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时间:2020-09-15
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1、cDNA的合成实验原理和操作步骤一、实验目的掌握植物cDNA合成的原理和方法二、实验原理反转录酶主要用于体外cDNA的合成。目前最常用的反转录酶(reversetranscriptase)有SuperscriptII、M-MLV和AMV等。它们具有依赖于RNA或DNA的DNA聚合酶活性和RNaseH酶活性,可以以RNA分子为模板,合成出一条DNA链。形成的DNA是与RNA模板互补的,因而反转录产生的DNA分子称之为cDNA。三、实验材料、器具及药品植物总RNA溶液。紫外分光光度计、离心机、冰盒、口罩、手套、EP管架、超净工作台、移液器、DEPC处理过的枪头
2、、EP管等。5×M-MLVRTBuffer、2.5mMdNTPmix、RNase抑制剂(30U/µL)、M-MLVReverseTranscriptase、Oligo(dT)18primer、无菌的DEPC水等。四、实验步骤注意:戴手套进行以下操作,严防RNase污染。1.在超净工作台上吸取1ml无菌水到EP管中,加入2µl植物总RNA溶液,充分混匀,在紫外分光光度计上测定260,280nm的光吸收值(OD值),然后计算RNA的浓度,并分析其纯度。分光光度(紫外吸收)法(1)预热紫外分光光度计10—20分钟。(2)取两只比色杯,一只装入1mlH2O溶液,作
3、为空白溶液,用来校正分光光度计零点及调整透光度至100。(3)DNA纯度及浓度测定:①取2ulDNA或RNA样品加入另一比色杯,加dH2O至1000ul,混匀。②将两只比色杯置分光度计中,调入射光波长,分别用空白溶液调整零点(T为100,OD为0),测定待测样品液在260nm、280nm、230nm的OD值。③计算浓度:对于双链DNA1.0OD260=50ug/ml,对单链RNA1.0OD260=40ug/ml。④测定纯度:v纯的RNA溶液其OD260/OD280的比值应介于1.7至2.0,OD260/OD230的比值应大于2.0。ØRNA样品OD260/
4、OD280的比值太小,说明有蛋白或苯酚污染。比值大于2.0,则可能被异硫氰酸胍污染。ØOD260/OD230的比值小于2.0时表明有小分子及盐存在。纯的DNA溶液其OD260/OD280应为1.8,OD260/OD230应大于2.0。ØOD260/OD280大于1.9时,表明有RNA污染,小于1.6时表明有蛋白质或酚污染。ØOD260/OD230小于2.0时,表明溶液中有残存的盐和小分子杂质,如核苷酸、氨基酸、酚等。2.在DEPC处理过的Ep管中加入约4µg总RNA和1µl0.5µg/µl的Oligo(dT)18primer,小心混匀,70℃保温5分钟,立
5、即浸入冰水中。3.按次序分别加入下列试剂: 5µl5×M-MLVRTBuffer 2µldNTPmix(2.5mM)1µlRNase抑制剂(30U/µL) 1µlM-MLVReverseTranscriptase然后加DEPC水到25µl.4.小心混匀,室温离心5秒,将所有溶液收集到管底,37℃保温1小时。 5.90℃处理5分钟,冰上冷却。 6.用于PCR扩增或-20℃保存备用.
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