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时间:2020-06-18
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1、Chapter6CloningvectorsforE.coli6.1CloningvectorsbasedonE.coliplasmidspBR322这个名字的含义:1.“p”说明它是一个质粒;2.“BR”表示最初构建它的实验室;3.“322”把该质粒和该实验室构建的其它质粒区分开。6.1.1Thenomenclatureofplasmidcloningvectors1.pBR322第一个优点是它的大小;2.拥有两套抗生素耐药性,而且每个抗性基因内部都拥有限制性单酶切位点;3.拥有相当高的拷贝数,(15或1000~3000个)。6.1.2Theusefu
2、lpropertiesofpBR3226.1.3ThepedigreeofpBR3226.1.4OthertypicalE.coliplasmidcloningvectorspBR327的特点:pBR327是从pBR322中移除一个长1089bp的片段构建的,仅改变了质粒的复制能力和接合能力。1.拷贝数比pBR322更高(30~45);2.不具有自我转移能力(这一点对生物防范很重要)。pUC8的特点:pUC8来源于pBR322,仅保留复制起点和ampR携带lacZ′基因。1.拷贝数500~700;2.重组体识别仅需一步;3.拥有多克隆单酶切位点,而且与M
3、13mp系列载体中的限制性酶切位点一样。6.1.4OthertypicalE.coliplasmidcloningvectors6.1.4OthertypicalE.coliplasmidcloningvectorspGEM3Z——克隆DNA的体外转录载体与pUC载体很相似,含ampR和lacZ′基因,在lacZ′基因内有一个限制性酶切位点。还有两个启动子——T7启动子和SP6启动子。噬菌体载体构建的困难:通常带有几个复制所必需的基因,可供改变的自由度很小。6.2CloningvectorsbasedonM13bacteriophage507bp可改变,
4、还必须保证复制起点不被破坏。优点:可获得单链的被克隆DNA。6.2.1DevelopmentofthecloningvectorM13mp2含有对称克隆位点的M13mp7载体的构建如用EcoRⅠ、BamHⅠ、SalⅠ中的一种去酶解M13mp7,会出现什么情况?再加入外源DNA酶连会出现什么情况?含有对称克隆位点的M13mp7载体的构建M13mp7的多接头会被切下。再加入外源DNA会出现三种连接情况:1)插入了新的DNA;2)插入了多接头;3)载体自连。M13mp7的优点:无论新DNA是通过哪个酶切位点引入,都可通过EcoRⅠ从重组后的分子中切除。Reco
5、veryofclonedDNAfromarecombinantM13mp7moleculebyrestrictionattheoutersitesofthepolylinker.M13mp8与M13mp9的多克隆位点顺序相反,在DNA测序中很重要。更复杂的M13载体6.2.2Hybridplasmid-M13vectors由于M13容纳的DNA片段非常有限,最大3kb,一般认为1500bp就是它的上限了。人们把M13基因组的一部分和质粒DNA结合在一起,构建了一种新型的载体,叫做噬菌体质粒(phagemid)。pEMBL8就是这样一个载体。6.3Clon
6、ingvectorsbasedonλbacteriophage天然λ噬菌体的不足:1.仅能增加3kb;2.限制性内切酶识别位点多个。6.3.1Segmentsoftheλgenomecanbedeletedwithoutimpairingviability15kb6.3.2Naturalselectioncanbeusedtoisolatemodifiedλthatlackcertainrestrictionsites6.3.3Insertionandreplacementvectors解决包装限制和多酶切位点问题后,就可以着手开发λ噬菌体的克隆载体了。
7、最先产生的两类载体就是λ插入载体(insertion)和λ置换载体(placement)。插入载体可以插入超过8kb的外源DNA。外源DNA通过EcoRⅠ插入cⅠ基因,并使该基因失活,通过得到清晰噬菌斑检测。可以插入超过10kb的外源DNA。外源DNA通过含6个酶切位点的多接头插入lacZ′基因,并使该基因失活,通过得到无色噬菌斑检测。置换载体一个λ置换载体有被某种克隆所需限制性内切酶识别的两个位点,而在这两个位点之间的DNA片段将会被外源的DNA所置换。通常置换那段含多个酶切位点而被切成多段,故重新插入的概率很小。没重组的载体因为太小而不能被包装进λ噬
8、菌体头部。置换载体可携带的DNA片段长度通常超过插入载体。λEMBL4可以携带超
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