甘南牦牛GDF-10基因多态与生产性状的相关性分析.pdf

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1、中国农业科学2014，47(1)：161—169ScientiaAgriculturaSinicadoi：10．3864／j．issn．0578—1752．2014．01．017甘南牦牛GDF-10基因多态与生产性状的相关性分析李天科，梁春年，郎侠，裴杰，吴晓云，褚敏，秦文，阎萍(中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，兰州730050；。甘肃省牦牛繁育工程重点实验室，兰州730050)摘要：【目的】GDF-IO基因又称作骨形成蛋白3b，最早通过骨形成蛋白寡聚核苷酸序列的PCR扩增所得，与骨骼的形成和发育有关。很多研究已经表明GDF-10基因在骨骼的形态变化过程中发挥

2、着重要作用。本实验通过研究甘南牦牛GDF-10基因多态性与生产性状问的相关性，证明GDP一10基因与骨骼发育的相关性，发现与牦牛生产性状相关的分子标记，为加快牦牛选育进程，提高牦牛生产性能提供参考。【方法】以298头甘南牦牛血样为材料，随机选取其中的30个DNA样混合组成DNA池，设计9对弓l物对GDF-10基因外显子1，2和3进行扩增，扩增产物经琼脂糖凝胶回收后测序。运用BLAST和Chromas软件通过测序峰图找出突变位点，然后采用高分辨率熔解曲线分析技术(highresolutionme1tingcurve，HRM)进行基因型分型和统计等位基因频率。采用SH

3、EsiS和PHASE软件对GDF-10基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析，采用SPSS17．0进行基因多态位点与生产性状关联性分析。【结果】检测到甘南牦牛GDF一10基因外显子3的3个多态位点12116(G／A)、12152(C／T)、和13041(T／C)。群体遗传学分析显示，3个多态位点均表现为低度多态(PIC<0．25)；z检验表明牦牛群体在13041(T／C)位点未达到Hardy—weinberg平衡(尸<0．05)，其它两个多态位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(尸>0．05)；多态位点配对连锁不平衡分析发现，三个突变位点之间存在弱连锁

4、平衡；关联分析表明，甘南牦牛GDF-10基因不同突变位点的基因型与体斜长、体高、胸围、体重差异显著或极显著(尸<0．05或尸<0．001)，与管围差异不显著(P>0．05)；单倍型分析后在群体中发现了7种单倍型组合，其中ATC和ATT组合与牦牛的体尺性状和体重显著相关。【结论】甘南牦牛GDF-10基因3个多态位点和两个单倍型组合与牦牛的体高、体长、体重和胸围显著相关，可以尝试作为牦牛生产性状的候选分子标记，为牦牛遗传资源的保护、开发与新品种的选育提供科学依据。关键词：牦牛；GDF-10基因；多态性；高分辨率溶解曲线；单倍型；生产性状GDF一10GenePolymo

5、rphismandItsAssociationwithProductionTraitsjnGannanYakLITian．ke，一，LIANGChun．nian一，LANGXia，一，PEIJier一，、VUXiao—yun，一，CHUMin，一，QINWen．YANPing(ILanzhouInstituteofHusbandryandPharmaceuticalSciencesofChineseAcademyofAgriculturalSciencesLanzhou730050；2KeyLaboratoryofYakBreedingEngineering，La

6、nzhou73005D1Abstract：[Objective]Growthdifferentiationfactor-10(GDF一10)iSamemberoftheTGF—betasuperfamilyandthebonemorphogeneticproteinfamily(BMP)．ItisoriginallyidentifiedbyPCRusingdegenerateoligonucleotidesbasedontheBMP-3sequence．StudiessuggestedthattheGDF-IOgeneplaysakeyroleinskeletal

7、morphogenesis．TheobjectiveofthisstudywastoidentifythepolymorphismsofGDF一10geneandtheircorrelationwithproductiontraitswasinvestigatedforthepurposeofthebreedingofGannanyak．[MethodlThirtysampleswererandomlyselectedfromgenomicDNAof298GarmanyaktoconstructDNApoo1．Nineprimersweredesignedtoam

8、plify