陕西商洛部分地区刺槐根瘤菌的遗传多样性和系统发育.pdf

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1、Onlinesystem：http：／／www．jabiotech．org农业生物技术学报JournalofAgriculturalBiotechn0logy2013，21(11)：1373～1383D0I：10．3969／i．issn．1674-7968．2013．11．015研究报告Letter陕西商洛部分地区刺槐根瘤菌的遗传多样性和系统发育冀玉良李堆淑赵龙飞韦革宏。i商洛学院生物医药工程系，商洛726000；2商丘师范学院生命科学学院，商丘476000；3西北农林科技大学生命科学学院，杨陵712100通讯作者，jy165@1

2、26．com摘要刺槐(RobiniapseudoacaciaL．)是豆科植物中常见的具有水土保持作用的先锋树种，对区域生态环境的维持发挥着重要作用。为了开发和利用刺槐根瘤菌，本研究采用16SrRNAPCR—RFLP和16SrRNA基因全序列分析方法，对商洛部分地区不同地理环境下的刺槐根瘤菌进行遗传多样性与系统发育研究。限制性片段长度多态性(RFLP)结果表明，来自6个采集地的68株供试菌株共有12种遗传图谱类型，不同采集地的菌株在多样性方面存在一定的差异：分离自山阳的刺槐根瘤菌同分离自其它地区的刺槐根瘤菌之间Jaccard相似性系

3、数较低；而来自商、J'I~D洛南的菌株遗传多样性较为丰富，Simpson指数分别为0．887和0．880，Shannon—Wiener指数分别为1．555和1．798。对每种图谱类型代表菌株进行16SrRNA全序列分析，结果表明，这些菌株归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)。研究结果显示，陕西商洛地区刺槐根瘤菌在不同地理环境下表现出一定的差异性，并且本区域的豆科植物刺槐在进化中主要选择与Mesorhizobium共生结瘤。本研究为商洛地区豆科植物根瘤菌系统发育地位的确定以及本地区根瘤菌资源的开发利用提供了基础资料。关

4、键词刺槐根瘤菌，16SrRNA基因PCR—RFLP，16SrRNA基因全序列，遗传多样性，系统发育GeneticDiversityandPhylogenyofRhizobiaIsolatedfromRobiniapseudoacaciainSeveralRegionsofShaanxiShangluoJIYu—LiangLIDui．ShuZHAOLong—FeiWEIGe—Hong1BiologicalandMedicalEngineeringDepartment，ShangluoUniversity,Shangluo726000

5、，China；2CollegeofLifeSciences，ShangqiuNormalUniversity,Shangqiu476000，China；3NorthwestAgricultureandForestryUniversity,CollegeofLifeSciences，Yangling712100，ChinaCorrespondingauthor,jy165@126．tomAbstractRobiniapseudoacaciaL．iSacommonleguminousplantandthepioneerspeciesf

6、orsoilandwaterconservation，whichplaysasignificantroleinthemaintenanceofregionalecologicalenvironment．TobetterunderstandthediversityandphylogenyofrhizobiacollectedfromnodulesofRobiniapseudoacaciaindiffer-entregionsofShaanxiShangluo．WeestimatedgeneticdiversityusingJ65MP

7、CR—RFLPandcompletese—quenceanalysisotl6srRNAgenesequencing．Restrictionfragmentlengthpolymorphism(RFLP)resultsshowedthattwelvegenotypesweretestedfrom68strainsofsixcollectionpointsandanddiferencesexistedindifferentstrains．TheJaccardsimilaritycoe伍cientbetweenthestrainsis

8、olatedfromShanyangandthoseisolatedfromotherregionswerelOWwhilethestrainsisolatedfromShangzhouandLuonanhadrichdiversity,withS