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时间:2020-03-18
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1、PCR技术的原理和方法1.PCR定义PCR(PolymeraseChainReaction)即聚合酶链式反应,是指在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物为延仲起点,通过变性、退火、延仲等步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。是一项DNA休外合成放大技术,能快速特异地在体外扩增任何目的DNAo可用于基因分离克隆,序列分析,基因表达调控,基因多态性研究等许多方面。2.PCR技术的基本原理即在高温(95°C)下,待扩增的靶DNA双链受热变性成为两条单链DNA模板;而后在低温(37〜55°C)情况下,两条人工合成的寡核苛酸引物与互补的单链DNA模板结合,形成部分双链
2、;在Taq酚的最适温度(72°C)下,以引物3,端为合成的起点,以单核廿酸为原料,沿模板以5^39方向延伸,合成DNA新链。这样,每一双链的DNA模板,经过一-次解链、退火、延伸三个步骤的热循环后就成了两条双链DNA分子。如此反复进行,每一次循环所产生的DNA均能成为下一•次循环的模板,每一次循环都使两条人工合成的引物间的DNA特异区拷贝数扩增一倍,PCR产物得以2"的批数形式迅速扩增,经过25〜30个循环后,理论上可使基因扩增IO®倍以上,实际上一般可达1()6〜心倍。模板变性迫火延伸变性退.火延仲循环2A4-L1棋扳3、示意图假设扩增效率为“X”,循环数为“iT,则二者与扩增倍数丁啲关系式可衣示为:y=(l+X)no扩增30个循环UPn=30时,若X=l00%,则y=23O=1073741824(>109);W若X=80%吋,则尸1.8叫45517159.601(f)。山此可见,其扩增的倍数是巨大的,将扩增产物进行电泳,经澳化乙锭染色,在紫外灶照射下(254nm)—般都可见到DNA的特异扩增区带。3.PCR反应基本步骤3.1变性(denaturation):通过加热使模板DNA的双链之间的氢键断裂,双链分开而成单链的过程(94°C,30s)。3.2退火(annealling):当温度降低时,引物与模板DN4、A中互补区域结合成杂交分子(55°C,30s)o如下图所示引物13,—GAACTTT—5'5、GGATC1AGCGTATGCTTGAAA——3、3'CCTAGATCGCATACGAACTTT——5、模板DNA5'—GGATC1A—3'引物2PCR引物与模板结合示意图3.3延伸(extension):在DNA聚合酶、dNTPs、Mg2+存在下,DNA聚合酶催化引物按亍-3,方向延伸,合成出与模板DNA链互补的DNA子链(70〜72°C,30〜60s)。以上述三个步骤为一个循环,每一循环的产物均可作为下一个循环的模板,经过n次循环后,目的DNA以2n的形式增加。1.PCR扩增的基本方法4」PC5、R反应体系成份终浓度10XbufferMgchPrinier(2个)dNTPs(4利i)BSATaq酶模板DNA纯水1/10体积1.5~2.5mmol/L各0.2Pmol/L各200umol/L100ug/mL1〜2.5单位/反应体系102〜105个分子(lOOng)补至所需体积(25〜50口1)4.2PCR反应的成分和作用总体积:一-般为25U1〜100U1(1)无Mg2buffer:山纯水、kcl、Tris纟II成。Tris用于调肖反应体系pH值,使Taq酶在偏碱性环境中反挥活性。kcl可降低退火温度,但不能超过50mmol/L,否则会抑制DNA聚合酶活性。(2)Mg2+:终浓度为1.6、5〜2.0mmol/L,其对应dNTP为200umol/L,注意与dNTPs之间的浓度关系,曲于dNTP与Taq酶竟争Mg2+,当dNTP浓度达到1mmol/L时会抑制Taq酚的活性。Mg"能影响反应的特异性和产率。(3)BSA:一般用乙酰化的BSA,起着减少PCR管对Taq酶的吸附作用,对Taq酶有保护作用。(4)底物(dNTPs):dNTPs具有较强酸性,其储存液用NaOH调pH值至7.0〜7.5,—般存储浓度为10mmol/L,各成份以等当量配制,反应终浓度为20〜200umol/Lo浓度可加速反应,但同时増加错误掺入和实验成本;低浓度可提高精确性,而反应速度会降低。(5)Taq酶:7、能耐95°C高温血不失活,其最适pH值为&3〜&5,最适温度为75〜80°C,一般用72aCo能催化以DNA单链为模板,以碱基互补原则为基础,按方向逐个将dNTP分子连接到引物的3,端,合成一条与模板DNA互补的新的DNA子链。无3—5,的外切酶活性,没有校正功能。某种dNTP或Mg2+浓度过高,会增加其错配率。用量一般为0.5〜5个单位/lOOu1(6)模板:PCR对模板DNA的纯度不要求很高,但应尽量不含有对PCR反
3、示意图假设扩增效率为“X”,循环数为“iT,则二者与扩增倍数丁啲关系式可衣示为:y=(l+X)no扩增30个循环UPn=30时,若X=l00%,则y=23O=1073741824(>109);W若X=80%吋,则尸1.8叫45517159.601(f)。山此可见,其扩增的倍数是巨大的,将扩增产物进行电泳,经澳化乙锭染色,在紫外灶照射下(254nm)—般都可见到DNA的特异扩增区带。3.PCR反应基本步骤3.1变性(denaturation):通过加热使模板DNA的双链之间的氢键断裂,双链分开而成单链的过程(94°C,30s)。3.2退火(annealling):当温度降低时,引物与模板DN
4、A中互补区域结合成杂交分子(55°C,30s)o如下图所示引物13,—GAACTTT—5'5、GGATC1AGCGTATGCTTGAAA——3、3'CCTAGATCGCATACGAACTTT——5、模板DNA5'—GGATC1A—3'引物2PCR引物与模板结合示意图3.3延伸(extension):在DNA聚合酶、dNTPs、Mg2+存在下,DNA聚合酶催化引物按亍-3,方向延伸,合成出与模板DNA链互补的DNA子链(70〜72°C,30〜60s)。以上述三个步骤为一个循环,每一循环的产物均可作为下一个循环的模板,经过n次循环后,目的DNA以2n的形式增加。1.PCR扩增的基本方法4」PC
5、R反应体系成份终浓度10XbufferMgchPrinier(2个)dNTPs(4利i)BSATaq酶模板DNA纯水1/10体积1.5~2.5mmol/L各0.2Pmol/L各200umol/L100ug/mL1〜2.5单位/反应体系102〜105个分子(lOOng)补至所需体积(25〜50口1)4.2PCR反应的成分和作用总体积:一-般为25U1〜100U1(1)无Mg2buffer:山纯水、kcl、Tris纟II成。Tris用于调肖反应体系pH值,使Taq酶在偏碱性环境中反挥活性。kcl可降低退火温度,但不能超过50mmol/L,否则会抑制DNA聚合酶活性。(2)Mg2+:终浓度为1.
6、5〜2.0mmol/L,其对应dNTP为200umol/L,注意与dNTPs之间的浓度关系,曲于dNTP与Taq酶竟争Mg2+,当dNTP浓度达到1mmol/L时会抑制Taq酚的活性。Mg"能影响反应的特异性和产率。(3)BSA:一般用乙酰化的BSA,起着减少PCR管对Taq酶的吸附作用,对Taq酶有保护作用。(4)底物(dNTPs):dNTPs具有较强酸性,其储存液用NaOH调pH值至7.0〜7.5,—般存储浓度为10mmol/L,各成份以等当量配制,反应终浓度为20〜200umol/Lo浓度可加速反应,但同时増加错误掺入和实验成本;低浓度可提高精确性,而反应速度会降低。(5)Taq酶:
7、能耐95°C高温血不失活,其最适pH值为&3〜&5,最适温度为75〜80°C,一般用72aCo能催化以DNA单链为模板,以碱基互补原则为基础,按方向逐个将dNTP分子连接到引物的3,端,合成一条与模板DNA互补的新的DNA子链。无3—5,的外切酶活性,没有校正功能。某种dNTP或Mg2+浓度过高,会增加其错配率。用量一般为0.5〜5个单位/lOOu1(6)模板:PCR对模板DNA的纯度不要求很高,但应尽量不含有对PCR反
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