如何用Diamond构建Polyhedral图.docx

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1、关于如何构建晶体结构，我们前期介绍了CrystalMaker这款软件。下面几期内容我们将介绍另外一款常用的晶体结构软件“Diamond”。本期内容将介绍如何用Diamond构建立体多边形结构（本期内容来自广州大学汤政斌同学的投稿，在此表示感谢）。1.导入晶胞：  ①把cif文件拖入diamond即可；或者openafile（直接打开）  ②打开后，弹出以下窗口，点击下一步，即可。③继续点击下一步。④当弹出picturedesign设置窗口时，建议把background颜色选白色（个人爱好）。⑤按下一步，再按完成，即出现下图。2.添

2、加与修饰多面体①点击工具栏的Build,选择Polyhedra——AddPolyhedra（添加多面体）。②选择中心原子与对应配位原子，构成多面体。(首先Al和O配位)然后，点击Design。③a.弹出polyhedradesign设置窗口（颜色选了turquoise，透明度调至0.6），然后点击Material。b.弹出Materialsettings窗口如下图（Blue调至0.3）个人觉得此处可以把多面体调亮一点，更有光泽。   c.总体设置如下图。 d.设置完上述步骤，即可点击Applynow。e.Al和O配位的效果图如下。

3、④重复步骤二的①-③，建立Lu和O的配位的多面体结构（红色、透明度：0.8；materialsetting——Red:0.50）。即可得到如下效果图。⑤添加骨架，点击工具栏的picture——PolyhedralDesigns——把勾去掉添加骨架后的效果图  ⑥设置Al和Lu原子的颜色：工具栏——picture——atomdesign效果图3.①选择其中一个Lu原子点击鼠标右键——copy②点击工具栏的Edit——CopyToNewPictureCopytonewpicture后的效果图如下：③选中整个多面体结构，点击工具栏Bui

4、ld——ConnectAtoms效果图 ④选中整个多面体，对着骨架右键，点击Add——BondLabels弹出设置窗口如下图效果图如下⑤a.为中心原子添加标签，右键中心原子，Add——AtomsLabelsb.点击工具栏Picture——AtomsDesigns（设置中心原子颜色）效果图⑥a.选择随便其中一个原子，右键——copy；再点击工具栏Edit——copytonewpicture，得到新的图如下，把所有氧原子选中（按着Ctrl键，点击鼠标左键），再点击右键——destroy——atoms.b.对球体进行颜色编辑4.导出图片

5、。a.点击工具栏的picture——layout——bitmap——调成200或者300（个人喜欢，看起来更清晰）。b.点击edit——copy，即可在PPT等中粘贴。