用于细胞原位杂交和染色体杂交。探针标记的方法:缺口平移标记DNA(NickTranslation);杂交的种类:Soutthern印迹法(Southernblotting)基因组DNA限制性酶切→凝胶电泳【变性】→转化NC膜→杂交【探针】→结果检测【放射自显影】。Northern印迹法(Northernblotting)Western印迹法(westernblotting)原位杂交、斑点杂交PolymerasePoly

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